中國五個地區(qū)獻血人群HCV基因型/亞型分布及進化分析
發(fā)布時間:2021-07-06 00:23
目的研究國內(nèi)五個地區(qū)血液中心獻血人群中HCV基因型/亞型分布及不同基因型HCV的群體遺傳學特征。方法收集來自重慶、烏魯木齊、洛陽、綿陽和廣西無償獻血人群的抗-HCV確證實驗陽性的血漿標本802(人)份,并統(tǒng)計出獻血人群的性別、年齡、民族和職業(yè)等人口統(tǒng)計學信息;采用逆轉(zhuǎn)錄巢式PCR對HCV core基因片段擴增并測序:應(yīng)用MEGA 6.0軟件構(gòu)建HCV分子進化樹并對其做基因分型和系統(tǒng)發(fā)育分析,用Arlequin、DNAsp和BEAST軟件進行群體遺傳學分析,探討該地區(qū)不同基因型HCV的擴張情況。采用SPSS Statistics 17.0軟件來分析HCV基因亞型的分布和人口統(tǒng)計學特征的相關(guān)性。結(jié)果重慶(116)、烏魯木齊(104)、綿陽(74)、洛陽(67)和廣西(58)五個地區(qū)血漿標本中獲得陽性擴增的共為419例。共檢測出HCV-1a、1b、2a、3a、3b、6a、6e和6n等8個基因亞型,未發(fā)現(xiàn)4,5型的存在,且各亞型所占比例分別為 0.72%(3/419)、59.90%(251/419)、16.95%(71/419)、4.53%(19/419)、3.82%(16/419)、12.4...
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.逆轉(zhuǎn)錄體系96孔板加樣示意圖
?中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院碩士研究生畢業(yè)論文第三部分結(jié)果??.HCV病毒液RT-巢式PCR體系的優(yōu)化結(jié)果??1部分血漿樣品HCVCore片段瓊脂糖凝膠電泳圖??隨機選擇4個血漿樣品進行病毒核酸提取,首先用本實驗己優(yōu)化式PCR體積進行擴增,結(jié)果隨機選擇的4個樣品均有較亮的條帶較好。??
1.3基于退火溫度的HCV?Core片段擴增電泳圖的灰度分析結(jié)果??將50、52、54、56、58和60°C作為退火溫度條件下擴增后的瓊脂糖凝膠電泳圖片??進行灰度分析,每個目的條帶都有一個相對應(yīng)的峰圖以及相對應(yīng)的數(shù)值,峰圖或數(shù)??值越高,表明條帶越亮,結(jié)果發(fā)現(xiàn)58°C條件下峰圖及數(shù)值最高,此時條帶最亮。??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]河南地區(qū)慢性丙型肝炎患者丙型肝炎病毒基因型分布研究[J]. 李威,曾艷麗,劉俊平,寧會彬,康誼,尚佳. 中華實用診斷與治療雜志. 2015(06)
[2]重慶地區(qū)丙型肝炎病毒基因型分布及臨床意義[J]. 周召剛,曾藤,徐華,雷宇,鐘珊,周智,任紅. 重慶醫(yī)科大學學報. 2015(03)
[3]2010-2013年中國南京地區(qū)無償獻血人群HBV、HCV、HIV感染情況分析[J]. 蔡麗娜,朱紹汶,周春,王躍幫,蔣昵真,陳慧,湯心怡,王金花,陳顯,胡文佳,陳炳為,陳寶安. 中國實驗血液學雜志. 2014(04)
[4]廣州地區(qū)丙型肝炎患者HCV基因分型研究[J]. 肖桂娥,魏紹靜,張復(fù)春,陳偉烈,蘭蕓,饒嫚,鐘劍波. 熱帶醫(yī)學雜志. 2014(05)
[5]我國丙型肝炎病毒基因1型與非基因1型的臨床特征分析[J]. 聶紅明,陳建杰,董慧琳,楊雨齊,王成寶,李泓町,陳逸云,高月求. 臨床肝膽病雜志. 2012(06)
[6]廣州地區(qū)無償獻血人群HCVE1和NS5B基因的測序和分型[J]. 王敏,許茹,戎霞,夏文杰,花文峰,黃珂,羅廣平,葉欣,付涌水. 中國輸血雜志. 2011(03)
[7]江蘇部分地區(qū)獻血員與非獻血員HCV基因型分布的比較[J]. 沈玲,趙偉,沈燕,孫梅,劉秀奇,何建平,趙彩紅,蔡仁田. 中華醫(yī)院感染學雜志. 2011(05)
[8]丙型肝炎病毒基因分型的研究進展[J]. 解瑩,謝晨. 大連醫(yī)科大學學報. 2010(04)
[9]聯(lián)合分析HCV種屬信息區(qū)和高度保守區(qū)序列確定廣東地區(qū)HCV基因型和亞型[J]. 黃輝紅,周元平,楊潔,曾艷麗,魏君鋒,彭劼,吳英松,黎誠耀,劉叔文,侯金林. 廣東醫(yī)學. 2010(07)
[10]丙型肝炎基因分型進展及其臨床意義[J]. 李偉琴,袁致海,徐光華,吳殿磊. 世界華人消化雜志. 2009(06)
本文編號:3267134
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:88 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.逆轉(zhuǎn)錄體系96孔板加樣示意圖
?中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院碩士研究生畢業(yè)論文第三部分結(jié)果??.HCV病毒液RT-巢式PCR體系的優(yōu)化結(jié)果??1部分血漿樣品HCVCore片段瓊脂糖凝膠電泳圖??隨機選擇4個血漿樣品進行病毒核酸提取,首先用本實驗己優(yōu)化式PCR體積進行擴增,結(jié)果隨機選擇的4個樣品均有較亮的條帶較好。??
