紅肉火龍果TST基因家族的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-07-11 12:25
為分離參與紅肉火龍果果實(shí)可溶性糖積累的功能基因,基于轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)克隆液泡糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白(Tonoplast sugar transporter,TST)基因家族,進(jìn)行序列同源性、跨膜結(jié)構(gòu)、亞細(xì)胞定位和系統(tǒng)發(fā)育等生物信息學(xué)分析。結(jié)果表明:紅肉火龍果含有4個(gè)TST基因,開放讀碼框(open reading frame,ORF)長度為2 127~2 235bp,編碼長度為708~744個(gè)氨基酸的序列。預(yù)測等電點(diǎn)為4.84~5.36,相對分子量為75.7~80.4kDa;紅肉火龍果TST家族氨基酸序列與甜菜和藜麥TST家族具有74.9%~83.4%的相似性;紅肉火龍果TST成員均含11~12個(gè)跨膜結(jié)構(gòu)域,定位于質(zhì)體、葉綠體、液泡或內(nèi)質(zhì)網(wǎng)等細(xì)胞器。系統(tǒng)進(jìn)化分析表明HpTST1屬于TST1類,HpTST2.1和HpTST2.2屬于TST2類,HpTST3屬于TST3類。
【文章來源】:貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(07)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
TST基因家族的系統(tǒng)發(fā)育樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]園藝作物果實(shí)液泡糖、酸轉(zhuǎn)運(yùn)與轉(zhuǎn)化研究進(jìn)展[J]. 張紹鈴,賈璐婷,王利斌,張臻. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]紅肉火龍果(Hylocereus polyrhizus)果實(shí)與莖轉(zhuǎn)錄組測序分析[J]. 鄭乾明,王壯,蔡永強(qiáng),馬玉華. 分子植物育種. 2019(01)
[3]蘋果糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白TMT基因的表達(dá)及其與糖積累的關(guān)系[J]. 馬新立,秦源,魏曉鈺,馬鋒旺,李明軍. 園藝學(xué)報(bào). 2014(07)
本文編號:3278092
【文章來源】:貴州農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(07)
【文章頁數(shù)】:4 頁
【部分圖文】:
TST基因家族的系統(tǒng)發(fā)育樹
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]園藝作物果實(shí)液泡糖、酸轉(zhuǎn)運(yùn)與轉(zhuǎn)化研究進(jìn)展[J]. 張紹鈴,賈璐婷,王利斌,張臻. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]紅肉火龍果(Hylocereus polyrhizus)果實(shí)與莖轉(zhuǎn)錄組測序分析[J]. 鄭乾明,王壯,蔡永強(qiáng),馬玉華. 分子植物育種. 2019(01)
[3]蘋果糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白TMT基因的表達(dá)及其與糖積累的關(guān)系[J]. 馬新立,秦源,魏曉鈺,馬鋒旺,李明軍. 園藝學(xué)報(bào). 2014(07)
本文編號:3278092
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