家蠶微孢子蟲丙酮酸激酶基因的克隆分析與剪接因子的功能初探
發(fā)布時(shí)間:2021-04-02 17:33
微孢子蟲(Microsporidia)是寄生范圍廣的單細(xì)胞真核生物,家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)是家蠶主要的傳染性疾病微粒子病的病原體,給蠶業(yè)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。家蠶微孢子蟲體內(nèi)沒(méi)有三羧酸循環(huán),但具有糖酵解(Glycolysis)途徑。糖酵解過(guò)程中有三個(gè)關(guān)鍵反應(yīng),分別是葡萄糖在己糖激酶的作用下轉(zhuǎn)化為6-磷酸葡萄糖、6-磷酸果糖在磷酸果糖激酶的作用下轉(zhuǎn)化為1,6-二磷酸果糖以及磷酸烯醇式丙酮酸在丙酮酸激酶(Pyruvate kinase)的作用下轉(zhuǎn)化為丙酮酸,這三步均是不可逆反應(yīng)。剪接因子(Splicing factor)是真核生物中RNA編輯的重要元件,經(jīng)過(guò)剪接因子剪接可以產(chǎn)生許多具有功能的、帶有編碼信息的mRNA,對(duì)于生物體最基本的生命活動(dòng)至關(guān)重要,同時(shí)對(duì)于真核生物基因正確表達(dá)相應(yīng)蛋白也是不可或缺的一步。本課題對(duì)家蠶微孢子蟲丙酮酸激酶基因和剪接因子基因及二者所編碼的蛋白質(zhì)做了研究,得到如下結(jié)果:(1)通過(guò)檢索發(fā)現(xiàn)家蠶微孢子蟲的丙酮酸激酶共有兩個(gè)亞型,每個(gè)亞型各有3個(gè)拷貝。系統(tǒng)發(fā)育樹和多序列比對(duì)結(jié)果的表明,家蠶微孢子蟲丙酮酸激酶M2亞型的其中兩個(gè)拷貝(EOB11679...
【文章來(lái)源】:江蘇科技大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:94 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 微孢子蟲
1.2 微孢子蟲糖酵解途徑研究現(xiàn)狀
1.3 剪接因子研究現(xiàn)狀
1.4 研究意義
1.5 技術(shù)路線
第2章 家蠶微孢子蟲丙酮酸激酶的基因克隆與轉(zhuǎn)錄活性分析
2.1 材料與試劑
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料和試劑
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 主要試劑配制
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 生物信息學(xué)分析
2.2.2 NbPK-2基因克隆
2.2.3 NbPK-2轉(zhuǎn)錄活性分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
2.3.2 NbPK-2基因克隆結(jié)果
2.3.3 q-PCR測(cè)定微孢子蟲感染家蠶后不同時(shí)間段的NbPK-2 基因轉(zhuǎn)錄水平
2.4 討論
第3章 家蠶微孢子蟲的剪接因子的基因克隆與轉(zhuǎn)錄活性分析
3.1 材料與試劑
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料和試劑
3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
3.1.3 主要試劑配制
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 生物信息學(xué)分析
3.2.2 NbSF-1基因克隆
3.2.3 NbSF-1轉(zhuǎn)錄活性分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.3.2 NbSF-1基因克隆結(jié)果
3.3.3 q-PCR測(cè)定微孢子蟲感染家蠶后不同時(shí)間段的NbSF-1 基因轉(zhuǎn)錄水平
3.4 討論
第4章 家蠶微孢子蟲剪接因子的原核表達(dá)以及多克隆抗體的制備
4.1 材料與試劑
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料與試劑
4.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
4.1.3 主要試劑配制
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 構(gòu)建重組表達(dá)載體
4.2.2 小試表達(dá)目的蛋白
4.2.3 SDS-PAGE檢測(cè)蛋白表達(dá)
4.2.4 大量表達(dá)并純化目的蛋白
4.2.5 制備多克隆抗體
4.2.6 家蠶微孢子蟲的總蛋白的提取
4.3 結(jié)果與分析
4.4 討論
第5章 家蠶微孢子蟲剪接因子的亞細(xì)胞定位
5.1 材料及試劑
5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料與試劑
