C2H2型鋅指（zinc finger, zf）蛋白具有識(shí)別與結(jié)合特異性DNA片段等功能,參與基因表達(dá)的調(diào)控。編碼zf-C2H2蛋白的基因以基因家族的形式存在。本研究通過(guò)比對(duì)已開(kāi)發(fā)的辣椒炭疽基因組數(shù)據(jù)查找到19個(gè)zf-C2H2基因家族成員,對(duì)其理化性質(zhì)、亞細(xì)胞定位、系統(tǒng)進(jìn)化、蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)的三級(jí)結(jié)構(gòu)、保守基序進(jìn)行分析。通過(guò)理化性質(zhì)分析,發(fā)現(xiàn)辣椒炭疽zf-C2H2蛋白多為堿性蛋白,氨基酸數(shù)目在386-985aa,蛋白質(zhì)等電點(diǎn)在6.05-10.04,分子量在42002.8-109661.9KD,亞細(xì)胞定位表明zf-C2H2蛋白全部定位于細(xì)胞核中。根據(jù)系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系可分為7個(gè)亞族,第4亞族和第7亞族基因的數(shù)量為2,其余的為3。通過(guò)對(duì)辣椒炭疽zf-C2H2蛋白的二級(jí)和三級(jí)結(jié)構(gòu)分析,發(fā)現(xiàn)zf-C2H2蛋白主要以無(wú)規(guī)卷曲為主,各個(gè)成員的二級(jí)結(jié)構(gòu)組成的排列順序?yàn)闊o(wú)規(guī)卷曲>α-螺旋>延伸鏈>β-折疊。根據(jù)保守基序分析,發(fā)現(xiàn)辣椒炭疽zf-C2H2蛋白的序列共含有8個(gè)保守基序,其中motif1在19條序列中都存在。研究結(jié)果為后續(xù)辣椒炭疽zf-C2H2蛋白的深入分析提供一定的科學(xué)依... 

【文章來(lái)源】：農(nóng)業(yè)技術(shù)與裝備. 2020,(07)

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辣椒炭疽zf-C2H2蛋白與鏈霉菌zf-C2H2構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)

鋅指蛋白（如zf-C2H2）轉(zhuǎn)錄因子在自然界中分布廣泛，且在基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中扮演重要角色。C2H2型鋅指蛋白是最常見(jiàn)的鋅指蛋白之一,對(duì)真核生物的生長(zhǎng)發(fā)育及逆境脅迫的耐受能力都有著重要作用[10]。楊明磊等人[11]在分析煙草C2H2鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子家族成員時(shí)指出，C2H2鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子家族編碼的轉(zhuǎn)錄因子具有多種生物學(xué)功能，其不僅與DNA、RNA相互作用，還與蛋白質(zhì)相互作用。目前國(guó)內(nèi)外對(duì)植物中尤其是擬南芥中的zf-C2H2蛋白分析較多，而對(duì)細(xì)菌內(nèi)存在的zf-C2H2蛋白研究較少。炭疽菌等細(xì)菌通過(guò)寄生作物而導(dǎo)致作物品質(zhì)、產(chǎn)量大幅下降。辣椒具有重要的藥用及食用價(jià)值，研究炭疽菌對(duì)其侵染寄生機(jī)制有助于辣椒種質(zhì)創(chuàng)新與育種改良。本研究采用生物信息學(xué)方法對(duì)辣椒炭疽zf-C2H2基因家族進(jìn)行了鑒定及分析，旨在為炭疽菌中鋅指蛋白參與的基因調(diào)控與寄生機(jī)制提供一定的科學(xué)依據(jù)。圖3 辣椒炭疽zf-C2H2基因家族蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)

辣椒炭疽zf-C2H2基因家族蛋白三級(jí)結(jié)構(gòu)

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]果梅NAC基因家族的鑒定及組織表達(dá)分析[J]. 姚丹,倪曉鵬,侍婷,倪照君,渠慎春,高志紅.  核農(nóng)學(xué)報(bào). 2019(02)
[2]番茄C2H2型鋅指蛋白的鑒定及生物信息學(xué)分析[J]. 胡軍華,王大偉,楊明磊,王新,朱海,朱佩,劉貫山.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(12)
[3]海南橡膠樹(shù)炭疽菌Colletotrichum siamense和C. fructicola的鑒定及系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 林春花,楊歡,趙曉宇,潘瀟涵,劉文波,繆衛(wèi)國(guó),鄭服叢.  熱帶作物學(xué)報(bào). 2018(01)
[4]煙草C2H2鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定與表達(dá)分析[J]. 楊明磊,晁江濤,王大偉,胡軍華,吳華,龔達(dá)平,劉貫山.  遺傳. 2016(04)
[5]碭山酥梨炭疽病發(fā)生特征與防治技術(shù)[J]. 高正輝,張金云,伊興凱,黃永豐,蔣書(shū)良.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(19)
[6]AP2功能基因在植物花發(fā)育中的重要作用[J]. 聞可心,劉雪梅.  生物技術(shù)通報(bào). 2010(02)
[7]兩種橡膠炭疽病菌生物學(xué)特性的比較[J]. 張春霞,李加智,何明霞,蔡志英.  西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2008(03)



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