1.3基于退火溫度的HCV?Core片段擴增電泳圖的灰度分析結(jié)果??將50、52、54、56、58和60°C作為退火溫度條件下擴增后的瓊脂糖凝膠電泳圖片??進行灰度分析,每個目的條帶都有一個相對應(yīng)的峰圖以及相對應(yīng)的數(shù)值,峰圖或數(shù)??值越高,表明條帶越亮,結(jié)果發(fā)現(xiàn)58°C條件下峰圖及數(shù)值最高,此時條帶最亮。??
【參考文獻】:
期刊論文
[1]河南地區(qū)慢性丙型肝炎患者丙型肝炎病毒基因型分布研究[J]. 李威,曾艷麗,劉俊平,寧會彬,康誼,尚佳. 中華實用診斷與治療雜志. 2015(06)
[2]重慶地區(qū)丙型肝炎病毒基因型分布及臨床意義[J]. 周召剛,曾藤,徐華,雷宇,鐘珊,周智,任紅. 重慶醫(yī)科大學學報. 2015(03)
[3]2010-2013年中國南京地區(qū)無償獻血人群HBV、HCV、HIV感染情況分析[J]. 蔡麗娜,朱紹汶,周春,王躍幫,蔣昵真,陳慧,湯心怡,王金花,陳顯,胡文佳,陳炳為,陳寶安. 中國實驗血液學雜志. 2014(04)
[4]廣州地區(qū)丙型肝炎患者HCV基因分型研究[J]. 肖桂娥,魏紹靜,張復(fù)春,陳偉烈,蘭蕓,饒嫚,鐘劍波. 熱帶醫(yī)學雜志. 2014(05)
[5]我國丙型肝炎病毒基因1型與非基因1型的臨床特征分析[J]. 聶紅明,陳建杰,董慧琳,楊雨齊,王成寶,李泓町,陳逸云,高月求. 臨床肝膽病雜志. 2012(06)
[6]廣州地區(qū)無償獻血人群HCVE1和NS5B基因的測序和分型[J]. 王敏,許茹,戎霞,夏文杰,花文峰,黃珂,羅廣平,葉欣,付涌水. 中國輸血雜志. 2011(03)
[7]江蘇部分地區(qū)獻血員與非獻血員HCV基因型分布的比較[J]. 沈玲,趙偉,沈燕,孫梅,劉秀奇,何建平,趙彩紅,蔡仁田. 中華醫(yī)院感染學雜志. 2011(05)
[8]丙型肝炎病毒基因分型的研究進展[J]. 解瑩,謝晨. 大連醫(yī)科大學學報. 2010(04)
[9]聯(lián)合分析HCV種屬信息區(qū)和高度保守區(qū)序列確定廣東地區(qū)HCV基因型和亞型[J]. 黃輝紅,周元平,楊潔,曾艷麗,魏君鋒,彭劼,吳英松,黎誠耀,劉叔文,侯金林. 廣東醫(yī)學. 2010(07)
[10]丙型肝炎基因分型進展及其臨床意義[J]. 李偉琴,袁致海,徐光華,吳殿磊. 世界華人消化雜志. 2009(06)
本文編號:3267134
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