5.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
5.1.3 主要試劑配制
5.2 試驗(yàn)方法
5.2.1 間接免疫熒光實(shí)驗(yàn)
5.3 結(jié)果與分析
5.4 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄1 糖酵解模式圖
附錄2 pMD-19T載體質(zhì)粒圖譜
附錄3 pET-28a載體質(zhì)粒圖譜
附錄4 家蠶微孢子蟲丙酮酸激酶序列比對(duì)分析圖
附錄5 家蠶微孢子蟲剪接因子序列比對(duì)分析圖
附錄6 實(shí)驗(yàn)所用儀器匯總
注釋
攻讀碩士期間已發(fā)表論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]懷黃菊CmPAN基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 趙喜亭,劉克,朱玉婷,馬孟丹,呂萌,宋靈雨,蔣麗微,王苗,李明軍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]數(shù)據(jù)分析之單因素方差分析[J]. 牛凱. 產(chǎn)業(yè)與科技論壇. 2019(02)
[3]miRNA對(duì)虎龍斑補(bǔ)償生長(zhǎng)及非特異性免疫的影響研究[J]. 柳小春,秦慧,肖詩(shī)強(qiáng),張海發(fā),楊宇晴,劉蘇,石和榮,趙會(huì)宏. 海南熱帶海洋學(xué)院學(xué)報(bào). 2019(02)
[4]家蠶orcokinin基因的選擇性剪接與表達(dá)分析[J]. 王平陽(yáng),趙巧玲,裘智勇,沈興家,夏定國(guó). 蠶業(yè)科學(xué). 2018(06)
[5]野桑蠶br-c基因的克隆與序列分析[J]. 凌君,楚渠,彭云武. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(10)
[6]反式剪接及其在哺乳動(dòng)物中的作用[J]. 荊曉燕,張彩霞,宋艷芳,劉東宇,劉娣,楊秀芹. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(10)
[7]家蠶微孢子蟲極管蛋白1(NbPTP1)在果蠅S2細(xì)胞中的表達(dá)與糖基化修飾[J]. 龍夢(mèng)嫻,譚瑤瑤,劉柯柯,吳玉嬌,呂青,潘國(guó)慶,周澤揚(yáng). 生物工程學(xué)報(bào). 2018(09)
[8]玉米蛋白磷酸酶2C基因ZmPP2C26兩個(gè)可變剪接體的功能分析[J]. 張盼娃,張夏瑋,于好強(qiáng),盤林秀,付鳳玲,李晚忱. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(07)
[9]SPSS中單因素方差分析的運(yùn)用[J]. 何成. 農(nóng)業(yè)網(wǎng)絡(luò)信息. 2018(01)
[10]鱗翅目昆蟲病原微孢子蟲研究進(jìn)展[J]. 梁喜麗,魯興萌,邵勇奇. 微生物學(xué)報(bào). 2018(06)
博士論文
[1]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)休眠孢子和發(fā)芽孢子轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組定量差異分析及NbRBL蛋白功能的初步研究[D]. 劉涵.浙江大學(xué) 2016
[2]一種大豆固有無(wú)序蛋白-GmASR蛋白的多重保護(hù)功能研究[D]. 李冉輝.東北師范大學(xué) 2013
[3]柞蠶微孢子蟲檢測(cè)及感染柞蠶中腸轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 姜義仁.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)功能基因組研究[D]. 黨曉群.西南大學(xué) 2012
[5]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)功能基因組研究[D]. 林立鵬.西南大學(xué) 2012
[6]微孢子蟲感染家蠶相關(guān)基因的研究[D]. 邱海洪.浙江大學(xué) 2012
[7]二種大豆LEA4蛋白的金屬離子結(jié)合特性及對(duì)生物大分子的保護(hù)作用[D]. 劉國(guó)寶.東北師范大學(xué) 2011
[8]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)基因組學(xué)研究[D]. 劉含登.西南大學(xué) 2011
[9]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)線粒體相關(guān)基因研究[D]. 胡軍華.西南大學(xué) 2008
[10]家蠶微孢子(Nosema bombycis)全基因組結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)進(jìn)化分析[D]. 許金山.西南大學(xué) 2007
