磚紅絨蓋牛肝菌三個(gè)發(fā)育階段的差異表達(dá)基因篩選及其功能初步分析
發(fā)布時(shí)間:2021-05-18 13:06
磚紅絨蓋牛肝菌(Xerocomus spadiceus)在云南分布廣,經(jīng)濟(jì)價(jià)值高,深受人們喜愛。其隸屬于真菌界(Fungi)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)、傘菌綱(Agaricomycetes)、牛肝菌目(Boletales)、牛肝菌科(Boletaceae)、絨蓋牛肝菌屬(Xerocomus)。它不僅味道鮮美,兼具抗氧化、抗腫瘤等藥用功效。牛肝菌屬于外生菌根真菌,與植物共生,其室內(nèi)純培養(yǎng)條件下誘導(dǎo)的菌絲體生長(zhǎng)緩慢,不會(huì)扭結(jié)原基,這是人工培養(yǎng)的癥結(jié)所在。本實(shí)驗(yàn)室已能誘導(dǎo)出磚紅絨蓋牛肝菌小原基,因此本文以該菌種為研究材料,結(jié)合前期的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),對(duì)其菌絲體、原基、子實(shí)體三個(gè)發(fā)育階段的差異基因進(jìn)行分析;通過單樣、復(fù)合樣的多重比較,優(yōu)選32條差異基因;在此基礎(chǔ)上,最終選擇3條上調(diào)表達(dá)基因,利用RT-qPCR技術(shù)分別檢測(cè)其在培養(yǎng)8天、15天的菌絲體、原基中的表達(dá)量,并結(jié)合它們的數(shù)據(jù)庫功能注釋結(jié)果預(yù)測(cè)三個(gè)基因在菌絲生長(zhǎng)、原基及子實(shí)體發(fā)育中的作用。這為進(jìn)一步確定參與原基、子實(shí)體形成的候選基因,為子實(shí)體發(fā)育相關(guān)調(diào)控基因及其功能的研究奠定基礎(chǔ)。主要結(jié)果如下:1.對(duì)于子實(shí)體-vs-原基的差異...
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 綜述
1 牛肝菌及其國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
2 大型真菌子實(shí)體發(fā)育的相關(guān)研究進(jìn)展
2.1 環(huán)境因子
2.2 大型真菌子實(shí)體發(fā)育調(diào)控基因
3 研究的目的及意義
第二章 材料與方法
1 材料
2 試劑和儀器
2.1 主要試劑
2.2 主要儀器
3 方法
3.1 差異基因篩選
3.2 同源性比對(duì)
3.3 組織分離培養(yǎng)
3.4 菌絲體和原基的分子鑒定
3.5 實(shí)時(shí)熒光定量分析
第三章 結(jié)果與分析
1 基因的篩選
1.1 篩選差異基因
1.2 差異基因的功能預(yù)測(cè)
2 基因的同源性分析
2.1 真菌凝集素基因
2.2 疏水蛋白基因
3 菌絲體和原基的分子鑒定
3.1 DNA的質(zhì)量檢測(cè)
3.2 ITS序列的擴(kuò)增
3.3 構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹
4 RNA質(zhì)量檢測(cè)
5 熒光定量標(biāo)準(zhǔn)曲線
5.1 內(nèi)參基因gapdh梯度稀釋樣品擴(kuò)增
5.2 xs-lectin基因梯度稀釋樣品擴(kuò)增
5.3 xs-hyd1基因梯度稀釋樣品擴(kuò)增
5.4 xs-hyd2基因梯度稀釋樣品擴(kuò)增
6 熒光定量PCR
6.1 真菌凝集素基因xs-lectin
6.2疏水蛋白基因xs-hyd1
6.3疏水蛋白基因xs-hyd2
7 RT-qPCR結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比較分析
第四章 功能初步分析和討論
1 真菌凝集素
2 疏水蛋白
3 展望
附錄
1 gapdh基因的序列
2 xs-1ectin基因的序列
3 xs-hyd1基因的序列
4 xs-hyd2基因的序列
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]金針菇轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因fv-mfs1的序列與表達(dá)分析[J]. 仝宗軍,嚴(yán)俊杰,張磊,黃蓉梅,徐偉南,韓星,許鳴鳳,陶永新,謝寶貴. 食用菌學(xué)報(bào). 2017(03)
[2]外源添加皂苷對(duì)斑玉蕈生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J]. 陳輝,馮川,陳明杰,趙靜,汪虹,王倩,張津京,馮志勇. 上海農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[3]糙皮側(cè)耳Pleurotus ostreatus子實(shí)體凝集素基因polectin2及其啟動(dòng)子的克隆及功能鑒定[J]. 蘇文英,盛立柱,代月婷,宋冰,付永平,李玉. 菌物學(xué)報(bào). 2017(08)
