C2H2型鋅指（zinc finger, zf）蛋白具有識別與結合特異性DNA片段等功能,參與基因表達的調控。編碼zf-C2H2蛋白的基因以基因家族的形式存在。本研究通過比對已開發(fā)的辣椒炭疽基因組數據查找到19個zf-C2H2基因家族成員,對其理化性質、亞細胞定位、系統(tǒng)進化、蛋白質的二級結構、蛋白質的三級結構、保守基序進行分析。通過理化性質分析,發(fā)現辣椒炭疽zf-C2H2蛋白多為堿性蛋白,氨基酸數目在386-985aa,蛋白質等電點在6.05-10.04,分子量在42002.8-109661.9KD,亞細胞定位表明zf-C2H2蛋白全部定位于細胞核中。根據系統(tǒng)進化關系可分為7個亞族,第4亞族和第7亞族基因的數量為2,其余的為3。通過對辣椒炭疽zf-C2H2蛋白的二級和三級結構分析,發(fā)現zf-C2H2蛋白主要以無規(guī)卷曲為主,各個成員的二級結構組成的排列順序為無規(guī)卷曲>α-螺旋>延伸鏈>β-折疊。根據保守基序分析,發(fā)現辣椒炭疽zf-C2H2蛋白的序列共含有8個保守基序,其中motif1在19條序列中都存在。研究結果為后續(xù)辣椒炭疽zf-C2H2蛋白的深入分析提供一定的科學依... 

【文章來源】：農業(yè)技術與裝備. 2020,(07)

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辣椒炭疽zf-C2H2蛋白與鏈霉菌zf-C2H2構建進化樹

鋅指蛋白（如zf-C2H2）轉錄因子在自然界中分布廣泛，且在基因調控網絡中扮演重要角色。C2H2型鋅指蛋白是最常見的鋅指蛋白之一,對真核生物的生長發(fā)育及逆境脅迫的耐受能力都有著重要作用[10]。楊明磊等人[11]在分析煙草C2H2鋅指蛋白轉錄因子家族成員時指出，C2H2鋅指蛋白轉錄因子家族編碼的轉錄因子具有多種生物學功能，其不僅與DNA、RNA相互作用，還與蛋白質相互作用。目前國內外對植物中尤其是擬南芥中的zf-C2H2蛋白分析較多，而對細菌內存在的zf-C2H2蛋白研究較少。炭疽菌等細菌通過寄生作物而導致作物品質、產量大幅下降。辣椒具有重要的藥用及食用價值，研究炭疽菌對其侵染寄生機制有助于辣椒種質創(chuàng)新與育種改良。本研究采用生物信息學方法對辣椒炭疽zf-C2H2基因家族進行了鑒定及分析，旨在為炭疽菌中鋅指蛋白參與的基因調控與寄生機制提供一定的科學依據。圖3 辣椒炭疽zf-C2H2基因家族蛋白三級結構

辣椒炭疽zf-C2H2基因家族蛋白三級結構

【參考文獻】：
期刊論文
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