多浪羊是南疆特色地方品種,本研究以新疆喀什疏附其木布拉克多浪羊繁殖合作社多浪羊群體作為研究對(duì)象,采用第二代測(cè)序手段對(duì)多浪羊全基因組重測(cè)序,運(yùn)用生物信息統(tǒng)計(jì)學(xué)分析手段,得到與多浪羊繁殖性能相關(guān)的基因。對(duì)其中兩個(gè)與繁殖最為相關(guān)的基因進(jìn)行驗(yàn)證,分析其與多浪羊產(chǎn)羔數(shù)的相關(guān)性,旨在挖掘多浪羊繁殖性狀相關(guān)的候選基因并驗(yàn)證,為新疆地區(qū)特色品種多浪羊設(shè)計(jì)開發(fā)特有分子標(biāo)記,基于高密度分子標(biāo)記的輔助選擇奠定基礎(chǔ)。以下為研究結(jié)果:（1）利用Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)多浪羊多羔和單羔群體分別混池測(cè)序,在多羔群體中共找到13.8 M個(gè)SNP位點(diǎn),單羔群體中共找到13.6 M個(gè)SNP位點(diǎn),其中10.4M的SNPs為兩池共有。采用Fst檢驗(yàn)的顯著窗口與滑動(dòng)的窗口計(jì)算,雜合度顯著窗口計(jì)算分析受選擇區(qū)域,以及全基因組關(guān)聯(lián)分析FDR校正P值篩選顯著位點(diǎn),結(jié)合ENSEMBLE數(shù)據(jù)庫進(jìn)行基因注釋,David在線平臺(tái)進(jìn)行富集分析,總共得到6個(gè)基因與多浪羊繁殖性狀相關(guān),分別是NCOA1、INHBA、ING5、BMPR-IB、ARNT、KLHL1。（2）以NCOA1和INHBA基因?yàn)楹蜻x基因,采集168份多浪羊母羊血液,設(shè)計(jì)... 

【文章來源】：石河子大學(xué)新疆維吾爾自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

Illumina公司測(cè)序流程圖

廡蠆唄醞誥蚨嗬搜蚨嗵セ?蚣昂蜓』?蠐氬?崾?姆治?13圖2 核受體結(jié)構(gòu)示意圖DBD：DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域；LBD：配體結(jié)合結(jié)構(gòu)域；NLS：核定位信號(hào)胎。Fig.2 Dlagram of nulear receptor comstructionDBD:DNA binding domaln;LBD:Ligand binding domaing;NLS:Nucleus Localization sequence.4.3 核受體輔調(diào)節(jié)因子輔調(diào)節(jié)因子可在核受體參與基因的轉(zhuǎn)錄時(shí)，增強(qiáng)或者抑制調(diào)節(jié)，這種相互作用是轉(zhuǎn)錄過程更為精確、復(fù)雜和特異。根據(jù)其作用的不同，分為輔激活因子與輔抑制因子。NCOA1（SRC-1）是一類可以與激素結(jié)合的類固醇受體相互作用的輔調(diào)節(jié)因子，與SRC-2（NCOA2）、SRC-3（NCOA3）同屬p160蛋白超家族。這一類輔激活因子的中心互作部位由相同的模塊構(gòu)成：LXXLL（核受體盒）[64]。輔激活因子主要不同的輔激活因子都共同具有乙�；D(zhuǎn)移酶活性 ，可以特定刺激乙�；M蛋白并啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄。除了乙�；D(zhuǎn)移酶之外，在核受體輔激活因子中還含有TRAP/DRIP復(fù)合物、RNA輔激活因子SNA、基本轉(zhuǎn)錄原件TBP、TAF，ATP聯(lián)染色重建復(fù)合物SWU/SWF、蛋白質(zhì)甲基化酶CARM-1、泛素連接酶等[65]。核受體輔抑制因子在結(jié)構(gòu)機(jī)制上都與輔激活因子原理相近，核受體通過CoRNR盒介導(dǎo)與輔抑制因子相互作用

圖3 ER依賴性基因表達(dá)圖解模型Fig.3 Graphical model of ER dependent gene expression究結(jié)果說明，在輔激活單倍介導(dǎo)配體的過程中，許多的輔激，但是對(duì)不同的輔激活蛋白需求不同，在轉(zhuǎn)錄過程中，會(huì)存和過剩的情況。以有兩種不同的受體的表達(dá)，逆轉(zhuǎn)了受體轉(zhuǎn)錄的相互干擾域是可移動(dòng)的，可自由激活結(jié)構(gòu)域，從而提高該基因的表在反式激活中起獨(dú)立作用，大多數(shù)經(jīng)驗(yàn)證的多為AF-2依賴輔激活蛋白NCOA家族的某些配子的AF-2在依賴性蛋白與蛋。AF-2根據(jù)配子結(jié)構(gòu)不同而產(chǎn)生螺旋、折疊等不同的變化作用來影響轉(zhuǎn)錄。除此之外，為了使輔激活酶蛋白有效產(chǎn)生需要與其他在表面暴露的結(jié)構(gòu)域相互作用。很多研究證明，其他輔激活蛋白受體之間可以互相作用，在激活受體的過剩和選擇性激活[71]。動(dòng)物的核受體中環(huán)磷酸腺苷3’，5’-磷酸)、轉(zhuǎn)錄激活因子(STAT-1)、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)等不同功能需要不同

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