目的:探討類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎及骨關(guān)節(jié)炎中的共同關(guān)鍵基因及其功能意義。方法:通過GEO數(shù)據(jù)庫分析類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎及骨關(guān)節(jié)炎的差異基因,并使用DAVID數(shù)據(jù)庫對差異基因進(jìn)行通路富集分析和功能注釋,通過STRING數(shù)據(jù)庫構(gòu)建差異基因的蛋白-蛋白相互作用（PPI）網(wǎng)絡(luò),并下載結(jié)果進(jìn)一步分析。結(jié)果:GEO數(shù)據(jù)庫分析表達(dá)譜數(shù)據(jù)集GSE55235和GSE55457共得到112個(gè)差異基因,DAVID數(shù)據(jù)庫富集分析表明,這些差異基因主要富集在免疫應(yīng)答、整合在質(zhì)膜、DNA序列特異性結(jié)合以及IgA生成的腸道免疫網(wǎng)絡(luò)。STRING數(shù)據(jù)庫分析顯示,共有72個(gè)基因存在于PPI網(wǎng)絡(luò)中,而JUN、MYC、VEGFA、ATF3、CD19、EGR1、CXCL10、TLR7、TLR8和NR4A1為網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵基因。結(jié)論:JUN、MYC、VEGFA、ATF3、CD19、EGR1、CXCL10、TLR7、TLR8和NR4A1在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎及骨關(guān)節(jié)炎中表達(dá)失調(diào),有望成為類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎及骨關(guān)節(jié)炎的生物標(biāo)志物及治療靶點(diǎn)。 

【文章來源】：風(fēng)濕病與關(guān)節(jié)炎. 2020,9(10)

【文章頁數(shù)】：6 頁

【部分圖文】：

差異基因的篩選

差異基因的GO和KEGG通路富集分析

差異基因PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建及模塊分析


本文編號：3285585