發(fā)布時(shí)間：2021-06-10 12:37

　　大菱鲆（Scophthalmus maximus）是原產(chǎn)于大西洋東北部、歐洲沿海的一種冷水性魚類。1992年由雷霽霖院士引進(jìn)我國,目前已成為我國北方沿海重要的工廠化養(yǎng)殖魚類。然而北方沿海夏季氣溫、水溫都比較高,大菱鲆發(fā)病率、產(chǎn)卵量和死亡率較高,損害養(yǎng)殖效益,不利于大菱鲆工廠化養(yǎng)殖的進(jìn)一步發(fā)展。本課題組從2007年開始對(duì)大菱鲆的耐溫性狀進(jìn)行遺傳改良,選育生長性能優(yōu)良的耐高溫新品系,目前已取得了可喜的進(jìn)展,選育后代耐溫性明顯提高。為加快育種進(jìn)程,挖掘與高溫應(yīng)答相關(guān)的功能基因,解析大菱鲆應(yīng)答高溫脅迫的分子機(jī)制,本研究通過分析高溫脅迫條件下的皮膚組織轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),篩選出數(shù)個(gè)與高溫脅迫相關(guān)的抗逆基因,利用基因克隆、組織表達(dá)分析和原核表達(dá)等方法進(jìn)行解析。以期在全基因組范圍內(nèi)了解大菱鲆應(yīng)答高溫脅迫的分子機(jī)制,為全面認(rèn)識(shí)大菱鲆抗逆的分子機(jī)理奠定基礎(chǔ),并為大菱鲆耐高溫遺傳育種新標(biāo)記的開發(fā)提供新的理論基礎(chǔ)和研究方向。1.分析大菱鲆高溫皮膚轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫,對(duì)原始數(shù)據(jù)進(jìn)行過濾,剔除了低質(zhì)量數(shù)據(jù)后將clean reads進(jìn)行混合拼接,得到217609條Unigene作為參考序列用于后續(xù)分析;采用Nr,Nt,Sw... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

注釋結(jié)果venn圖

圖 2-2 GO 功能分類Figure 2-2 Catelogy of GO橫坐標(biāo)為 GO 三個(gè)大類的下一層級(jí)的 GOterm，縱坐標(biāo)為注釋到該 term 下(包括該 term的子 term)的基因個(gè)數(shù)。將 KOG 注釋成功的基因按 KOG 的 group 進(jìn)行分類，共可分為 26 組，分類結(jié)果如圖 2-3。由圖中結(jié)果可以看出，基因聚集最多的功能依次是“信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制”、“一般功能預(yù)測”和“翻譯后修飾，蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)，分子伴侶”；聚類最少的是“細(xì)胞機(jī)動(dòng)性”、“未命名蛋白”和“細(xì)胞壁/膜/包膜生物發(fā)生”。

圖 2-2 GO 功能分類Figure 2-2 Catelogy of GO橫坐標(biāo)為 GO 三個(gè)大類的下一層級(jí)的 GOterm，縱坐標(biāo)為注釋到該 term 下(包括該 term的子 term)的基因個(gè)數(shù)。將 KOG 注釋成功的基因按 KOG 的 group 進(jìn)行分類，共可分為 26 組，分類結(jié)果如圖 2-3。由圖中結(jié)果可以看出，基因聚集最多的功能依次是“信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)機(jī)制”、“一般功能預(yù)測”和“翻譯后修飾，蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)，分子伴侶”；聚類最少的是“細(xì)胞機(jī)動(dòng)性”、“未命名蛋白”和“細(xì)胞壁/膜/包膜生物發(fā)生”。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]牙鲆（Paralichthys olivaceus）Hsp90 mRNA在溫度刺激和鰻弧菌感染下的表達(dá)特征[J]. 生安志,鞠輝明,李貴陽,李杰,莫照蘭.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2016(05)
[2]內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白27（ERp27）在小鼠卵母細(xì)胞的定位及在精卵融合中的作用[J]. 王錦鳳,肖露,王若琳,錢衛(wèi)平,周亮.  生殖醫(yī)學(xué)雜志. 2016(09)
[3]人類蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶家族研究進(jìn)展[J]. 黃子芮,潘黎明,盛夢婷,李俊明.  現(xiàn)代醫(yī)藥衛(wèi)生. 2016(02)
[4]碳酸鹽堿度脅迫下瓦式雅羅魚血漿游離氨基酸水平的變化[J]. 常玉梅,何強(qiáng),孫言春,梁利群,孫效文.  中國水產(chǎn)科學(xué). 2016(01)
[5]蛋白質(zhì)二硫鍵異構(gòu)酶A3——疾病治療的新靶點(diǎn)[J]. 胡玥,陶麗媛,呂賓.  中國病理生理雜志. 2015(06)
[6]日本血吸蟲PDIA3的原核表達(dá)和多抗血清制備[J]. 劉群,段明明,苑純秀,李丹丹,葛程,馬麗貞,馮新港.  中國動(dòng)物傳染病學(xué)報(bào). 2015(01)
[7]循環(huán)水養(yǎng)殖條件下水溫對(duì)大菱鲆氨氮排泄、轉(zhuǎn)氨酶及免疫因子的影響[J]. 王曉晨,孫國祥,李勇,周邦維,趙寧寧,柳陽,于凱松.  漁業(yè)現(xiàn)代化. 2014(06)
[8]大鯢鐵蛋白重鏈FTH基因的克隆、鑒定及表達(dá)分析[J]. 楊輝,李鋒剛,藍(lán)青景,胡偉,劉小林,王立新.  水生生物學(xué)報(bào). 2014(01)
[9]擬穴青蟹（Scylla paramamosain）蛋白二硫鍵異構(gòu)酶基因的分子克隆與表達(dá)分析[J]. 曾祥蘭,劉元婧,曾慧,黃輝洋,葉海輝,王桂忠.  海洋與湖沼. 2013(06)
[10]松江鱸魚皮膚的顯微和亞顯微結(jié)構(gòu)[J]. 蔣鑫,潘連德,馬召騰.  動(dòng)物學(xué)雜志. 2012(04)

碩士論文
[1]二硫鍵異構(gòu)酶ERp72在靜脈血栓形成中的作用及其機(jī)制的初步研究[D]. 陳鳳梧.蘇州大學(xué) 2016
[2]金定鴨FTH1基因的克隆及功能初步鑒定[D]. 童一宇.揚(yáng)州大學(xué) 2014
[3]溫度對(duì)南方鲇幼魚皮膚呼吸代謝的影響[D]. 鮮雪梅.重慶師范大學(xué) 2011
[4]高溫逆境下大菱鲆體表生理生化特性研究[D]. 黃智慧.中國海洋大學(xué) 2010
[5]鹽度、pH和捕撈脅迫對(duì)施氏鱘（Acipenser schrenckii）生理生化影響的初步研究[D]. 童燕.華東師范大學(xué) 2007
[6]擁擠脅迫對(duì)鯉生長和生理指標(biāo)的影響[D]. 于淼.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2005



本文編號(hào)：3222384