目的篩選Ⅰ型神經(jīng)纖維瘤�。∟F1）中參與神經(jīng)性纖維瘤發(fā)生和惡變的調(diào)控基因。方法從GEO公開數(shù)據(jù)庫獲取NF1相關的基因表達數(shù)據(jù)集（GSE14038）和甲基化表達數(shù)據(jù)集（E-GEOD21714）, 其中GSE14038包含正常對照組10例、良性神經(jīng)纖維瘤組48例和惡性外周神經(jīng)鞘膜瘤組19例,E-GEOD21714包含正常對照組6例、良性神經(jīng)纖維瘤組10例、惡性外周神經(jīng)鞘膜組10例。對不同樣本的基因表達進行分析,尋找差異表達的基因,并使用基因注釋（GO）、通路富集分析和蛋白質(zhì)互作分析（PPI）工具對數(shù)據(jù)進行處理。結果在結合比對了數(shù)據(jù)庫中的差異表達基因和甲基化差異后,與正常對照組相比,良性神經(jīng)性纖維瘤組中有14個基因可能為神經(jīng)纖維瘤發(fā)生相關調(diào)控基因,惡性外周神經(jīng)鞘膜瘤組中有105個基因可能為惡變相關調(diào)控基因。GO分析結果顯示,良性神經(jīng)性纖維瘤組差異基因主要功能為以DNA為模板的轉(zhuǎn)錄正向調(diào)控、轉(zhuǎn)錄因子結合,并主要定位于紡錘體微管,惡性神經(jīng)性纖維瘤組差異基因主要功能為細胞增殖調(diào)控、特定DNA序列的結合,并主要定位于神經(jīng)源細胞胞體。通路富集分析顯示,良性神經(jīng)性纖維瘤組差異基因主要富集于鞘脂代謝,惡性... 

【文章來源】：中華整形外科雜志. 2020,36(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁


本文編號：3217113