大白菜雄性不育相關(guān)基因的克隆和表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-12 15:52
雄性不育突變體是研究植物雄配子發(fā)育調(diào)控機(jī)制的寶貴試材。在前期研究中,本實(shí)驗(yàn)室對(duì)大白菜雄性不育甲型兩用系‘AB01’的不育株和可育株花蕾分別進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,鑒別出系列差異表達(dá)基因,其中Bra036581和Bra040503在可育株花蕾正常表達(dá),而在不育株花蕾中無(wú)表達(dá)信號(hào),暗示以上2個(gè)基因在大白菜雄蕊發(fā)育中可能行使一定的功能。本文進(jìn)一步克隆了Bra036581和Bra040503的全長(zhǎng)序列,明確其表達(dá)模式,為后期功能鑒定奠定基礎(chǔ)。主要研究結(jié)果如下:1.克隆了Bra036581和Bra040503的全長(zhǎng)DNA和cDNA序列。序列研究發(fā)現(xiàn),Bra036581和Bra040503功能未知。Bra036581無(wú)內(nèi)含子,CDS全長(zhǎng)237bp,所翻譯蛋白含有78個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)為分泌蛋白,蛋白質(zhì)相對(duì)質(zhì)量8.27KD,等電點(diǎn)為7.45,信號(hào)肽酶切位點(diǎn)位于第24個(gè)氨基酸處;Bra040503同樣不包含內(nèi)含子,CDS全長(zhǎng)384bp,編碼蛋白含有128個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)為分泌蛋白,蛋白質(zhì)相對(duì)質(zhì)量14.31KD,等電點(diǎn)為9.70,信號(hào)肽酶切位點(diǎn)位于第23個(gè)氨基酸處。2.選取‘AB01’不育株和可育株的不同組織和花器官...
【文章來(lái)源】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Bra036581和Bra040503基因的結(jié)構(gòu)分析
圖 2-3 兩個(gè)目的基因 DNA 和 cDNA 的擴(kuò)增條帶2-3 The amplified bands of two target genes DNA and cDNADL237Marker;1-2:Bra036581 的 DNA 和 cDNA 的擴(kuò)增DL387Marker;3-4:Bra040503 的 DNA 和 cDNA 的擴(kuò)增DL387Marker;1-2:The amplified bands of DNA and cDNDL387Marker;3-4:The amplified bands of DNA and cD析質(zhì)的分析 ProtParam 軟件分析蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)得到,Br為 C341H566N96O111S15,相對(duì)分子質(zhì)量為 8.27KD6 個(gè)氨基酸 Asp 和 Glu 帶有正電荷,7 個(gè)氨基酸 A出酸性氨基酸個(gè)數(shù)少于堿性氨基酸的個(gè)數(shù),所以穩(wěn)定系數(shù)為 80.31,脂肪系數(shù)為 58.85,親水性平不穩(wěn)定的親水蛋白。通過(guò) ProtScal(ehttps://web.e36581 蛋白的疏水性質(zhì),由圖分析可知,組成 Bra的 56.4%,疏水氨基酸為 43.6%,疏水氨基酸區(qū)
圖 2-4 Bra036581 蛋白的親水性預(yù)測(cè)Fig. 2-4 Hydrophilic prediction of the Bra036581 protein.503 共有 128 個(gè)氨基酸組成,分子式為 C641H1074N174O189S2,相對(duì)分子論等電點(diǎn)(pI)為 9.70。該蛋白有 17 個(gè)氨基酸 Asp 和 Glu 帶有正電rg 和 Lys 帶有負(fù)電荷,由此數(shù)據(jù)可以看出酸性氨基酸個(gè)數(shù)比堿性氨基所以推斷 Bra040503 蛋白呈堿性。該蛋白不穩(wěn)定系數(shù)為 18.74,脂肪性平均值為-0.536,由此可以推斷該蛋白為穩(wěn)定的親水蛋白。通過(guò) Prb.expasy.org/protscale/)在線(xiàn)工具分析 Bra040503 蛋白的疏水性質(zhì),由ra040503 蛋白質(zhì)中親水氨基酸占總氨基酸的 65.1%,疏水氨基酸為 34區(qū)域較小于親水氨基酸,從而進(jìn)一步說(shuō)明了該蛋白為親水蛋白,與 Pro結(jié)果一致,如圖 2-5:
