【目的】鑒定龍眼SPL（DlSPL）基因家族所有成員,并對其成員進(jìn)行表達(dá)分析,為探究SPL在龍眼生長發(fā)育中的功能研究提供參考。【方法】采用生物信息學(xué)方法對龍眼SPL基因家族成員進(jìn)行鑒定,并對其基本理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系、啟動子順式作用元件、FPKM值進(jìn)行分析;利用qRT-PCR技術(shù)檢測其在非胚性愈傷組織（nonembryonic callus,NEC）、胚性培養(yǎng)物及不同激素處理下的胚性愈傷組織（embryonic callus,EC）中的表達(dá)情況。【結(jié)果】DlSPL基因家族共有14個成員,其基因結(jié)構(gòu)和蛋白結(jié)構(gòu)均高度保守且只有一個SBP結(jié)構(gòu)域,DlSPL啟動子存在大量的光反應(yīng)元件、組織特異性調(diào)控元件、激素應(yīng)答元件、脅迫響應(yīng)元件和植物生長發(fā)育有關(guān)的順式調(diào)控元件。RNA-seq表達(dá)量分析（FPKM值）表明,11個DlSPL成員在不同光質(zhì)處理的EC中表達(dá),只有DlSPL8在藍(lán)光和白光處理下的EC中呈下調(diào)表達(dá)趨勢;11個DlSPL成員在激素2,4-D和KT中表達(dá),其中DlSPL3和DlSPL13在2,4-D和激動素（kinetin,KT）共同處理下的表達(dá)量高于2,4-D和KT分開處理;... 

【文章來源】：中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,53(20)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：12 頁

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 龍眼Dl SPL家族成員的鑒定
        1.2.2 龍眼Dl SPL家族系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建
        1.2.3 龍眼Dl SPL家族基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)理化性質(zhì)及保守基序分析
        1.2.4 龍眼Dl SPL家族成員啟動子序列的獲得和分析
        1.2.5 基于轉(zhuǎn)錄組的Dl SPL家族FPKM值分析
        1.2.6 Dl SPL家族的q RT-PCR分析
2 結(jié)果
    2.1 龍眼Dl SPL家族成員鑒定及基本理化性質(zhì)分析
    2.2 Dl SPL基因家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
    2.3 Dl SPL家族基因結(jié)構(gòu)及保守基序分析
    2.4 龍眼Dl SPL基因家族啟動子元件分析
    2.5 Dl SPL家族在不同光質(zhì)下、不同激素處理以及非胚性及胚性培養(yǎng)物的RNA-Seq表達(dá)分析
    2.6 龍眼Dl SPL基因家族成員在非胚性及胚性培養(yǎng)物的中的q RT-PCR分析
    2.7 龍眼Dl SPL家族成員在ABA和Me JA處理下的q RT-PCR分析
3 討論
    3.1 龍眼DLSPL基因家族成員的分子特性
    3.2 DLSPL家族成員可能參與龍眼體胚發(fā)生過程
    3.3 龍眼Dl SPL家族響應(yīng)ABA和Me JA激素應(yīng)答
4 結(jié)論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號：3163060