17α-乙炔基雌二醇對黃顙魚稚魚性逆轉(zhuǎn)的誘導(dǎo)作用及關(guān)鍵基因篩選
發(fā)布時間:2021-08-20 00:30
魚類的性別決定和分化受到遺傳因素和環(huán)境因素的共同影響,環(huán)境中外源性類固醇激素往往可以徹底改變遺傳因素決定的性別分化方向。本研究分別以粉碎的黃顙魚飼料和鹵蟲作為激素載體,設(shè)置不同的EE2處理濃度,在稚魚生長的不同時期對其進(jìn)行處理,通過測定雌性率、性腺未發(fā)育個體占比以及成活率確定不同載體、不同生長時期和不同濃度處理對性別逆轉(zhuǎn)的作用;并通過測定全雄黃顙魚在處理后的增重率、特定生長率和肥滿度以確定EE2(17α-乙炔基雌二醇)處理對雄性黃顙魚稚魚生長的影響;由此綜合確定EE2處理黃顙魚稚魚性逆轉(zhuǎn)的適宜載體、適宜處理濃度和適宜處理時期。以鹵蟲為載體使用濃度為200 μg/L的EE2連續(xù)處理9 dah全雄黃顙魚40天,分別對處理0天、20天和40天的黃顙魚性腺組織中的轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析,并對處理0天、20天和40天時雄性黃顙魚性腺中Cyp11b2、Cyp19a1a和Cyp17a的表達(dá)量通過熒光定量PCR檢測,確定EE2誘導(dǎo)黃顙魚稚魚性逆轉(zhuǎn)過程中可能的關(guān)鍵基因,為進(jìn)一步研究黃顙魚性別決定和性別維持的分子機(jī)制提供理論依據(jù),為黃顙魚的遺傳育種提供理論和技術(shù)支持。結(jié)果如下:1.以飼料為載體的不同濃度...
【文章來源】:揚州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1魚性類固醇激素合成示意圖(Nagahama,?1997)??Fig.l?Schematic?representation?of?synthesis?of?sex?steroids?of?fish?(Nagahama,?1997)??1.5.2魚類性激素合成調(diào)控的重要基因??
圖3建庫測序流程圖??Fig.3?Experiment?pipeline?of?sequencing??生物信息分析流程??)轉(zhuǎn)錄組測序原始數(shù)據(jù)的統(tǒng)計與拼接??測序產(chǎn)生的原始數(shù)據(jù)(Raw?data)進(jìn)行預(yù)處理,通過cutadapt去除測序m過濾不合格的序列,得到有效數(shù)據(jù)(Cleandeta)。??本混合組裝的策略,將所有樣本最后進(jìn)行歸一化得到unigene?(unigen因進(jìn)行去冗余去重復(fù)后得到的唯一),作為后續(xù)分析的參考序列。進(jìn)行組裝質(zhì)量的評判,包括unigene的長度、GC含量和N50等。N50錄組拼接結(jié)果好壞的一個判斷標(biāo)準(zhǔn),將所有組裝出來的結(jié)果按照長度,當(dāng)達(dá)到總長度一半時的長度為N50。??基因功能注釋及分類??件DIAMOND對組裝完的unigenes添加相應(yīng)的功能注釋。數(shù)據(jù)庫來
揚州大學(xué)碩士論文。一般情況下,Q30大于80%就認(rèn)為是可靠的。本試驗所有樣品的Q200都大于95%,因此認(rèn)為本實驗測序結(jié)果可靠。GC含量平均值為48.63布,GC含量過高(大于80%)或過低(小于20%)的unigenes不存在,成情況良好,測序質(zhì)量較好。??OC?Content?DtftirK>uti〇n??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在水產(chǎn)動物研究中的運用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇. 水產(chǎn)學(xué)報. 2015(04)
[2]轉(zhuǎn)錄組與RNA-Seq技術(shù)[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀(jì)志賓,王建民. 生物技術(shù)通報. 2012(12)
[3]魚類性別決定與分化相關(guān)基因研究進(jìn)展[J]. 文愛韻,尤鋒,徐永立,張培軍. 海洋科學(xué). 2008(01)
[4]從XY雌魚雌核發(fā)育產(chǎn)生YY超雄黃顙魚[J]. 劉漢勤,崔書勤,侯昌春,徐江,陳宏溪. 水生生物學(xué)報. 2007(05)
[5]魚類免疫學(xué)研究進(jìn)展[J]. 唐玫,馬廣智,徐軍. 免疫學(xué)雜志. 2002(S1)
本文編號:3352443
【文章來源】:揚州大學(xué)江蘇省
【文章頁數(shù)】:80 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1魚性類固醇激素合成示意圖(Nagahama,?1997)??Fig.l?Schematic?representation?of?synthesis?of?sex?steroids?of?fish?(Nagahama,?1997)??1.5.2魚類性激素合成調(diào)控的重要基因??
圖3建庫測序流程圖??Fig.3?Experiment?pipeline?of?sequencing??生物信息分析流程??)轉(zhuǎn)錄組測序原始數(shù)據(jù)的統(tǒng)計與拼接??測序產(chǎn)生的原始數(shù)據(jù)(Raw?data)進(jìn)行預(yù)處理,通過cutadapt去除測序m過濾不合格的序列,得到有效數(shù)據(jù)(Cleandeta)。??本混合組裝的策略,將所有樣本最后進(jìn)行歸一化得到unigene?(unigen因進(jìn)行去冗余去重復(fù)后得到的唯一),作為后續(xù)分析的參考序列。進(jìn)行組裝質(zhì)量的評判,包括unigene的長度、GC含量和N50等。N50錄組拼接結(jié)果好壞的一個判斷標(biāo)準(zhǔn),將所有組裝出來的結(jié)果按照長度,當(dāng)達(dá)到總長度一半時的長度為N50。??基因功能注釋及分類??件DIAMOND對組裝完的unigenes添加相應(yīng)的功能注釋。數(shù)據(jù)庫來
揚州大學(xué)碩士論文。一般情況下,Q30大于80%就認(rèn)為是可靠的。本試驗所有樣品的Q200都大于95%,因此認(rèn)為本實驗測序結(jié)果可靠。GC含量平均值為48.63布,GC含量過高(大于80%)或過低(小于20%)的unigenes不存在,成情況良好,測序質(zhì)量較好。??OC?Content?DtftirK>uti〇n??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在水產(chǎn)動物研究中的運用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇. 水產(chǎn)學(xué)報. 2015(04)
[2]轉(zhuǎn)錄組與RNA-Seq技術(shù)[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀(jì)志賓,王建民. 生物技術(shù)通報. 2012(12)
[3]魚類性別決定與分化相關(guān)基因研究進(jìn)展[J]. 文愛韻,尤鋒,徐永立,張培軍. 海洋科學(xué). 2008(01)
[4]從XY雌魚雌核發(fā)育產(chǎn)生YY超雄黃顙魚[J]. 劉漢勤,崔書勤,侯昌春,徐江,陳宏溪. 水生生物學(xué)報. 2007(05)
[5]魚類免疫學(xué)研究進(jìn)展[J]. 唐玫,馬廣智,徐軍. 免疫學(xué)雜志. 2002(S1)
本文編號:3352443
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