蘋果6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶基因Md6PGDH6的功能鑒定
發(fā)布時間:2021-08-19 17:23
蘋果輪紋病是由葡萄座腔菌(Botryosphaeria dothidea,B.dothidea)引起的毀滅性病害,是一種嚴重影響蘋果產(chǎn)量和品質(zhì)的常見性病害。輪紋病病菌從皮孔侵入宿主,危害枝干、樹體和果實。危害樹體,削弱樹勢,嚴重時使樹體死亡;危害果實,影響外觀和品質(zhì),造成重大經(jīng)濟損失。因此,研究如何增強蘋果對輪紋病的抗病性具有重要意義。6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶(6-phosphogluconate dehydrogenase,6PGDH,EC1.1.1.44)是磷酸戊糖途徑(Pentose Phosphate Pathway,PPP)的限速酶和關(guān)鍵酶。6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶不僅能參與多種非生物脅迫,還能影響植物生長。葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(glucose-6-phosphate dehydrogenase,G6PDH/G6PD,EC 1.1.1.49)是磷酸戊糖途徑另一個限速酶。葡萄糖-6-磷酸脫氫酶產(chǎn)生的高還原力物質(zhì)還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸(NADPH)增強植物的抗病性。6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶也能產(chǎn)生NADPH,它在植物抗病性中的功能尚未見報道。本研究主要圍繞蘋果中的一個6-磷酸...
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
蘋果Md6PGDH6蛋白和擬南芥At6PGDH蛋白的系統(tǒng)進化樹分析
tic diagram of the conserved functional domain of Md6P萄糖酸脫氫酶基因 Md6PGDH6 的克隆酸葡萄糖酸脫氫酶基因的功能,先獲得he Apple Genome(https://iris.angers.in并依據(jù)該序列,利用 Primer Premier5.0 為克隆模板得到該目的基因。克隆得-4),與預(yù)測大小基本一致。測序結(jié)果顯含有一個 942 bp 的開放閱讀框,編碼//web.expasy.org/protparam/)預(yù)測該蛋白8,表明蘋果 Md6PGDH6 蛋白顯堿性。性蛋白。在其肽鏈氨基酸的組成上,其中rp(0.3%)含量最低,帶負電荷的殘基總數(shù)(Arg + Lys)27 個。
蘋果 6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶基因 Md6PGDH6 的功能鑒定089,是第 195 位的賴氨酸,該位點疏水性最強。 3-5)。線軟件分析表明,蘋果 Md6PGDH6 蛋白的二級結(jié)的延伸鏈、8.31%的 β-轉(zhuǎn)角和 32.59%的不規(guī)則卷曲構(gòu)看 α-螺旋和不規(guī)則卷曲是蘋果 Md6PGDH6 蛋和 β-轉(zhuǎn)角則相對分散于整條多肽鏈中。利用 .ac.uk/phyre2)預(yù)測了蘋果 Md6PGDH6 的三級結(jié)螺旋和不規(guī)則卷曲組成(圖 3-7)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]金針菇戊糖磷酸途徑的關(guān)鍵基因表達分析[J]. 張文靜,丑天勝,劉芳,吳安齊,謝寶貴,王威. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019(12)
[2]草菇6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶基因可變剪接體克隆與表達分析[J]. 陳志宏,傅梅萍,李遠峰,陶永新,江玉姬,謝寶貴. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報. 2014(04)
[3]正響應(yīng)鹽脅迫的甘蔗6-磷酸葡萄糖脫氫酶基因的克隆[J]. 楊玉婷,李國印,蘇亞春,郭晉隆,許莉萍. 福建農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2014(02)
[4]我國蘋果主要病害研究進展與病害防治中的問題[J]. 李保華,王彩霞,董向麗. 植物保護. 2013(05)
[5]黃瓜胞質(zhì)6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶基因克隆及序列分析[J]. 魏躍,王永平,李為觀,吳志明,張蜀寧,陳勁楓. 西北植物學(xué)報. 2009(10)
[6]中國蘋果枝干輪紋病發(fā)生和防治情況[J]. 國立耘,李金云,李保華,張新忠,周增強,李廣旭,王英姿,李曉軍,黃麗麗,孫廣宇,文耀東. 植物保護. 2009(04)
