該研究采用高通量測序技術(shù)Illumina HiSeq 2000,對小花草玉梅花器官進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序,挖掘參與其花發(fā)育相關(guān)的基因。測序結(jié)果得到54 513 822個(gè)序列讀取片段（reads）,包含7 826 726 115bp的堿基序列信息。將測序數(shù)據(jù)進(jìn)行序列組裝后,獲得43 767個(gè)單基因簇（unigenes）,平均長度為926bp。轉(zhuǎn)錄物注釋結(jié)果顯示,28 130條unigenes有同源比對信息。在43 767條unigenes中檢測到5 015個(gè)SSR位點(diǎn),且SSR不同重復(fù)基序類型中,出現(xiàn)頻率最高的是AG/CT,其次是AAG/CTT和ACC/GGT。通過轉(zhuǎn)錄因子分析,進(jìn)一步篩選得到了12個(gè)與花發(fā)育緊密相關(guān)的MADS基因,分別為FUL1,FUL2,AP3-1,AP3-2,AP3-3,PI1,PI2,AG1,AG2,SEP1,SEP3和AGL6。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,與小花草玉梅正常花相比,全白、綠白相間、五瓣變異、全綠變異花中的FUL1、SEP1,SEP3和AGL6基因均顯著上調(diào)表達(dá),而12個(gè)基因在極端變異花中的表達(dá)水平與正�；ǖ牟町惥幻黠@。定量結(jié)果經(jīng)主成分分析顯示,AGL6、... 

【文章來源】：西北植物學(xué)報(bào). 2018,38(08)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

圖１小花草玉梅正常花（Ａ）和變異花（Ｂ～Ｆ）的形態(tài)Ｆｉｇ．１Ｍｏｒｐｈｏｌｏｇｙｏｆｎｏｒｍａｌ（Ａ）ａｎｄｖａｒｉａｎｔｆｌｏｗｅｒｓ

３．４５％，累計(jì)方差貢獻(xiàn)率達(dá)８８．６１％，涵蓋了大部分信息。由主成分的初始因子載荷矩陣（表３）可以看出，ＡＧＬ６、ＳＥＰ３、ＦＵＬ１、ＰＩ２及ＳＥＰ１的表達(dá)量與第１主成分呈顯著正相關(guān)，ＡＧ２、ＡＰ３－１、ＡＧ１、ＡＰ３－３、ＰＩ１的表達(dá)量與第２主成分呈顯著正相關(guān)。主成分分析表明，與第１主成分呈顯著正相關(guān)的指標(biāo)，即ＡＧＬ６、ＳＥＰ３、ＦＵＬ１、ＰＩ２及ＳＥＰ１的表達(dá)量均可作為小花草玉梅花形態(tài)發(fā)育的主要指標(biāo)。圖３是小花草玉梅的１２個(gè)花發(fā)育ＭＡＤＳ基因的表達(dá)量經(jīng)主成分分析后的前３個(gè)主成分構(gòu)建的三維空間。分析的樣本有６個(gè)，分別為小花草玉梅正�；ê停捣N變異花。具有不同花形態(tài)的小花草玉梅分布在三維空間中不同的位置。６個(gè)樣品表型不同，各自起主要調(diào)控作用的基因也不相同，因此它們位于空間中的不同位置。圖３不同形態(tài)的小花草玉梅在ＭＡＤＳ基因三維空間中的分布位置Ｆｉｇ．３Ａ．ｒｉｖｕｌａｒｉｓｖａｒ．ｆｌｏｒｅ－ｍｉｎｏｒｅｓｐｅｃｉｅｓｐｌａｃｅｄｉｎ３ＤｓｐａｃｅｏｆＭＡＤＳｇｅｎｅ圖２１２個(gè)ＭＩＫＣ型ＭＡＤＳ－ｂｏｘ基因在小花草玉梅正�；ê妥儺惢ㄖ械南鄬Ρ磉_(dá)量Ｆｉｇ．２Ｒｅｌａｔｉｖｅｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｌｅｖｅｌｏｆ１２ＭＩＫＣ－ｔｙｐｅＭＡＤＳｇｅｎｅｓｉｎｎｏｒｍａｌａｎｄｖａｒｉａｎｔｆｌｏｗｅｒｓｉｎＡ．ｒｉｖｕｌａｒｉｓｖａｒ．ｆｌｏｒｅ－ｍｉｎｏｒｅ４１０４西北植物學(xué)報(bào)３８卷

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]薏苡幼苗葉片轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 黃玉蘭,殷奎德,向君亮.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2017(03)
[2]小花草玉梅花器官變異多樣性機(jī)制初步研究[J]. 王超,戎利勤,馮璐杰,劉虎岐.  園藝學(xué)報(bào). 2017(01)
[3]基于高通量測序半夏珠芽轉(zhuǎn)錄組研究[J]. 葉德,楊支力,李東海,徐濤.  浙江理工大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(02)
[4]梁山慈竹高通量轉(zhuǎn)錄組測序及差異表達(dá)基因分析[J]. 王身昌,胡尚連,曹穎,徐剛.  華北農(nóng)學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]小花草玉梅正常和自然變異植株的AP3-3基因研究[J]. 張婷,邢妮,王超,劉虎岐.  西北植物學(xué)報(bào). 2016(02)
[6]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒.  遺傳. 2011(11)
[7]小花草玉梅變態(tài)花萼片的形態(tài)學(xué)研究[J]. 常鴻莉,任毅,馮魯田.  植物分類學(xué)報(bào). 2005(03)
[8]中國植物發(fā)育生物學(xué)若干重要領(lǐng)域的研究回顧(英文)[J]. 許智宏,種康.  Acta Botanica Sinica. 2002(09)
[9]小花草玉梅變態(tài)花的形態(tài)學(xué)研究——I.變態(tài)花的形態(tài)學(xué)觀察[J]. 劉宏頎,狄維忠.  西北植物學(xué)報(bào). 1991(04)

博士論文
[1]毛茛科花形態(tài)發(fā)生和花變態(tài)及其系統(tǒng)學(xué)意義[D]. 常鴻莉.西北大學(xué) 2005



本文編號：3275185