【目的】鑒定龍眼SPL（DlSPL）基因家族所有成員,并對其成員進行表達分析,為探究SPL在龍眼生長發(fā)育中的功能研究提供參考。【方法】采用生物信息學方法對龍眼SPL基因家族成員進行鑒定,并對其基本理化性質、基因結構、系統(tǒng)進化關系、啟動子順式作用元件、FPKM值進行分析;利用qRT-PCR技術檢測其在非胚性愈傷組織（nonembryonic callus,NEC）、胚性培養(yǎng)物及不同激素處理下的胚性愈傷組織（embryonic callus,EC）中的表達情況。【結果】DlSPL基因家族共有14個成員,其基因結構和蛋白結構均高度保守且只有一個SBP結構域,DlSPL啟動子存在大量的光反應元件、組織特異性調控元件、激素應答元件、脅迫響應元件和植物生長發(fā)育有關的順式調控元件。RNA-seq表達量分析（FPKM值）表明,11個DlSPL成員在不同光質處理的EC中表達,只有DlSPL8在藍光和白光處理下的EC中呈下調表達趨勢;11個DlSPL成員在激素2,4-D和KT中表達,其中DlSPL3和DlSPL13在2,4-D和激動素（kinetin,KT）共同處理下的表達量高于2,4-D和KT分開處理;... 

【文章來源】：中國農業(yè)科學. 2020,53(20)北大核心CSCD

【文章頁數】：12 頁

【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 龍眼Dl SPL家族成員的鑒定
        1.2.2 龍眼Dl SPL家族系統(tǒng)進化樹的構建
        1.2.3 龍眼Dl SPL家族基因結構、蛋白質理化性質及保守基序分析
        1.2.4 龍眼Dl SPL家族成員啟動子序列的獲得和分析
        1.2.5 基于轉錄組的Dl SPL家族FPKM值分析
        1.2.6 Dl SPL家族的q RT-PCR分析
2 結果
    2.1 龍眼Dl SPL家族成員鑒定及基本理化性質分析
    2.2 Dl SPL基因家族的系統(tǒng)進化樹分析
    2.3 Dl SPL家族基因結構及保守基序分析
    2.4 龍眼Dl SPL基因家族啟動子元件分析
    2.5 Dl SPL家族在不同光質下、不同激素處理以及非胚性及胚性培養(yǎng)物的RNA-Seq表達分析
    2.6 龍眼Dl SPL基因家族成員在非胚性及胚性培養(yǎng)物的中的q RT-PCR分析
    2.7 龍眼Dl SPL家族成員在ABA和Me JA處理下的q RT-PCR分析
3 討論
    3.1 龍眼DLSPL基因家族成員的分子特性
    3.2 DLSPL家族成員可能參與龍眼體胚發(fā)生過程
    3.3 龍眼Dl SPL家族響應ABA和Me JA激素應答
4 結論


【參考文獻】：
期刊論文
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本文編號：3163060