[7]高羊茅種子老化過程中酶活性的變化[J]. 韓建國,浦心春,毛培勝. 草地學(xué)報. 1998(02)
[8]磷酸葡萄糖脫氫酶和苯丙氨酸解氨酶與抗松針褐斑病的關(guān)系[J]. 葉建仁,黃素紅,李傳道,程淑婉. 林業(yè)科學(xué). 1994(05)
博士論文
[1]蘋果抗輪紋病種質(zhì)資源和基因篩選以及NO介導(dǎo)的防御響應(yīng)[D]. 劉志.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]水稻胞質(zhì)6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶基因的功能分析[D]. 丁林云.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號:3351825
【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
蘋果Md6PGDH6蛋白和擬南芥At6PGDH蛋白的系統(tǒng)進化樹分析
tic diagram of the conserved functional domain of Md6P萄糖酸脫氫酶基因 Md6PGDH6 的克隆酸葡萄糖酸脫氫酶基因的功能,先獲得he Apple Genome(https://iris.angers.in并依據(jù)該序列,利用 Primer Premier5.0 為克隆模板得到該目的基因。克隆得-4),與預(yù)測大小基本一致。測序結(jié)果顯含有一個 942 bp 的開放閱讀框,編碼//web.expasy.org/protparam/)預(yù)測該蛋白8,表明蘋果 Md6PGDH6 蛋白顯堿性。性蛋白。在其肽鏈氨基酸的組成上,其中rp(0.3%)含量最低,帶負電荷的殘基總數(shù)(Arg + Lys)27 個。
蘋果 6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶基因 Md6PGDH6 的功能鑒定089,是第 195 位的賴氨酸,該位點疏水性最強。 3-5)。線軟件分析表明,蘋果 Md6PGDH6 蛋白的二級結(jié)的延伸鏈、8.31%的 β-轉(zhuǎn)角和 32.59%的不規(guī)則卷曲構(gòu)看 α-螺旋和不規(guī)則卷曲是蘋果 Md6PGDH6 蛋和 β-轉(zhuǎn)角則相對分散于整條多肽鏈中。利用 .ac.uk/phyre2)預(yù)測了蘋果 Md6PGDH6 的三級結(jié)螺旋和不規(guī)則卷曲組成(圖 3-7)。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]金針菇戊糖磷酸途徑的關(guān)鍵基因表達分析[J]. 張文靜,丑天勝,劉芳,吳安齊,謝寶貴,王威. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2019(12)
[2]草菇6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶基因可變剪接體克隆與表達分析[J]. 陳志宏,傅梅萍,李遠峰,陶永新,江玉姬,謝寶貴. 應(yīng)用與環(huán)境生物學(xué)報. 2014(04)
[3]正響應(yīng)鹽脅迫的甘蔗6-磷酸葡萄糖脫氫酶基因的克隆[J]. 楊玉婷,李國印,蘇亞春,郭晉隆,許莉萍. 福建農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2014(02)
[4]我國蘋果主要病害研究進展與病害防治中的問題[J]. 李保華,王彩霞,董向麗. 植物保護. 2013(05)
[5]黃瓜胞質(zhì)6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶基因克隆及序列分析[J]. 魏躍,王永平,李為觀,吳志明,張蜀寧,陳勁楓. 西北植物學(xué)報. 2009(10)
[6]中國蘋果枝干輪紋病發(fā)生和防治情況[J]. 國立耘,李金云,李保華,張新忠,周增強,李廣旭,王英姿,李曉軍,黃麗麗,孫廣宇,文耀東. 植物保護. 2009(04)
[7]高羊茅種子老化過程中酶活性的變化[J]. 韓建國,浦心春,毛培勝. 草地學(xué)報. 1998(02)
[8]磷酸葡萄糖脫氫酶和苯丙氨酸解氨酶與抗松針褐斑病的關(guān)系[J]. 葉建仁,黃素紅,李傳道,程淑婉. 林業(yè)科學(xué). 1994(05)
博士論文
[1]蘋果抗輪紋病種質(zhì)資源和基因篩選以及NO介導(dǎo)的防御響應(yīng)[D]. 劉志.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
碩士論文
[1]水稻胞質(zhì)6-磷酸葡萄糖酸脫氫酶基因的功能分析[D]. 丁林云.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2007
本文編號:3351825
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