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]花生AhDGAT1基因啟動(dòng)子的克隆與功能驗(yàn)證[J]. 張會(huì),鄭玲,萬(wàn)書(shū)波,李新國(guó),郭峰,單雷,高文偉,彭振英. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(07)
[2]植物細(xì)胞核雄性不育基因研究進(jìn)展[J]. 楊莉芳,刁現(xiàn)民. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(06)
[3]真核生物RNA聚合酶Ⅱ核心啟動(dòng)子[J]. 于福先,朱志偉,陳曉宇,潘建治. 生命的化學(xué). 2011(06)
[4]馬鈴薯塊莖組織特異性啟動(dòng)子的克隆及序列分析[J]. 陳國(guó)梁,陳宗禮,賀曉龍,羅茜. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(07)
[5]大白菜果膠甲酯酶基因BrPME1的克隆及特征分析[J]. 劉志勇,李承彧,葉雪凌,王曉霞,馮輝. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(02)
[6]大白菜雄性不育類(lèi)型及應(yīng)用現(xiàn)狀[J]. 呂艷玲,吳海東,王鑫,王寧. 長(zhǎng)江蔬菜. 2009(24)
[7]青梗菜核基因雄性不育系的轉(zhuǎn)育[J]. 辛彬,馮輝,楊曉飛,王玉剛. 中國(guó)蔬菜. 2009(14)
[8]大白菜細(xì)胞核顯性雄性不育基因連鎖標(biāo)記的篩選[J]. 張淑江,李菲,韓和平,章時(shí)蕃,鈕心恪,孫日飛. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(08)
[9]白菜雄性不育相關(guān)新基因BcMF1的分離及特征分析[J]. 王華新,王永勤,曹家樹(shù),向珣,余小林,葉紈芝. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(04)
[10]大白菜新型細(xì)胞質(zhì)雄性不育生理生化機(jī)制的研究[J]. 張鳳蘭,馮忠梅,張德雙,于賢昌. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2007(05)
博士論文
[1]逆境脅迫下小麥脫水蛋白wzy1-2、wzy2基因及啟動(dòng)子的功能研究[D]. 朱維寧.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[2]硫化葉菌啟動(dòng)子Initiator元件功能研究[D]. 敖翔.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]白菜雄性不育相關(guān)基因CYP86MF的功能驗(yàn)證及其人工不育系的創(chuàng)建[D]. 余小林.浙江大學(xué) 2002
碩士論文
[1]芥菜開(kāi)花整合子SOC1的啟動(dòng)子克隆及其與FLC、SVP蛋白相互作用[D]. 趙夏云.西南大學(xué) 2015
[2]BACE1基因啟動(dòng)子核心區(qū)域的研究[D]. 相燕.重慶醫(yī)科大學(xué) 2014
[3]甘藍(lán)型油菜細(xì)胞核雄性不育的基因表達(dá)研究[D]. 賀華良.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號(hào):3280207
【文章來(lái)源】:沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁(yè)數(shù)】:60 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
Bra036581和Bra040503基因的結(jié)構(gòu)分析
圖 2-3 兩個(gè)目的基因 DNA 和 cDNA 的擴(kuò)增條帶2-3 The amplified bands of two target genes DNA and cDNADL237Marker;1-2:Bra036581 的 DNA 和 cDNA 的擴(kuò)增DL387Marker;3-4:Bra040503 的 DNA 和 cDNA 的擴(kuò)增DL387Marker;1-2:The amplified bands of DNA and cDNDL387Marker;3-4:The amplified bands of DNA and cD析質(zhì)的分析 ProtParam 軟件分析蛋白質(zhì)的理化性質(zhì)得到,Br為 C341H566N96O111S15,相對(duì)分子質(zhì)量為 8.27KD6 個(gè)氨基酸 Asp 和 Glu 帶有正電荷,7 個(gè)氨基酸 A出酸性氨基酸個(gè)數(shù)少于堿性氨基酸的個(gè)數(shù),所以穩(wěn)定系數(shù)為 80.31,脂肪系數(shù)為 58.85,親水性平不穩(wěn)定的親水蛋白。通過(guò) ProtScal(ehttps://web.e36581 蛋白的疏水性質(zhì),由圖分析可知,組成 Bra的 56.4%,疏水氨基酸為 43.6%,疏水氨基酸區(qū)
