發(fā)布時(shí)間：2021-04-24 18:40

　　世系特異基因（Lineage-specific genes,LSGs）是一類特定的分類學(xué)限制蛋白編碼基因,它們和數(shù)據(jù)庫中任何其它蛋白質(zhì)或肽段編碼基因沒有顯著的序列相似性。LSGs也稱為孤兒基因或ORFans（孤兒開放式閱讀框）。隨著越來越多的物種基因組被測序,LSGs在病毒、微生物、低等海洋生物、植物、昆蟲和靈長類動物中都得到了研究。同時(shí),也證實(shí)了LSGs是迄今為止測序的所有基因組的重要組成部分。除了豐富性外,LSGs對世系特異的性狀和適應(yīng)性也有重要作用。另外,新基因的產(chǎn)生和世系特異的適應(yīng)性也存在很大相關(guān)性,而早期對于新基因的研究都集中在非編碼DNA序列中進(jìn)化出的新蛋白基因,很大程度上忽略了LSGs的進(jìn)化研究。先前一些個(gè)別昆蟲物種特異性基因的研究也表明了上述觀點(diǎn)。而鱗翅目昆蟲作為世界上最廣泛存在的昆蟲目之一,它們擁有龐大的家族成員,并且分布在除南極洲外的世界各地的其他各大洲,這些特征與它們的適應(yīng)性進(jìn)化是密不可分的。但是針對鱗翅目昆蟲的系統(tǒng)性的特異基因的研究還沒有見報(bào)道。本研究運(yùn)用生物信息學(xué)的方法第一次系統(tǒng)的鑒定了家蠶中鱗翅目特異的蛋白,并對其序列基本特征、染色體分布、表達(dá)模式以及個(gè)別基... 

【文章來源】：重慶大學(xué)重慶市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：129 頁

【學(xué)位級別】：博士

【文章目錄】：
中文摘要
英文摘要
縮略詞表
1 緒論
    1.1 前言
    1.2 世系特異基因
        1.2.1 世系特異基因的定義及其發(fā)現(xiàn)
        1.2.2 世系特異基因的鑒定
        1.2.3 世系特異基因的功能
        1.2.4 世系特異基因的起源
        1.2.5 昆蟲世系特異基因的研究概況
    1.3 水平基因轉(zhuǎn)移
        1.3.1 水平基因轉(zhuǎn)移的發(fā)現(xiàn)和發(fā)展
        1.3.2 功能性水平基因轉(zhuǎn)移
    1.4 4 ,5-多巴雙加氧酶的研究概況
    1.5 研究目的與意義
    1.6 研究內(nèi)容與技術(shù)路線
        1.6.1 研究內(nèi)容
        1.6.2 技術(shù)路線
2 鱗翅目特異蛋白的鑒定
    2.1 材料與方法
        2.1.1 數(shù)據(jù)收集和軟件
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.3 主要試劑
        2.1.4 分析、實(shí)驗(yàn)方法與步驟
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 鱗翅目特異蛋白的鑒定
        2.2.2 鱗翅目特異蛋白在家蠶染色體上分布
        2.2.3 家蠶中鱗翅目特異蛋白的特征分析
        2.2.4 家蠶中鱗翅目特異蛋白的功能注釋
        2.2.5 鱗翅目特異基因在家蠶中的時(shí)期表達(dá)模式
        2.2.6 家蠶中鱗翅目特異蛋白的系統(tǒng)發(fā)生分析
    2.3 總結(jié)與討論
3 家蠶BmDODA1基因的克隆及序列分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 數(shù)據(jù)庫和基因序列來源
        3.1.3 序列分析軟件
        3.1.4 主要試劑及配制
        3.1.5 主要實(shí)驗(yàn)儀器
        3.1.6 方法與步驟
    3.2 結(jié)果與分析
        3.2.1 家蠶BmDODA的共線性分析
        3.2.2 家蠶BmDODA1候選基因的鑒定
        3.2.3 BmDODA1全長cDNA序列的克隆
        3.2.4 BmDODA1的生物信息學(xué)分析
    3.3 總結(jié)與討論
4 家蠶BmDODA1的表達(dá)和純化
    4.1 材料與方法
        4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        4.1.2 載體和菌株
        4.1.3 主要試劑及配制
        4.1.4 主要實(shí)驗(yàn)儀器
        4.1.5 方法與步驟
    4.2 結(jié)果與分析
        4.2.1 家蠶BmDODA1重組表達(dá)載體的構(gòu)建
        4.2.2 BmDODA1的表達(dá)形式鑒定及條件優(yōu)化
        4.2.3 BmDODA1的蛋白純化
        4.2.4 BmDODA1抗體的制備和檢測
    4.3 總結(jié)與討論
5 家蠶中BmDODA1的表達(dá)模式及功能研究
    5.1 材料與方法
        5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        5.1.2 主要試劑及配制
        5.1.3 主要實(shí)驗(yàn)儀器
        5.1.4 方法與步驟
    5.2 結(jié)果與分析
        5.2.1 家蠶BmDODA1基因時(shí)空表達(dá)模式
        5.2.2 酶活性檢測
        5.2.3 酶活產(chǎn)物鑒定
    5.3 總結(jié)與討論
6 結(jié)論與展望
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄
    A 作者在攻讀博士學(xué)位期間發(fā)表的論文
    B 作者在攻讀博士學(xué)位期間參加的研究課題
    C 第二章節(jié)所用序列索引號
    D 原核表達(dá)載體結(jié)構(gòu)示意圖



本文編號：3157869