碩士論文
[1]家蠶BmYki不同剪接體的功能研究[D]. 陸亞紅.蘇州大學(xué) 2016
[2]微孢子蟲感染誘導(dǎo)的家蠶應(yīng)答反應(yīng)及對(duì)其免疫信號(hào)通路的激活[D]. 樂(lè)亞杰.江蘇科技大學(xué) 2015
[3]克雷伯肺炎桿菌葡萄糖氧化途徑的研究[D]. 王德信.燕山大學(xué) 2015
[4]家蠶正常蠶卵與感染微孢子蟲蠶卵的差異蛋白質(zhì)研究[D]. 姜春寶.重慶師范大學(xué) 2012
[5]全原子編碼方式預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的溶劑可及性[D]. 張曉朦.大連理工大學(xué) 2011
[6]家蠶微孢子蟲與菜粉蝶微孢子蟲的形態(tài)學(xué)與系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 徐小芳.江蘇科技大學(xué) 2011
[7]家蠶微粒子病免疫學(xué)快速檢測(cè)試紙條的研制[D]. 蘆琨.西南大學(xué) 2009
[8]家蠶微孢子蟲在昆蟲細(xì)胞中的增殖及CQ1株系建立的研究[D]. 賀偉偉.西南大學(xué) 2009
[9]家蠶微孢子蟲CQ1分離株的遺傳多態(tài)性研究[D]. 申子剛.西南大學(xué) 2008
[10]野油菜黃單胞菌EMP途徑相關(guān)基因的突變分析[D]. 胡江如.廣西大學(xué) 2007
本文編號(hào):3115668
【文章來(lái)源】:江蘇科技大學(xué)江蘇省
【文章頁(yè)數(shù)】:94 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1.1 微孢子蟲
1.2 微孢子蟲糖酵解途徑研究現(xiàn)狀
1.3 剪接因子研究現(xiàn)狀
1.4 研究意義
1.5 技術(shù)路線
第2章 家蠶微孢子蟲丙酮酸激酶的基因克隆與轉(zhuǎn)錄活性分析
2.1 材料與試劑
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料和試劑
2.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
2.1.3 主要試劑配制
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 生物信息學(xué)分析
2.2.2 NbPK-2基因克隆
2.2.3 NbPK-2轉(zhuǎn)錄活性分析
2.3 結(jié)果與分析
2.3.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
2.3.2 NbPK-2基因克隆結(jié)果
2.3.3 q-PCR測(cè)定微孢子蟲感染家蠶后不同時(shí)間段的NbPK-2 基因轉(zhuǎn)錄水平
2.4 討論
第3章 家蠶微孢子蟲的剪接因子的基因克隆與轉(zhuǎn)錄活性分析
3.1 材料與試劑
3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料和試劑
3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
3.1.3 主要試劑配制
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 生物信息學(xué)分析
3.2.2 NbSF-1基因克隆
3.2.3 NbSF-1轉(zhuǎn)錄活性分析
3.3 結(jié)果與分析
3.3.1 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.3.2 NbSF-1基因克隆結(jié)果
3.3.3 q-PCR測(cè)定微孢子蟲感染家蠶后不同時(shí)間段的NbSF-1 基因轉(zhuǎn)錄水平
3.4 討論
第4章 家蠶微孢子蟲剪接因子的原核表達(dá)以及多克隆抗體的制備
4.1 材料與試劑
4.1.1 實(shí)驗(yàn)材料與試劑
4.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
4.1.3 主要試劑配制
4.2 實(shí)驗(yàn)方法
4.2.1 構(gòu)建重組表達(dá)載體
4.2.2 小試表達(dá)目的蛋白
4.2.3 SDS-PAGE檢測(cè)蛋白表達(dá)
4.2.4 大量表達(dá)并純化目的蛋白
4.2.5 制備多克隆抗體
4.2.6 家蠶微孢子蟲的總蛋白的提取
4.3 結(jié)果與分析
4.4 討論
第5章 家蠶微孢子蟲剪接因子的亞細(xì)胞定位
5.1 材料及試劑
5.1.1 實(shí)驗(yàn)材料與試劑
5.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
5.1.3 主要試劑配制
5.2 試驗(yàn)方法
5.2.1 間接免疫熒光實(shí)驗(yàn)
5.3 結(jié)果與分析
5.4 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
附錄1 糖酵解模式圖
