發(fā)布時(shí)間：2021-04-26 01:17

　　目的:利用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)HBV相關(guān)肝細(xì)胞癌組織以及配對(duì)癌旁組織的mRNA進(jìn)行測(cè)序分析,篩選差異表達(dá)mRNA,并利用生物信息學(xué)手段分析差異表達(dá)mRNA,揭示肝細(xì)胞癌發(fā)生發(fā)展過(guò)程中可能的關(guān)鍵調(diào)控通路以及關(guān)鍵差異表達(dá)的mRNA,為下一步的研究打下基礎(chǔ)。方法:1.肝細(xì)胞癌差異表達(dá)mRNA分析。對(duì)HBV相關(guān)肝細(xì)胞癌以及配對(duì)癌旁組織進(jìn)行高通量測(cè)序（各3例）,計(jì)算mRNA表達(dá)量,篩選差異表達(dá)mRNA,構(gòu)建肝細(xì)胞癌mRNA差異表達(dá)譜。2.應(yīng)用生物信息學(xué)手段對(duì)差異表達(dá)的mRNA進(jìn)行分析。對(duì)差異表達(dá)的mRNA進(jìn)行GO功能富集分析﹑KEGG信號(hào)通路富集分析以及KO分析等,揭示差異mRNA可能存在差異的功能以及差異表達(dá)mRNA主要參與的代謝途徑和信號(hào)通路;結(jié)合富集分析的結(jié)果,篩選關(guān)鍵調(diào)控通路以及關(guān)鍵差異表達(dá)的mRNA。3.擴(kuò)大樣本量驗(yàn)證。對(duì)HBV相關(guān)肝細(xì)胞癌組織及其配對(duì)癌旁組織各8例,利用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)以及免疫組化技術(shù)對(duì)關(guān)鍵調(diào)控通路上的顯著差異mRNA在基因和蛋白水平上的表達(dá)進(jìn)行驗(yàn)證,為下一步研究打下基礎(chǔ)。結(jié)果:1.經(jīng)過(guò)高通量測(cè)序分析共篩選到2386個(gè)差異mRNA。其中癌旁組相對(duì)肝細(xì)胞癌組織組有11... 

【文章來(lái)源】：廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)

【文章頁(yè)數(shù)】：88 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
個(gè)人簡(jiǎn)歷
摘要
ABSTRACT
前言
技術(shù)路線(xiàn)
材料方法
結(jié)果
    1.樣本RNA的濃度、純度及完整性
    2.測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
    3.數(shù)據(jù)過(guò)濾
    4.堿基質(zhì)量分布
    5.堿基含量分布
    6.Reads平均質(zhì)量分布
    7.比對(duì)參考基因組分析
    8.基因覆蓋均一度
    9.PCA分析
    10.差異基因表達(dá)分析
    11.聚類(lèi)分析
    12.差異表達(dá)基因功能富集分析
    13.實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果
    14.免疫組化結(jié)果
討論
結(jié)論
創(chuàng)新性
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
致謝
攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]下調(diào)Claspin抑制肝癌增殖的研究[J]. 李娟,孫冉冉,孫繼紅,朱威威,宋瑞鵬,余祖江.  中華實(shí)驗(yàn)外科雜志. 2018 (09)
[2]Interaction of 14-3-3σ with KCMF1 suppresses the proliferation and colony formation of human colon cancer stem cells[J]. Jian Zou,Lin Mi,Xiao-Feng Yu,Jie Dong.  World Journal of Gastroenterology. 2013(24)
[3]基因芯片技術(shù)在植物基因克隆中的應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 孫兵,閆彩霞,張廷婷,鄭奕雄,畢玉平,陳高,單世華.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2009(01)
[4]The crystal structure of the non-liganded 14-3-3σ protein: insights into determinants of isoform specific ligand binding and dimerization[J]. Anne BENZINGER,Grzegorz M. POPOWICZ,Joma K. JOY,Sudipta MAJUMDAR,Tad A. HOLAK,Heiko HERMEKING.  Cell Research. 2005(04)
[5]The role of epigenetic inactivation of 14-3-3σ in human cancer[J]. Dmitri LODYGIN,Heiko HERMEKING.  Cell Research. 2005(04)

博士論文
[1]結(jié)腸癌相關(guān)差異性通路內(nèi)關(guān)鍵基因篩選和SFN基因功能研究[D]. 高峰.山東大學(xué) 2018

碩士論文
[1]14-3-3σ在UVB誘導(dǎo)的人表皮細(xì)胞輻射損傷中的作用及其機(jī)制的初步探討[D]. 黃海波.南方醫(yī)科大學(xué) 2016



本文編號(hào)：3160450