研究目的和意義:盡管在過去幾十年中手術(shù)和化療在腫瘤治療上取得很大進展,但胃癌（GC）仍是全球癌癥相關(guān)死亡率的第三大常見原因,其占所有癌癥相關(guān)死亡人數(shù)的8.8%。早期檢測中缺乏生物標(biāo)志物和發(fā)生腹膜轉(zhuǎn)移是胃癌治療失敗的主要原因。所以找到預(yù)測疾病進展的分子生物標(biāo)志物可能促進胃癌藥物的開發(fā)和治療策略的改善。研究方法:高通量mRNA測序（RNA-seq）結(jié)果顯示X型膠原蛋白1（COL10A1）是疾病進展相關(guān)基因。103例胃癌患者的組織樣本QPCR分析結(jié)果顯示,COL10A1 mRNA高表達與胃癌轉(zhuǎn)移和存活率降低存在顯著相關(guān)性。我們使用UCSC基因組網(wǎng)站和JASPAR數(shù)據(jù)庫分析COL10A1的啟動子序列,預(yù)測潛在的轉(zhuǎn)錄因子SOX9結(jié)合位點。收集胃癌患者的癌組織和對應(yīng)的正常胃粘膜組織,利用免疫組化技術(shù)進行SOX9和COL10A1表達的定位定量檢測分析。同時,收集受檢患者的臨床資料及隨訪生存預(yù)后的相關(guān)信息。接著通過QPCR和Western blot實驗分別在轉(zhuǎn)錄水平和翻譯水平驗證SOX9和COL10A1的臨床相關(guān)性。構(gòu)建過表達COL10A1和敲低COL10A1的穩(wěn)轉(zhuǎn)細(xì)胞株,同時用轉(zhuǎn)化生長因子-β1（T... 

【文章來源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：209 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

圖１－１胃癌組織和相應(yīng)正常胃粘膜組織ＨＥ染色??結(jié)果分別以ｘｌＯＯ，?ｘ２〇〇顯示

胃粘膜和胃癌組織之間有５８種差異表達基因，有５０?（８６．２％）種基因表達上調(diào)，??８?（１３．８％）種基因表達下調(diào)。分組間差異基因的結(jié)果見表１－８、表１－９、表１－１０、??表１－１１、圖１－３和圖１－４。??表１－８分組間差異基因的個數(shù)??Ｔａｂｌｅ?１－８?Ｎｕｍｂｅｒ?ｏｆ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?ｇｅｎｅｓ?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｇｒｏｕｐｓ??Ｐａｉｒｓ?ＤｉｆｆＧｅｎｅ（Ｕｐ）?ＤｉｆｆＧｅｎｅ（Ｄｏｗｎ）?ＡＨ?ＤｉｆｆＧｅｎｅ??ＥＧＮ－ｖｓ－ＥＧＴ?２８００?（９３．５％）?１９４?（６．５％）?２９９４??ＡＧＮ－ｖｓ－ＡＧＴ?５０?（８６．２％）?８?（１３．８％）?５８??表１－８各項指標(biāo)說明??Ｔｅｒｍ?意義??Ｐａｉｒｓ?成對比較??ＤｉｆｆＧｅｎｅ（Ｕｐ）?顯著上調(diào)的差異基因個數(shù)??ＤｉｆｆＧｅｎｅ（Ｄｏｗｎ）?顯著下調(diào)的差異基因個數(shù)??Ａｌｌ?ＤｉｆｆＧｅｎｅ?顯著差異表達的基因數(shù)目??２８??

以幫助我們了解差異表達基因的整體分布情況�；鹕綀D中紅色的點代表顯著差??異表達上調(diào)的基因，綠色的點代表顯著差異表達下調(diào)的基因，黑色的點代表非顯??著性差異表達的基因。早期胃癌組和晚期胃癌組的火山圖見


本文編號：3248153