目的:通過生物信息學的方法,尋找在胰腺癌中差異表達的基因,同時分析差異表達基因在胰腺癌中生物學作用,探討其與胰腺癌的關系。方法:利用GEO數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)集尋找差異基因。利用DAVID數(shù)據(jù)庫進行差異基因的生物學分析。利用STRING數(shù)據(jù)庫進行蛋白相互作用分析,并用Cytoscape軟件識別蛋白互作網(wǎng)絡中最重要的模塊,篩選出關鍵基因并進行功能富集分析。利用cBioPortal數(shù)據(jù)庫中腫瘤患者的臨床數(shù)據(jù),對關鍵基因進行生存分析。同時利用Oncomine數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)集驗證關鍵基因表達情況,并分析關鍵基因與腫瘤分級、分期、分子標記和藥物敏感性的關系。結果:本研究從基因表達綜合數(shù)據(jù)庫（GEO）下載基因芯片GSE28735、GSE15471和GSE62452,以確定在胰腺癌癌變和進展中起作用的候選基因。最初,在三個數(shù)據(jù)集中共鑒定出219個差異表達基因,其中161個上調基因,58個下調基因。通過富集分析確定了這些基因的功能和途徑。結果表明,差異基因參與了細胞粘附、細胞外基質組織、蛋白水解、鈣離子結合、絲氨酸型內(nèi)肽酶活性、胞外小體、質膜、胞外區(qū)和胞外間隙的變化。在此基礎上,構建了蛋白質相互作用網(wǎng)絡,并將... 

【文章來源】：中國醫(yī)科大學遼寧省

【文章頁數(shù)】：42 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語
1 前言
2 資料與方法
    2.1 數(shù)據(jù)來源
    2.2 識別差異基因
    2.3 差異基因的KEGG和 GO富集分析
    2.4 PPI網(wǎng)絡建設與模塊分析
    2.5 關鍵基因的選擇和分析
3 結果
    3.1 胰腺癌中差異基因的識別
    3.2 胰腺癌中差異基因的GO分析
    3.3 PPI網(wǎng)絡構建與模塊分析
    3.4 關鍵基因選擇和分析
4 討論
5 結論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻
綜述
    參考文獻
致謝
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本文編號：3166695