[4]黑曲霉中疏水蛋白基因種類分析[J]. 張燕,許可,張建國(guó). 生命科學(xué)研究. 2017(02)
[5]草菇鈣調(diào)磷酸酶催化亞基(Vv-CNA)的序列與表達(dá)[J]. 汪健芳,徐志周,嚴(yán)俊杰,李肖,張磊,黃李琳,謝寶貴. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[6]林芝美味牛肝菌的營(yíng)養(yǎng)成分分析[J]. 馬長(zhǎng)中,徐錦華,羅章,鐘政昌,辜雪冬. 食品工業(yè). 2017(03)
[7]草菇VEGF信號(hào)通路中vv-SPK基因的結(jié)構(gòu)與表達(dá)分析[J]. 王健,萬芳,李肖,嚴(yán)俊杰,黃李琳,謝寶貴. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[8]板栗接種食用菌根真菌的菌根化效果及對(duì)幼苗促生效應(yīng)的研究[J]. 鄭來友,童品璋,孫宣軍,相聰偉,張倩,許小婉,楊共鳴,斯海平. 林業(yè)科學(xué)研究. 2017(01)
[9]糙皮側(cè)耳凝集素基因Plectin的克隆和表達(dá)分析[J]. 殷朝敏,陳葉葉,盧靜,馬愛民. 園藝學(xué)報(bào). 2017(01)
[10]林芝磚紅絨蓋牛肝菌的營(yíng)養(yǎng)成分分析及評(píng)價(jià)[J]. 馬長(zhǎng)中,羅章,辜雪冬. 食品科學(xué). 2016(24)
博士論文
[1]光誘導(dǎo)香菇菌絲轉(zhuǎn)色形成機(jī)理的研究[D]. 唐利華.上海交通大學(xué) 2014
[2]草菇形態(tài)建成中差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子的篩選及關(guān)鍵基因的功能分析[D]. 孟麗.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]茶樹菇、鹿角炭角菌和磚紅絨蓋牛肝菌凝集素純化及其免疫調(diào)節(jié)活性的研究[D]. 劉慶洪.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
碩士論文
[1]冷誘導(dǎo)金針菇原基形成的相關(guān)基因研究[D]. 李瓊潔.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]金針菇子實(shí)體發(fā)育相關(guān)基因的功能研究[D]. 羅潤(rùn).華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]香菇子實(shí)體發(fā)育相關(guān)基因的克隆及分析[D]. 李海峰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]正紅菇菌絲體凝集素的分離純化與性質(zhì)研究[D]. 黃維雅.福建師范大學(xué) 2010
[5]平菇汁對(duì)褐環(huán)粘蓋牛肝菌生長(zhǎng)影響的研究[D]. 段慧.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]巴山美味牛肝菌營(yíng)養(yǎng)成分提取的研究[D]. 李燕平.西華大學(xué) 2009
本文編號(hào):3193843
【文章來源】:云南大學(xué)云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:58 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 綜述
1 牛肝菌及其國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展
2 大型真菌子實(shí)體發(fā)育的相關(guān)研究進(jìn)展
2.1 環(huán)境因子
2.2 大型真菌子實(shí)體發(fā)育調(diào)控基因
3 研究的目的及意義
第二章 材料與方法
1 材料
2 試劑和儀器
2.1 主要試劑
2.2 主要儀器
3 方法
3.1 差異基因篩選
3.2 同源性比對(duì)
3.3 組織分離培養(yǎng)
3.4 菌絲體和原基的分子鑒定
3.5 實(shí)時(shí)熒光定量分析
第三章 結(jié)果與分析
1 基因的篩選
1.1 篩選差異基因
1.2 差異基因的功能預(yù)測(cè)
2 基因的同源性分析
2.1 真菌凝集素基因
2.2 疏水蛋白基因
3 菌絲體和原基的分子鑒定
3.1 DNA的質(zhì)量檢測(cè)
3.2 ITS序列的擴(kuò)增
3.3 構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹
4 RNA質(zhì)量檢測(cè)
5 熒光定量標(biāo)準(zhǔn)曲線
5.1 內(nèi)參基因gapdh梯度稀釋樣品擴(kuò)增
5.2 xs-lectin基因梯度稀釋樣品擴(kuò)增
5.3 xs-hyd1基因梯度稀釋樣品擴(kuò)增
