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過(guò)表達(dá)細(xì)葉百合LpNAC5和LpNAC13轉(zhuǎn)基因煙草的抗逆性研究

發(fā)布時(shí)間:2021-07-09 02:57
  細(xì)葉百合(Lilium pumilum)花色鮮紅,耐鹽堿,抗寒性強(qiáng),是百合抗性育種的重要親本。本研究以細(xì)葉百合LpNAC5和LpNAC13為研究對(duì)象,對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,同時(shí),利用熒光定量PCR分析2個(gè)基因的時(shí)空表達(dá)特性及非生物脅迫下基因表達(dá)模式,比較過(guò)表達(dá)LpNAC5和LpNAC13轉(zhuǎn)基因煙草與野生型煙草在干旱、鹽和堿脅迫下的生理特性差異,從而探索2個(gè)NAC基因在非生物脅迫下的功能.主要研究成果如下:1.生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,LpNAC5和LpNACl3基因ORF區(qū)核酸編碼的蛋白屬于NAC家族,分別編碼181和208個(gè)氨基酸,蛋白為無(wú)跨膜結(jié)構(gòu)域的親水性蛋白,N-末端有保守DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域,被分為5個(gè)亞結(jié)構(gòu)域(A~E)。序列同源性分析表明LpNAC5和LpNAC13編碼蛋白與藍(lán)花耬斗菜(Aquilegia coerulea)和海棗(Phoenix dactyliera)的同源性最高.系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析表明,LpNAC5和LpNAC13與擬南芥NAC083在同一枝進(jìn)化樹(shù)上,屬于SENU5亞族。2.熒光定量分析LpNAC5和LpNAC13基因組織特異性結(jié)果表明,2個(gè)基因在各個(gè)組織中均有表... 

【文章來(lái)源】:東北林業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:93 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

過(guò)表達(dá)細(xì)葉百合LpNAC5和LpNAC13轉(zhuǎn)基因煙草的抗逆性研究


圖2-4細(xì)葉百合(A)、(B)蛋白氨基酸序列與擬南芥氨基酸序列的系??統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)??

百合,結(jié)構(gòu)域,基因,氨基酸


COOs?:?ANAC001?? ̄ri?.?-?AHACC-C?!??^1?I?似0005?丨?ANACOtn???KAC?知??ANACOM????M|?UAC075?I??^0044?i??I?liACOSS?!?ONACO03????MJ?NAC075??3J??AflACC-VJ?i?1W??I?'?NAC099?:?ONACOOB???AHACC73?丨?sTj?|?ANACOlO?;??eel?ANAC073?!??圖2-4細(xì)葉百合(A)、(B)蛋白氨基酸序列與擬南芥氨基酸序列的系??統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)??Fig.2-4?Phylogenetic?tree?of?amino?sequences?of?LpNAC5?(A)N?LpNAC13?(B)?and?Arabidopsis??amino?acid?sequences??2.3_1.4保守結(jié)構(gòu)域分析??Conserved?Domains保守區(qū)預(yù)測(cè)分析表明IpAMCJ基因在13-37氨基酸處存??高度保守的NAM域;基因在16-127氨基酸處存在一個(gè)高度保守的??NAM域,均屬于NAC基因家族(圖2-5)。??)??5?7S?l?*?i26?17S?181??t?t?I???I?f?i?i?t?:?f?t?i?t?i?I?i?i?■?i?3?f?:?i?t?I?*?i??Query?seq.?A??5?>ecific?hits??Super?Fanil?ies?丨?NfVI?s^rfawiiy?|??Search?for?sinv,5af?dofnain?a;chi;ech.t

蛋白,信號(hào)肽,疏水性,蛋白質(zhì)


?2細(xì)葉百合LpAUC5和LpAUCVj基因生物信息學(xué)分析及其表達(dá)模式分杉f???精氨酸含量最高,占10.6?%,其次為絲氨酸9.1?%和亮胺酸8.2?%。??(2)蛋白質(zhì)親/疏水性預(yù)測(cè)??利用Protscale軟件預(yù)測(cè)LpM4C5和基因編碼蛋白親/疏水性,結(jié)果??表明,基因(圖2-6A)在第】17位氨基酸殘基處具有最強(qiáng)親水性,最低??值為-2.544,在100位氨基酸殘基處具有最強(qiáng)疏水性,最高值為1.444,位于親水??區(qū)的蛋白占絕大多數(shù),表明LpA^C’5蛋白為親水蛋白,與其預(yù)測(cè)為親水蛋白相??合。??基因(圖2-6B)在第134位氨基酸殘基處具有最強(qiáng)親水性,最低??值為-2.533,在46位氨基酸殘基處具有最強(qiáng)疏水性,最高值為1.667,位于親水??區(qū)的蛋白占絕大多數(shù),表明以從4£7_5蛋白為親水蛋白,與其預(yù)測(cè)為親水蛋白相??合.??^?ProtScale?output?for?user?sequence?g?ProtScale?output?for?uoer?sequence??1.5? ̄'?7.?'?HphoJ^?/Kyte?G?Dcwlittie???^?'?Hphob?/Kyte?&?bcxJIttle?— ̄??。.:、?s?l?:?;::?A?,丨f、:????oi.yi?Lf、丨,[丨i?…。丨丨卜、ii???\j\?|?v??1?1?ylf。?,??^?iirlJ?ij?ir??'??-I?w?/?y?\i^?,::1?f'?f?F|!?:.?Jj?:??f?:?r?f???3????'?????????■????-3??■?'?1????20?40

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[7]百合轉(zhuǎn)P5CS-F129A基因的遺傳穩(wěn)定性和耐旱性檢測(cè)[J]. 閆笑,魏遲,張冬梅,賈桂霞.  北京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(02)
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博士論文
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碩士論文
[1]細(xì)葉百合LpNAC6和LpNAC20基因的克隆及其在煙草中的抗鹽功能分析[D]. 曹尚杰.東北林業(yè)大學(xué) 2019
[2]細(xì)葉百合LpWRKY20基因的克隆及其對(duì)煙草的遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 楊柳慧.東北林業(yè)大學(xué) 2019
[3]細(xì)葉百合3個(gè)NAC轉(zhuǎn)錄因子的克隆及其對(duì)煙草的遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 關(guān)春景.東北林業(yè)大學(xué) 2018
[4]LcGR基因在煙草中的功能驗(yàn)證以及在百合抗重金屬中的應(yīng)用[D]. 安婷.天津大學(xué) 2018
[5]岷江百合LrABCF1基因的克隆及功能驗(yàn)證[D]. 李紹華.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
[6]轉(zhuǎn)APX基因仙客來(lái)植株的獲得及轉(zhuǎn)S6PDH基因百合的耐旱性研究[D]. 朱艷玲.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2009
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[8]麝香百合和仙客來(lái)轉(zhuǎn)Mn-SOD基因植株的獲得及其耐熱性鑒定[D]. 陳莉.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2007
[9]中國(guó)野生百合資源調(diào)查及遺傳多樣性分析[D]. 王潔瓊.北京林業(yè)大學(xué) 2006



本文編號(hào):3272871

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