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神經(jīng)源性高血壓小鼠差異靶基因分析——基于GEO數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)挖掘

發(fā)布時間:2021-05-10 09:36
  目的通過分析GSE25076基因芯片數(shù)據(jù),探索神經(jīng)源性高血壓小鼠下丘腦的差異基因,嘗試尋找該病的潛在治療靶點。方法在NCBI提供的GEO2R平臺內(nèi)檢索GSE25076,將全部數(shù)據(jù)下載保存為Excel格式,并進(jìn)行差異基因分析。采用DAVID平臺進(jìn)行GO分析,京都基因與基因組百科全書(KEGG)平臺進(jìn)行KEGG通路分析,STRING平臺進(jìn)行基因互作(PPI)分析。結(jié)果在GEO2R平臺內(nèi)對神經(jīng)源性高血壓小鼠芯片數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,共獲得34 760個差異基因,最終獲得28個符合條件的基因。這28個差異基因富集在磷脂分解代謝過程、水解酶活性調(diào)節(jié)等過程。KEGG分析表明其富集于RNA轉(zhuǎn)運通路。結(jié)論真核翻譯起始因子(EIF)4A3和核糖核酸酶(POP4)最為可能是神經(jīng)源性高血壓發(fā)生的基因?qū)用娴脑?通過RNA轉(zhuǎn)運通路,影響神經(jīng)發(fā)育、血管生成及神經(jīng)發(fā)生等過程,最終導(dǎo)致本病的發(fā)生發(fā)展。 

【文章來源】:中國老年學(xué)雜志. 2020,40(22)北大核心

【文章頁數(shù)】:4 頁

【文章目錄】:
1 資料與方法
    1.1 資料來源
    1.2 方法
2 結(jié) 果
    2.1 差異基因選取條件及結(jié)果
    2.2 基因本體分析(GOEA)
    2.3 KEGG通路富集分析
    2.4 差異基因的相互作用分析
3 討 論



本文編號:3179136

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