圖 2-4 Bra036581 蛋白的親水性預(yù)測(cè)Fig. 2-4 Hydrophilic prediction of the Bra036581 protein.503 共有 128 個(gè)氨基酸組成,分子式為 C641H1074N174O189S2,相對(duì)分子論等電點(diǎn)(pI)為 9.70。該蛋白有 17 個(gè)氨基酸 Asp 和 Glu 帶有正電rg 和 Lys 帶有負(fù)電荷,由此數(shù)據(jù)可以看出酸性氨基酸個(gè)數(shù)比堿性氨基所以推斷 Bra040503 蛋白呈堿性。該蛋白不穩(wěn)定系數(shù)為 18.74,脂肪性平均值為-0.536,由此可以推斷該蛋白為穩(wěn)定的親水蛋白。通過(guò) Prb.expasy.org/protscale/)在線(xiàn)工具分析 Bra040503 蛋白的疏水性質(zhì),由ra040503 蛋白質(zhì)中親水氨基酸占總氨基酸的 65.1%,疏水氨基酸為 34區(qū)域較小于親水氨基酸,從而進(jìn)一步說(shuō)明了該蛋白為親水蛋白,與 Pro結(jié)果一致,如圖 2-5:
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]花生AhDGAT1基因啟動(dòng)子的克隆與功能驗(yàn)證[J]. 張會(huì),鄭玲,萬(wàn)書(shū)波,李新國(guó),郭峰,單雷,高文偉,彭振英. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(07)
[2]植物細(xì)胞核雄性不育基因研究進(jìn)展[J]. 楊莉芳,刁現(xiàn)民. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2013(06)
[3]真核生物RNA聚合酶Ⅱ核心啟動(dòng)子[J]. 于福先,朱志偉,陳曉宇,潘建治. 生命的化學(xué). 2011(06)
[4]馬鈴薯塊莖組織特異性啟動(dòng)子的克隆及序列分析[J]. 陳國(guó)梁,陳宗禮,賀曉龍,羅茜. 生物技術(shù)通報(bào). 2011(07)
[5]大白菜果膠甲酯酶基因BrPME1的克隆及特征分析[J]. 劉志勇,李承彧,葉雪凌,王曉霞,馮輝. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2011(02)
[6]大白菜雄性不育類(lèi)型及應(yīng)用現(xiàn)狀[J]. 呂艷玲,吳海東,王鑫,王寧. 長(zhǎng)江蔬菜. 2009(24)
[7]青梗菜核基因雄性不育系的轉(zhuǎn)育[J]. 辛彬,馮輝,楊曉飛,王玉剛. 中國(guó)蔬菜. 2009(14)
[8]大白菜細(xì)胞核顯性雄性不育基因連鎖標(biāo)記的篩選[J]. 張淑江,李菲,韓和平,章時(shí)蕃,鈕心恪,孫日飛. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(08)
[9]白菜雄性不育相關(guān)新基因BcMF1的分離及特征分析[J]. 王華新,王永勤,曹家樹(shù),向珣,余小林,葉紈芝. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(04)
[10]大白菜新型細(xì)胞質(zhì)雄性不育生理生化機(jī)制的研究[J]. 張鳳蘭,馮忠梅,張德雙,于賢昌. 華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2007(05)
博士論文
[1]逆境脅迫下小麥脫水蛋白wzy1-2、wzy2基因及啟動(dòng)子的功能研究[D]. 朱維寧.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2014
[2]硫化葉菌啟動(dòng)子Initiator元件功能研究[D]. 敖翔.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]白菜雄性不育相關(guān)基因CYP86MF的功能驗(yàn)證及其人工不育系的創(chuàng)建[D]. 余小林.浙江大學(xué) 2002
碩士論文
[1]芥菜開(kāi)花整合子SOC1的啟動(dòng)子克隆及其與FLC、SVP蛋白相互作用[D]. 趙夏云.西南大學(xué) 2015
[2]BACE1基因啟動(dòng)子核心區(qū)域的研究[D]. 相燕.重慶醫(yī)科大學(xué) 2014
[3]甘藍(lán)型油菜細(xì)胞核雄性不育的基因表達(dá)研究[D]. 賀華良.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003
本文編號(hào):3280207
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