BSP測序檢測青海地區(qū)漢、藏族胃癌患者中TGFBI的甲基化狀態(tài)
發(fā)布時間:2021-05-21 20:02
目的:通過檢測胃癌(Gastric cancer,GC)患者癌組織及與之相匹配的癌旁組織中TGFBI基因啟動子甲基化狀態(tài),探討TGFBI基因甲基化與GC發(fā)生、發(fā)展的關系。通過民族間的比較,探討漢族、藏族GC患者之間TGFBI基因啟動子甲基化是否具有差異性,為青海地區(qū)GC高發(fā)及民族間發(fā)病率存在差異的可能原因提供相關理論數(shù)據(jù)。方法:1.收集2019年03月至2019年11月于青海大學附屬醫(yī)院住院并行胃鏡活檢,首次病理確診為GC的患者28例。其中,GC組織樣本和配對癌旁組織樣本各28個。2.依據(jù)民族不同分組:漢族17例,藏族11例。3.采用亞硫酸氫鹽測序(bisulfite sequencing PCR,BSP)法檢測各樣本TGFBI基因啟動子甲基化程度,并進行統(tǒng)計學分析。結果:1.GC組織TGFBI基因啟動子甲基化克隆數(shù)478個,甲基化率為11.42%;癌旁組織TGFBI基因啟動子甲基化克隆數(shù)293個,甲基化率為6.98%;GC組織甲基化程度高于與其相匹配的癌旁組織,差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。2.漢族、藏族GC組織中,漢族TGFBI基因啟動子甲基化克隆數(shù)299個,平均甲基化...
【文章來源】:青海大學青海省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:45 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
主要符號及英文縮寫對照
第1章 前言
第2章 材料及方法
2.1 研究對象
2.1.1 一般資料
2.1.2 納入及排除標準
2.2 實驗材料及試劑
2.3 實驗儀器
2.4 實驗方法步驟
2.4.1 GC組織、癌旁組織DNA提取
2.4.2 DNA亞硫酸氫鈉修飾
2.4.3 引物設計
2.4.4 PCR反應體系
2.4.5 反應條件
2.4.6 電泳檢測條帶
2.4.7 連接反應體系
2.4.8 連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化
2.4.9 藍白斑篩選
2.4.10 測序
2.5 實驗技術路線圖
2.6 實驗結果統(tǒng)計
第3章 結果
3.1 TGFBI基因啟動子區(qū)Cp G島的分布
3.1.1 應用在線平臺,TGFBI基因啟動子區(qū)Cp G島
3.2 GC患者癌及癌旁組織中TGFBI基因啟動子甲基化的狀態(tài)
3.3 漢、藏族GC患者,癌及癌旁組織中TGFBI基因啟動子甲基化狀態(tài)
3.3.1 漢、藏族GC患者,癌組織中TGFBI基因啟動子甲基化狀態(tài)
3.3.2 漢、藏GC患者,癌旁組織中TGFBI基因啟動子甲基化狀態(tài)
3.4 TGFBI基因啟動子甲基化與臨床病理特征的關系
第4章 討論
第5章 結論
參考文獻
作者在讀期間科研成果簡介
致謝
附錄 文獻綜述 消化系統(tǒng)腫瘤與TGFBI的表達相關性的研究進展
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Aberrant methylation of secreted protein acidic and rich in cysteine gene and its significance in gastric cancer[J]. Shuai Shao,Nuo-Ming Zhou,Dong-Qiu Dai. World Journal of Gastroenterology. 2019(46)
[2]Early gastric cancer diagnostic ability of ultrathin endoscope loaded with laser light source[J]. Takuto Suzuki,Yoshiyasu Kitagawa,Rino Nankinzan,Taketo Yamaguchi. World Journal of Gastroenterology. 2019(11)
[3]胃癌中EXD3基因的表達及功能的生物信息學分析[J]. 孫燈眾,劉牧林,吳華彰,黃福新. 南方醫(yī)科大學學報. 2019(02)
[4]中國惡性腫瘤流行情況及防控現(xiàn)狀[J]. 曹毛毛,陳萬青. 中國腫瘤臨床. 2019(03)
[5]Prognostic significance of tumor immune microenvironment and immunotherapy: Novel insights and future perspectives in gastric cancer[J]. Daniela Cornelia Laz?r,Mihaela Flavia Avram,Ioan Romo?an,M?rioara Cornianu,Sorina T?ban,Adrian Goldi?. World Journal of Gastroenterology. 2018(32)
