目的:通過生物信息學(xué)的方法,尋找在胰腺癌中差異表達(dá)的基因,同時(shí)分析差異表達(dá)基因在胰腺癌中生物學(xué)作用,探討其與胰腺癌的關(guān)系。方法:利用GEO數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)集尋找差異基因。利用DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行差異基因的生物學(xué)分析。利用STRING數(shù)據(jù)庫進(jìn)行蛋白相互作用分析,并用Cytoscape軟件識(shí)別蛋白互作網(wǎng)絡(luò)中最重要的模塊,篩選出關(guān)鍵基因并進(jìn)行功能富集分析。利用cBioPortal數(shù)據(jù)庫中腫瘤患者的臨床數(shù)據(jù),對(duì)關(guān)鍵基因進(jìn)行生存分析。同時(shí)利用Oncomine數(shù)據(jù)庫中數(shù)據(jù)集驗(yàn)證關(guān)鍵基因表達(dá)情況,并分析關(guān)鍵基因與腫瘤分級(jí)、分期、分子標(biāo)記和藥物敏感性的關(guān)系。結(jié)果:本研究從基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫（GEO）下載基因芯片GSE28735、GSE15471和GSE62452,以確定在胰腺癌癌變和進(jìn)展中起作用的候選基因。最初,在三個(gè)數(shù)據(jù)集中共鑒定出219個(gè)差異表達(dá)基因,其中161個(gè)上調(diào)基因,58個(gè)下調(diào)基因。通過富集分析確定了這些基因的功能和途徑。結(jié)果表明,差異基因參與了細(xì)胞粘附、細(xì)胞外基質(zhì)組織、蛋白水解、鈣離子結(jié)合、絲氨酸型內(nèi)肽酶活性、胞外小體、質(zhì)膜、胞外區(qū)和胞外間隙的變化。在此基礎(chǔ)上,構(gòu)建了蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò),并將... 

【文章來源】：中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】：42 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
英文縮略語
1 前言
2 資料與方法
    2.1 數(shù)據(jù)來源
    2.2 識(shí)別差異基因
    2.3 差異基因的KEGG和 GO富集分析
    2.4 PPI網(wǎng)絡(luò)建設(shè)與模塊分析
    2.5 關(guān)鍵基因的選擇和分析
3 結(jié)果
    3.1 胰腺癌中差異基因的識(shí)別
    3.2 胰腺癌中差異基因的GO分析
    3.3 PPI網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建與模塊分析
    3.4 關(guān)鍵基因選擇和分析
4 討論
5 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評(píng)價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)介



本文編號(hào)：3166695