膨大彎頸霉（Tolypocladium inflatum）隸屬子囊菌門（Ascomycota）、糞殼菌綱（Sordariomycetes）、肉座菌目（Hypocreales）、線蟲草科（Ophiocordycipitaceae）、彎頸霉屬（Tolypocladium）。膨大彎頸霉是甲蟲幼蟲的病原菌,也是免疫抑制藥物環(huán)孢菌素（Cyclosporins）的生產(chǎn)菌^[1]。以往對膨大彎頸霉的研究工作主要集中在優(yōu)化環(huán)孢菌素的生產(chǎn)工藝上,而分子生物學(xué)方面的研究相對較少,GenBank中收錄的膨大彎頸霉基因組數(shù)據(jù)十分有限。我們首次完成膨大彎頸霉線粒體基因組的組裝和注釋工作。到目前為止,它的線粒體基因組是線蟲草科中最小的,全長僅25 kb。整個基因組排列緊湊,包含了所有標準的線粒體編碼基因,還含有一個內(nèi)含子。轉(zhuǎn)錄分析驗證了多數(shù)保守基因的表達。序列分析還發(fā)現(xiàn)線粒體基因向細胞核轉(zhuǎn)移的證據(jù)。通常認為,動物的mtDNA比nrDNA進化快,真菌中是否也如此還不確定。本課題組裝了5株膨大彎頸霉菌株的線粒體基因組,并且比較分析了線粒體基因組和核基因組核苷酸的變異情況。結(jié)果表明,5株菌線粒體基因... 

【文章來源】：山西大學(xué)山西省

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
ABSTRACT
第一章 緒論
    1.1 線粒體
        1.1.1 線粒體概述
        1.1.2 線粒體基因組概述
        1.1.3 真菌線粒體基因組組成與特征
        1.1.4 真菌線粒體基因組研究進展
    1.2 膨大彎頸霉概述
    1.3 研究目的和意義
    1.4 技術(shù)路線
第二章 膨大彎頸霉線粒體基因組測序及數(shù)據(jù)分析
    2.1 前言
    2.2 實驗材料、儀器和試劑
        2.2.1 實驗材料
        2.2.2 實驗儀器
        2.2.3 實驗試劑
    2.3 實驗方法
        2.3.1 菌株培養(yǎng)
        2.3.2 DNA的提取
        2.3.3 引物設(shè)計
        2.3.4 DNA片段的擴增
        2.3.5 轉(zhuǎn)錄組測序
        2.3.6 線粒體與細胞核間基因轉(zhuǎn)移驗證
        2.3.7 數(shù)據(jù)分析
    2.4 結(jié)果分析
        2.4.1 膨大彎頸霉線粒體基因組概述
        2.4.2 線粒體基因組核苷酸序列的堿基組成
        2.4.3 PCG氨基酸使用分析
        2.4.4 膨大彎頸霉線粒體基因組的重復(fù)元件
        2.4.5 膨大彎頸霉線粒體基因轉(zhuǎn)錄分析
        2.4.6 膨大彎頸霉線粒體基因組與核基因組的共有片段
        2.4.7 系統(tǒng)發(fā)育分析
    2.5 小結(jié)與討論
第三章 膨大彎頸霉比較基因組學(xué)分析
    3.1 前言
    3.2 實驗方法
        3.2.1 菌株培養(yǎng)
        3.2.2 原始數(shù)據(jù)處理
        3.2.3 可用數(shù)據(jù)分析
    3.3 實驗結(jié)果
        3.3.1 膨大彎頸霉線粒體基因組比較分析
        3.3.2 膨大彎頸霉核基因組比較分析
    3.4 小結(jié)與討論
第四章 膨大彎頸霉交配型的檢測與分析
    4.1 前言
    4.2 實驗材料
    4.3 實驗方法
        4.3.1 菌株培養(yǎng)
        4.3.2 基因組DNA提取
        4.3.3 引物設(shè)計
        4.3.4 交配型基因檢測
    4.4 實驗結(jié)果
        4.4.1 單子囊孢子菌株培養(yǎng)
        4.4.2 菌株交配型檢測結(jié)果
        4.4.3 交配型基因測序結(jié)果分析
    4.5 小結(jié)與討論
參考文獻
攻讀學(xué)位期間取得的硏究成果
致謝
個人簡況及聯(lián)系方式


【參考文獻】：
期刊論文
[1]子囊菌交配型基因MAT1-1的系統(tǒng)發(fā)育[J]. 王雪亮,史洋,張艷華,孫鳳杰,潘洪玉.  菌物學(xué)報. 2015(06)
[2]真菌線粒體基因組計劃的研究進展[J]. 劉沐桑,鄭楠,張原,劉維達.  國際皮膚性病學(xué)雜志. 2012 (05)
[3]線粒體基因組:結(jié)構(gòu)特點和基因含量進化[J]. 陳念,賴小平.  生物學(xué)雜志. 2011(01)
[4]蛹蟲草（Cordyceps militaris）的交配型研究[J]. 高新華.  食用菌學(xué)報. 2008(01)
[5]線粒體基因組（mtDNA）的研究進展[J]. 汪泰初,劉朝良,肖林珍.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2006(10)
[6]線粒體基因組的遺傳與進化研究進展[J]. 潘寶平,卜文俊.  生物學(xué)通報. 2005(08)
[7]線粒體DNA的研究與應(yīng)用[J]. 熊慶,劉作易,喻子牛.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2002(03)
[8]植物的線粒體基因組研究[J]. 崔萍,霍麗云.  山東輕工業(yè)學(xué)院學(xué)報(自然科學(xué)版). 2000(01)



本文編號：3156933