Ⅰ型神經(jīng)纖維瘤病發(fā)生與惡變相關(guān)基因的生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-06-07 18:52
目的篩選Ⅰ型神經(jīng)纖維瘤。∟F1)中參與神經(jīng)性纖維瘤發(fā)生和惡變的調(diào)控基因。方法從GEO公開(kāi)數(shù)據(jù)庫(kù)獲取NF1相關(guān)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)集(GSE14038)和甲基化表達(dá)數(shù)據(jù)集(E-GEOD21714), 其中GSE14038包含正常對(duì)照組10例、良性神經(jīng)纖維瘤組48例和惡性外周神經(jīng)鞘膜瘤組19例,E-GEOD21714包含正常對(duì)照組6例、良性神經(jīng)纖維瘤組10例、惡性外周神經(jīng)鞘膜組10例。對(duì)不同樣本的基因表達(dá)進(jìn)行分析,尋找差異表達(dá)的基因,并使用基因注釋(GO)、通路富集分析和蛋白質(zhì)互作分析(PPI)工具對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。結(jié)果在結(jié)合比對(duì)了數(shù)據(jù)庫(kù)中的差異表達(dá)基因和甲基化差異后,與正常對(duì)照組相比,良性神經(jīng)性纖維瘤組中有14個(gè)基因可能為神經(jīng)纖維瘤發(fā)生相關(guān)調(diào)控基因,惡性外周神經(jīng)鞘膜瘤組中有105個(gè)基因可能為惡變相關(guān)調(diào)控基因。GO分析結(jié)果顯示,良性神經(jīng)性纖維瘤組差異基因主要功能為以DNA為模板的轉(zhuǎn)錄正向調(diào)控、轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合,并主要定位于紡錘體微管,惡性神經(jīng)性纖維瘤組差異基因主要功能為細(xì)胞增殖調(diào)控、特定DNA序列的結(jié)合,并主要定位于神經(jīng)源細(xì)胞胞體。通路富集分析顯示,良性神經(jīng)性纖維瘤組差異基因主要富集于鞘脂代謝,惡性...
【文章來(lái)源】:中華整形外科雜志. 2020,36(05)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
本文編號(hào):3217113
【文章來(lái)源】:中華整形外科雜志. 2020,36(05)北大核心CSCD
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