小麥耐冷相關(guān)基因TaCTR的克隆及其表達(dá)特性分析
發(fā)布時間:2021-06-26 21:36
低溫冷害是小麥生長發(fā)育過程中面臨的重要非生物逆境因素。為了挖掘小麥耐冷功能基因,本研究采用同源克隆的方法從普通小麥品種小偃22中分離到一個耐冷相關(guān)基因TaCTR,該基因序列全長2 192 bp,含有12個外顯子、11個內(nèi)含子,編碼區(qū)全長為1 407 bp,編碼468個氨基酸,分子量約為53.43 kDa;系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,該基因在進(jìn)化關(guān)系上與山羊草最近;亞細(xì)胞定位結(jié)果顯示,該基因編碼的蛋白為膜蛋白;實(shí)時熒光定量PCR(RT-PCR)結(jié)果表明,TaCTR在不同品種、不同組織和不同發(fā)育階段低溫特異表達(dá);在干旱、高鹽及GA處理下,TaCTR的表達(dá)量顯著上升,說明該基因可能參與調(diào)控小麥的抗逆反應(yīng)。
【文章來源】:麥類作物學(xué)報. 2020,40(09)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
小偃22幼穗在4 ℃冷處理下TaCTR 基因表達(dá)量的動態(tài)變化
小偃22幼穗在4 ℃冷處理5 h后 TaCTR基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
圖2 小偃22幼穗在4 ℃冷處理5 h后 TaCTR基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果蛋白系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果(圖4)表明,單子葉植物與雙子葉植物分別聚為一類,小麥TaCTR蛋白與單子葉植物處于同一進(jìn)化分支,且與粗山羊草的親緣關(guān)系最近,這可能是由于小麥的2D染色體來自于粗山羊草的緣故。分析不同物種間CTR蛋白的氨基酸保守序列發(fā)現(xiàn),無論雙子葉還是單子葉植物,CTR蛋白均含有motif 1、2、3、4和5,而且這5個motif的大小和位置接近,這說明TaCTR基因在不同物種間具有較好的保 守性。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]禾谷鐮刀菌cAMP受體類GPCR生物信息學(xué)分析[J]. 馬聿迪,張旭. 生物信息學(xué). 2017(02)
[2]小麥UROS基因的可變剪接[J]. 郎丹瑩,呂庚寅,梁廣旺,李瑞航,郭曉光,徐虹,郭藹光. 麥類作物學(xué)報. 2016(12)
[3]異位表達(dá)蘋果G蛋白偶聯(lián)受體基因MdGCR1降低煙草的抗旱性[J]. 宋來慶,安建平,蘇玲,趙玲玲,王小非. 園藝學(xué)報. 2016(11)
[4]玉米大斑病菌GPCRs超家族的基因鑒定及其在孢子發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄模式[J]. 于波,張玉妹,李志勇,吳迪,鞏校東,申珅,曹志艷,郝志敏,董金皋. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2016(09)
[5]小麥淀粉合成酶SSⅡa基因克隆及生物學(xué)分析[J]. 韓俊杰,王昊龍,李淼淼,南富波,李衛(wèi)華. 麥類作物學(xué)報. 2015(07)
[6]倒春寒發(fā)生時期和次數(shù)對冬小麥產(chǎn)量性狀的影響[J]. 高艷,唐建衛(wèi),殷貴鴻,韓玉林,黃峰,王麗娜,于海飛,李楠楠,張倩,楊光宇,李新平. 麥類作物學(xué)報. 2015(05)
[7]N-酰基高絲氨酸內(nèi)酯介導(dǎo)的細(xì)菌與其真核寄主之間的信息交流[J]. 宋水山. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2010(02)
博士論文
[1]禾谷鐮刀菌候選G蛋白偶聯(lián)受體基因和AMD1基因的功能研究[D]. 曹淑琳.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
本文編號:3252129
【文章來源】:麥類作物學(xué)報. 2020,40(09)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
小偃22幼穗在4 ℃冷處理下TaCTR 基因表達(dá)量的動態(tài)變化
小偃22幼穗在4 ℃冷處理5 h后 TaCTR基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果
圖2 小偃22幼穗在4 ℃冷處理5 h后 TaCTR基因的PCR擴(kuò)增結(jié)果蛋白系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果(圖4)表明,單子葉植物與雙子葉植物分別聚為一類,小麥TaCTR蛋白與單子葉植物處于同一進(jìn)化分支,且與粗山羊草的親緣關(guān)系最近,這可能是由于小麥的2D染色體來自于粗山羊草的緣故。分析不同物種間CTR蛋白的氨基酸保守序列發(fā)現(xiàn),無論雙子葉還是單子葉植物,CTR蛋白均含有motif 1、2、3、4和5,而且這5個motif的大小和位置接近,這說明TaCTR基因在不同物種間具有較好的保 守性。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]禾谷鐮刀菌cAMP受體類GPCR生物信息學(xué)分析[J]. 馬聿迪,張旭. 生物信息學(xué). 2017(02)
[2]小麥UROS基因的可變剪接[J]. 郎丹瑩,呂庚寅,梁廣旺,李瑞航,郭曉光,徐虹,郭藹光. 麥類作物學(xué)報. 2016(12)
[3]異位表達(dá)蘋果G蛋白偶聯(lián)受體基因MdGCR1降低煙草的抗旱性[J]. 宋來慶,安建平,蘇玲,趙玲玲,王小非. 園藝學(xué)報. 2016(11)
[4]玉米大斑病菌GPCRs超家族的基因鑒定及其在孢子發(fā)育過程中的轉(zhuǎn)錄模式[J]. 于波,張玉妹,李志勇,吳迪,鞏校東,申珅,曹志艷,郝志敏,董金皋. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2016(09)
[5]小麥淀粉合成酶SSⅡa基因克隆及生物學(xué)分析[J]. 韓俊杰,王昊龍,李淼淼,南富波,李衛(wèi)華. 麥類作物學(xué)報. 2015(07)
[6]倒春寒發(fā)生時期和次數(shù)對冬小麥產(chǎn)量性狀的影響[J]. 高艷,唐建衛(wèi),殷貴鴻,韓玉林,黃峰,王麗娜,于海飛,李楠楠,張倩,楊光宇,李新平. 麥類作物學(xué)報. 2015(05)
[7]N-酰基高絲氨酸內(nèi)酯介導(dǎo)的細(xì)菌與其真核寄主之間的信息交流[J]. 宋水山. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2010(02)
博士論文
[1]禾谷鐮刀菌候選G蛋白偶聯(lián)受體基因和AMD1基因的功能研究[D]. 曹淑琳.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2017
本文編號:3252129
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