5.4 xs-hyd2基因梯度稀釋樣品擴(kuò)增
6 熒光定量PCR
6.1 真菌凝集素基因xs-lectin
6.2疏水蛋白基因xs-hyd1
6.3疏水蛋白基因xs-hyd2
7 RT-qPCR結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比較分析
第四章 功能初步分析和討論
1 真菌凝集素
2 疏水蛋白
3 展望
附錄
1 gapdh基因的序列
2 xs-1ectin基因的序列
3 xs-hyd1基因的序列
4 xs-hyd2基因的序列
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]金針菇轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因fv-mfs1的序列與表達(dá)分析[J]. 仝宗軍,嚴(yán)俊杰,張磊,黃蓉梅,徐偉南,韓星,許鳴鳳,陶永新,謝寶貴. 食用菌學(xué)報(bào). 2017(03)
[2]外源添加皂苷對(duì)斑玉蕈生長(zhǎng)發(fā)育的影響[J]. 陳輝,馮川,陳明杰,趙靜,汪虹,王倩,張津京,馮志勇. 上海農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[3]糙皮側(cè)耳Pleurotus ostreatus子實(shí)體凝集素基因polectin2及其啟動(dòng)子的克隆及功能鑒定[J]. 蘇文英,盛立柱,代月婷,宋冰,付永平,李玉. 菌物學(xué)報(bào). 2017(08)
[4]黑曲霉中疏水蛋白基因種類分析[J]. 張燕,許可,張建國(guó). 生命科學(xué)研究. 2017(02)
[5]草菇鈣調(diào)磷酸酶催化亞基(Vv-CNA)的序列與表達(dá)[J]. 汪健芳,徐志周,嚴(yán)俊杰,李肖,張磊,黃李琳,謝寶貴. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[6]林芝美味牛肝菌的營(yíng)養(yǎng)成分分析[J]. 馬長(zhǎng)中,徐錦華,羅章,鐘政昌,辜雪冬. 食品工業(yè). 2017(03)
[7]草菇VEGF信號(hào)通路中vv-SPK基因的結(jié)構(gòu)與表達(dá)分析[J]. 王健,萬芳,李肖,嚴(yán)俊杰,黃李琳,謝寶貴. 福建農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(03)
[8]板栗接種食用菌根真菌的菌根化效果及對(duì)幼苗促生效應(yīng)的研究[J]. 鄭來友,童品璋,孫宣軍,相聰偉,張倩,許小婉,楊共鳴,斯海平. 林業(yè)科學(xué)研究. 2017(01)
[9]糙皮側(cè)耳凝集素基因Plectin的克隆和表達(dá)分析[J]. 殷朝敏,陳葉葉,盧靜,馬愛民. 園藝學(xué)報(bào). 2017(01)
[10]林芝磚紅絨蓋牛肝菌的營(yíng)養(yǎng)成分分析及評(píng)價(jià)[J]. 馬長(zhǎng)中,羅章,辜雪冬. 食品科學(xué). 2016(24)
博士論文
[1]光誘導(dǎo)香菇菌絲轉(zhuǎn)色形成機(jī)理的研究[D]. 唐利華.上海交通大學(xué) 2014
[2]草菇形態(tài)建成中差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄因子的篩選及關(guān)鍵基因的功能分析[D]. 孟麗.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]茶樹菇、鹿角炭角菌和磚紅絨蓋牛肝菌凝集素純化及其免疫調(diào)節(jié)活性的研究[D]. 劉慶洪.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004
碩士論文
[1]冷誘導(dǎo)金針菇原基形成的相關(guān)基因研究[D]. 李瓊潔.華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[2]金針菇子實(shí)體發(fā)育相關(guān)基因的功能研究[D]. 羅潤(rùn).華南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2016
[3]香菇子實(shí)體發(fā)育相關(guān)基因的克隆及分析[D]. 李海峰.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[4]正紅菇菌絲體凝集素的分離純化與性質(zhì)研究[D]. 黃維雅.福建師范大學(xué) 2010
[5]平菇汁對(duì)褐環(huán)粘蓋牛肝菌生長(zhǎng)影響的研究[D]. 段慧.內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[6]巴山美味牛肝菌營(yíng)養(yǎng)成分提取的研究[D]. 李燕平.西華大學(xué) 2009
本文編號(hào):3193843
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