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胃癌發(fā)生和轉移相關的轉錄組分析及COL10A1促胃癌轉移的研究

發(fā)布時間:2021-06-25 00:47
  研究目的和意義:盡管在過去幾十年中手術和化療在腫瘤治療上取得很大進展,但胃癌(GC)仍是全球癌癥相關死亡率的第三大常見原因,其占所有癌癥相關死亡人數的8.8%。早期檢測中缺乏生物標志物和發(fā)生腹膜轉移是胃癌治療失敗的主要原因。所以找到預測疾病進展的分子生物標志物可能促進胃癌藥物的開發(fā)和治療策略的改善。研究方法:高通量mRNA測序(RNA-seq)結果顯示X型膠原蛋白1(COL10A1)是疾病進展相關基因。103例胃癌患者的組織樣本QPCR分析結果顯示,COL10A1 mRNA高表達與胃癌轉移和存活率降低存在顯著相關性。我們使用UCSC基因組網站和JASPAR數據庫分析COL10A1的啟動子序列,預測潛在的轉錄因子SOX9結合位點。收集胃癌患者的癌組織和對應的正常胃粘膜組織,利用免疫組化技術進行SOX9和COL10A1表達的定位定量檢測分析。同時,收集受檢患者的臨床資料及隨訪生存預后的相關信息。接著通過QPCR和Western blot實驗分別在轉錄水平和翻譯水平驗證SOX9和COL10A1的臨床相關性。構建過表達COL10A1和敲低COL10A1的穩(wěn)轉細胞株,同時用轉化生長因子-β1(T... 

【文章來源】:南方醫(yī)科大學廣東省

【文章頁數】:209 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

胃癌發(fā)生和轉移相關的轉錄組分析及COL10A1促胃癌轉移的研究


圖1-1胃癌組織和相應正常胃粘膜組織HE染色??結果分別以xlOO,?x2〇〇顯示

分布概況,差異表達基因


胃粘膜和胃癌組織之間有58種差異表達基因,有50?(86.2%)種基因表達上調,??8?(13.8%)種基因表達下調。分組間差異基因的結果見表1-8、表1-9、表1-10、??表1-11、圖1-3和圖1-4。??表1-8分組間差異基因的個數??Table?1-8?Number?of?differentially?expressed?genes?between?groups??Pairs?DiffGene(Up)?DiffGene(Down)?AH?DiffGene??EGN-vs-EGT?2800?(93.5%)?194?(6.5%)?2994??AGN-vs-AGT?50?(86.2%)?8?(13.8%)?58??表1-8各項指標說明??Term?意義??Pairs?成對比較??DiffGene(Up)?顯著上調的差異基因個數??DiffGene(Down)?顯著下調的差異基因個數??All?DiffGene?顯著差異表達的基因數目??28??

維恩圖,腫瘤分期,差異表達基因,火山


以幫助我們了解差異表達基因的整體分布情況;鹕綀D中紅色的點代表顯著差??異表達上調的基因,綠色的點代表顯著差異表達下調的基因,黑色的點代表非顯??著性差異表達的基因。早期胃癌組和晚期胃癌組的火山圖見


本文編號:3248153

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