玉米是世界三大作物之一,也是集糧、飼、經(jīng)“三元一體”的優(yōu)勢作物。玉米產(chǎn)量性狀由多基因控制,其遺傳機理十分復(fù)雜。目前,充分挖掘與產(chǎn)量性狀密切相關(guān)基因的優(yōu)異等位變異,并通過聚合育種方法將其迅速引入育種材料已成為提高玉米產(chǎn)量的一個重要切入點。TD1和FEA2是調(diào)控玉米花序發(fā)育的關(guān)鍵基因,與產(chǎn)量性狀的形成緊密相關(guān)。然而,對其在常用玉米自交系中的序列變異情況及其與產(chǎn)量性狀關(guān)聯(lián)的優(yōu)異變異位點卻少有報道。本研究以323份具有廣泛代表性的玉米自交系作為試驗群體,對基因TD1和FEA2進行了目標序列定點捕獲和重測序,分析目的基因的核苷酸多態(tài)性,進行變異位點的中性進化檢測和單倍型分析。在此基礎(chǔ)上,結(jié)合3個環(huán)境下測定的15個產(chǎn)量相關(guān)性狀數(shù)據(jù),采用候選基因關(guān)聯(lián)分析方法,挖掘與產(chǎn)量性狀顯著關(guān)聯(lián)的優(yōu)異等位變異位點。主要研究結(jié)果如下:1.對323份自交系的TD1與FEA2基因全長及其調(diào)控區(qū)序列進行定點捕獲和重測序,分別獲得了 4726 bp和4074 bp的核苷酸序列。對這兩個基因序列變異分析表明,在TD1基因及其啟動子區(qū)中共檢測到184個SNP和57個InDel,核苷酸多態(tài)性π值為0.0088;在FEA2基因及其... 

【文章來源】：揚州大學(xué)江蘇省

【文章頁數(shù)】：54 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３本研究采用的技術(shù)路線圖??Ｆｉｇ．３?Ｔｈｅ?ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ?ｒｏａｄｍａｐ?ｉｎ?ｔｈｉｓ?ｓｔｕｄｙ??

共獲得４７２６?ｂｐ的核苷酸序列。我們以１００?ｂｐ作為滑動框，選�。担�?ｂｐ為步長，分??析該基因核苷酸序列多態(tài)性。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，啟動子區(qū)域核苷酸多態(tài)性明顯的高于其他區(qū)段??（圖４），其中位于起始密碼子上游７６８?ｂｐ？５９６?ｂｐ處的核苷酸多態(tài)性ｔｔ值最高為０．０５１１，??這表明啟動子區(qū)域可能存在著較為豐富的變異。進一步研宄發(fā)現(xiàn)，在該基因位點中共檢??測到２４５個變異位點，其中１８４個為ＳＮＰ變異，５７個為ＩｎＤｅｌ變異（表１）。??ＡＴＧ??Ｉ??Ｐｒｏｍｏｔｅｒ?＾?Ｅｘｏｎ－１?Ｉ３?：?ｇ３?＊?＾??。．”?：�。�??０．０５?－?／??萬。０４?－?Ｉ??０．０３?１??－１２００?－６００?０?Ｓ００?１２００?１８００?２４００?３０００?３６００?ｂｐ??圖４?７Ｐ７基因序列核苷酸多樣性??Ｆｉｇ．４?Ｔｈｅ?ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ?ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ?ｅｓｔｉｍａｔｅｄ?ａｌｏｎｇ?ｔｈｅ?ＴＤ１?ｇｅｎｅ?ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ??本研究對７７）７基因５個區(qū)段（啟動子區(qū)、５＇非翻譯區(qū)、外顯子、內(nèi)含子、３’非翻譯區(qū)）??分析發(fā)現(xiàn)（表１），每個區(qū)段包含至少２個ＳＮＰ和ＩｎＤｅｌ變異位點。其中，啟動子區(qū)域的??ＳＮＰ變異頻率最高，平均每１５．６１?ｂｐ有一個ＳＮＰ變異，５’非翻譯區(qū)的ＩｎＤｅｌ變異頻率最高，??

本研宄對２０１５年至２０１７年在海南三亞和江蘇揚州種植的３２３份優(yōu)良玉米自交系的??１５個產(chǎn)量相關(guān)性狀進行了測定。為更加直觀反映不同環(huán)境下各性狀的變化趨勢，本研究??對三個環(huán)境下獲得的１５個表型性狀結(jié)果以Ｂｏｘｐｌｏｔ圖呈現(xiàn)（圖１０），其中，穗粗、穗行??數(shù)、粒長、粒寬和雄穗分枝數(shù)等性狀在三個環(huán)境下變化趨勢穩(wěn)定，如：穗行數(shù)在２０１５年??？２０１７年不同環(huán)境下均值分別為：１３．８３、１３．２０和１３．７９?；極值范圍分別為：７．６０？２１．００、??８．００？１９．１７和５．５０￣２２．００。然而，穗重、百粒重、株高和雄穗長等性狀則在三個環(huán)境下變??化幅度較大，其中在２０１７年揚州地區(qū)變化波動尤為明顯。如：穗重在２０１５？２０１７年不同??環(huán)境下均值分別為：６４．７２?ｇ、７６．８１?ｇ和８３．３０?ｇ；極值范圍分別為：１４６．６２?ｇ？１９．８５?ｇ、??１３６．４８?ｇ？２０．３ｌｇ?和?２０２．２２?ｇ？１７．８５?ｇ。??

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
[1]玉米LEAFY、RTCS和dbf1基因序列變異及其產(chǎn)量相關(guān)性狀關(guān)聯(lián)分析[D]. 張恩盈.揚州大學(xué) 2014

碩士論文
[1]玉米磷酸丙酮酸二激酶（PPDK）基因C4PPDKZm1啟動子區(qū)的單倍型分析[D]. 張延昭.揚州大學(xué) 2016



本文編號：3356021