[6]漢族與藏族胃癌發(fā)病率及危險因素分析[J]. 任波. 解放軍預防醫(yī)學雜志. 2017(05)
[7]高原藏族人群胃癌發(fā)病危險因素病例對照研究[J]. 李康,旦增,劉曉波,劉明花,澤永革,次仁措姆,邊巴扎西. 中國公共衛(wèi)生. 2013(11)
[8]1979-2008年青海地區(qū)經(jīng)胃鏡檢出胃癌6362例[J]. 榮光宏,熊元治,楊永耿,劉芝蘭,趙相,逯艷艷. 世界華人消化雜志. 2012(36)
本文編號:3200296
【文章來源】:青海大學青海省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:45 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
主要符號及英文縮寫對照
第1章 前言
第2章 材料及方法
2.1 研究對象
2.1.1 一般資料
2.1.2 納入及排除標準
2.2 實驗材料及試劑
2.3 實驗儀器
2.4 實驗方法步驟
2.4.1 GC組織、癌旁組織DNA提取
2.4.2 DNA亞硫酸氫鈉修飾
2.4.3 引物設計
2.4.4 PCR反應體系
2.4.5 反應條件
2.4.6 電泳檢測條帶
2.4.7 連接反應體系
2.4.8 連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化
2.4.9 藍白斑篩選
2.4.10 測序
2.5 實驗技術路線圖
2.6 實驗結果統(tǒng)計
第3章 結果
3.1 TGFBI基因啟動子區(qū)Cp G島的分布
3.1.1 應用在線平臺,TGFBI基因啟動子區(qū)Cp G島
3.2 GC患者癌及癌旁組織中TGFBI基因啟動子甲基化的狀態(tài)
3.3 漢、藏族GC患者,癌及癌旁組織中TGFBI基因啟動子甲基化狀態(tài)
3.3.1 漢、藏族GC患者,癌組織中TGFBI基因啟動子甲基化狀態(tài)
3.3.2 漢、藏GC患者,癌旁組織中TGFBI基因啟動子甲基化狀態(tài)
3.4 TGFBI基因啟動子甲基化與臨床病理特征的關系
第4章 討論
第5章 結論
參考文獻
作者在讀期間科研成果簡介
致謝
附錄 文獻綜述 消化系統(tǒng)腫瘤與TGFBI的表達相關性的研究進展
參考文獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]Aberrant methylation of secreted protein acidic and rich in cysteine gene and its significance in gastric cancer[J]. Shuai Shao,Nuo-Ming Zhou,Dong-Qiu Dai. World Journal of Gastroenterology. 2019(46)
[2]Early gastric cancer diagnostic ability of ultrathin endoscope loaded with laser light source[J]. Takuto Suzuki,Yoshiyasu Kitagawa,Rino Nankinzan,Taketo Yamaguchi. World Journal of Gastroenterology. 2019(11)
[3]胃癌中EXD3基因的表達及功能的生物信息學分析[J]. 孫燈眾,劉牧林,吳華彰,黃福新. 南方醫(yī)科大學學報. 2019(02)
[4]中國惡性腫瘤流行情況及防控現(xiàn)狀[J]. 曹毛毛,陳萬青. 中國腫瘤臨床. 2019(03)
[5]Prognostic significance of tumor immune microenvironment and immunotherapy: Novel insights and future perspectives in gastric cancer[J]. Daniela Cornelia Laz?r,Mihaela Flavia Avram,Ioan Romo?an,M?rioara Cornianu,Sorina T?ban,Adrian Goldi?. World Journal of Gastroenterology. 2018(32)
[6]漢族與藏族胃癌發(fā)病率及危險因素分析[J]. 任波. 解放軍預防醫(yī)學雜志. 2017(05)
[7]高原藏族人群胃癌發(fā)病危險因素病例對照研究[J]. 李康,旦增,劉曉波,劉明花,澤永革,次仁措姆,邊巴扎西. 中國公共衛(wèi)生. 2013(11)
[8]1979-2008年青海地區(qū)經(jīng)胃鏡檢出胃癌6362例[J]. 榮光宏,熊元治,楊永耿,劉芝蘭,趙相,逯艷艷. 世界華人消化雜志. 2012(36)
本文編號:3200296
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