糖尿病腎病轉(zhuǎn)錄水平基因表達(dá)特征以及沙利度胺的干預(yù)作用研究
發(fā)布時(shí)間:2021-06-11 21:36
目的:通過研究糖尿病腎病及沙利度胺干預(yù)糖尿病腎病后的轉(zhuǎn)錄水平基因表達(dá),分析總結(jié)糖尿病腎病的轉(zhuǎn)錄水平基因表達(dá)特征及沙利度胺對(duì)糖尿病腎病的干預(yù)作用,并尋找沙利度胺可能作用的關(guān)鍵靶基因。方法:在NCBI的GEO數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gds/)中分別以“糖尿病腎病”和“沙利度胺”為關(guān)鍵詞檢索相關(guān)數(shù)據(jù)集,按照嚴(yán)格的入選標(biāo)準(zhǔn)和排除標(biāo)準(zhǔn),選擇合適的數(shù)據(jù)集,使用GEO2R的分析方法分析糖尿病腎病相關(guān)基因及沙利度胺作用后改變的基因,選擇p<0.05的基因分析結(jié)果,logFC<0視為基因下調(diào),logFC>0視為基因上調(diào)。結(jié)果:以“糖尿病腎病”為關(guān)鍵詞,共篩選出9個(gè)數(shù)據(jù)集,其中以人為實(shí)驗(yàn)對(duì)象的數(shù)據(jù)集有5個(gè),以鼠為實(shí)驗(yàn)對(duì)象的數(shù)據(jù)集有4個(gè)。以“沙利度胺”為關(guān)鍵詞,共篩選出2個(gè)數(shù)據(jù)集,其中以人和鼠為實(shí)驗(yàn)對(duì)象的數(shù)據(jù)集各1個(gè)。以鼠為實(shí)驗(yàn)對(duì)象的數(shù)據(jù)集中,在糖尿病腎病模型中,Ces2g基因在各個(gè)數(shù)據(jù)集的logFC<0且具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;在沙利度胺作用條件下,Ces2g基因在各個(gè)數(shù)據(jù)集的logFC>0且具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示該基因可能為沙利度胺作用的關(guān)鍵靶...
【文章來(lái)源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:52 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
數(shù)據(jù)集20844基因轉(zhuǎn)錄差異性表達(dá)火山圖
數(shù)據(jù)集21324基因轉(zhuǎn)錄差異性表達(dá)火山圖
數(shù)據(jù)集20636基因轉(zhuǎn)錄差異性表達(dá)火山圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]組蛋白轉(zhuǎn)錄后修飾在糖尿病腎病發(fā)病機(jī)制中的作用研究進(jìn)展[J]. 劉曉敏,董哲毅,張利. 中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合腎病雜志. 2017(02)
碩士論文
[1]基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的2型糖尿病、肥胖、癌癥相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘[D]. 陳軍輝.華南理工大學(xué) 2014
本文編號(hào):3225325
【文章來(lái)源】:山西醫(yī)科大學(xué)山西省
【文章頁(yè)數(shù)】:52 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
數(shù)據(jù)集20844基因轉(zhuǎn)錄差異性表達(dá)火山圖
數(shù)據(jù)集21324基因轉(zhuǎn)錄差異性表達(dá)火山圖
數(shù)據(jù)集20636基因轉(zhuǎn)錄差異性表達(dá)火山圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]組蛋白轉(zhuǎn)錄后修飾在糖尿病腎病發(fā)病機(jī)制中的作用研究進(jìn)展[J]. 劉曉敏,董哲毅,張利. 中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合腎病雜志. 2017(02)
碩士論文
[1]基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)的2型糖尿病、肥胖、癌癥相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘[D]. 陳軍輝.華南理工大學(xué) 2014
本文編號(hào):3225325
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