附錄2 pMD-19T載體質(zhì)粒圖譜
附錄3 pET-28a載體質(zhì)粒圖譜
附錄4 家蠶微孢子蟲丙酮酸激酶序列比對(duì)分析圖
附錄5 家蠶微孢子蟲剪接因子序列比對(duì)分析圖
附錄6 實(shí)驗(yàn)所用儀器匯總
注釋
攻讀碩士期間已發(fā)表論文
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]懷黃菊CmPAN基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 趙喜亭,劉克,朱玉婷,馬孟丹,呂萌,宋靈雨,蔣麗微,王苗,李明軍. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2019(04)
[2]數(shù)據(jù)分析之單因素方差分析[J]. 牛凱. 產(chǎn)業(yè)與科技論壇. 2019(02)
[3]miRNA對(duì)虎龍斑補(bǔ)償生長(zhǎng)及非特異性免疫的影響研究[J]. 柳小春,秦慧,肖詩(shī)強(qiáng),張海發(fā),楊宇晴,劉蘇,石和榮,趙會(huì)宏. 海南熱帶海洋學(xué)院學(xué)報(bào). 2019(02)
[4]家蠶orcokinin基因的選擇性剪接與表達(dá)分析[J]. 王平陽(yáng),趙巧玲,裘智勇,沈興家,夏定國(guó). 蠶業(yè)科學(xué). 2018(06)
[5]野桑蠶br-c基因的克隆與序列分析[J]. 凌君,楚渠,彭云武. 湖南農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(10)
[6]反式剪接及其在哺乳動(dòng)物中的作用[J]. 荊曉燕,張彩霞,宋艷芳,劉東宇,劉娣,楊秀芹. 畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2018(10)
[7]家蠶微孢子蟲極管蛋白1(NbPTP1)在果蠅S2細(xì)胞中的表達(dá)與糖基化修飾[J]. 龍夢(mèng)嫻,譚瑤瑤,劉柯柯,吳玉嬌,呂青,潘國(guó)慶,周澤揚(yáng). 生物工程學(xué)報(bào). 2018(09)
[8]玉米蛋白磷酸酶2C基因ZmPP2C26兩個(gè)可變剪接體的功能分析[J]. 張盼娃,張夏瑋,于好強(qiáng),盤林秀,付鳳玲,李晚忱. 西北農(nóng)林科技大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2018(07)
[9]SPSS中單因素方差分析的運(yùn)用[J]. 何成. 農(nóng)業(yè)網(wǎng)絡(luò)信息. 2018(01)
[10]鱗翅目昆蟲病原微孢子蟲研究進(jìn)展[J]. 梁喜麗,魯興萌,邵勇奇. 微生物學(xué)報(bào). 2018(06)
博士論文
[1]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)休眠孢子和發(fā)芽孢子轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組定量差異分析及NbRBL蛋白功能的初步研究[D]. 劉涵.浙江大學(xué) 2016
[2]一種大豆固有無(wú)序蛋白-GmASR蛋白的多重保護(hù)功能研究[D]. 李冉輝.東北師范大學(xué) 2013
[3]柞蠶微孢子蟲檢測(cè)及感染柞蠶中腸轉(zhuǎn)錄組及蛋白質(zhì)組學(xué)研究[D]. 姜義仁.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)功能基因組研究[D]. 黨曉群.西南大學(xué) 2012
[5]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)功能基因組研究[D]. 林立鵬.西南大學(xué) 2012
[6]微孢子蟲感染家蠶相關(guān)基因的研究[D]. 邱海洪.浙江大學(xué) 2012
[7]二種大豆LEA4蛋白的金屬離子結(jié)合特性及對(duì)生物大分子的保護(hù)作用[D]. 劉國(guó)寶.東北師范大學(xué) 2011
[8]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)基因組學(xué)研究[D]. 劉含登.西南大學(xué) 2011
[9]家蠶微孢子蟲(Nosema bombycis)線粒體相關(guān)基因研究[D]. 胡軍華.西南大學(xué) 2008
[10]家蠶微孢子(Nosema bombycis)全基因組結(jié)構(gòu)與系統(tǒng)進(jìn)化分析[D]. 許金山.西南大學(xué) 2007
碩士論文
[1]家蠶BmYki不同剪接體的功能研究[D]. 陸亞紅.蘇州大學(xué) 2016
[2]微孢子蟲感染誘導(dǎo)的家蠶應(yīng)答反應(yīng)及對(duì)其免疫信號(hào)通路的激活[D]. 樂(lè)亞杰.江蘇科技大學(xué) 2015
[3]克雷伯肺炎桿菌葡萄糖氧化途徑的研究[D]. 王德信.燕山大學(xué) 2015
[4]家蠶正常蠶卵與感染微孢子蟲蠶卵的差異蛋白質(zhì)研究[D]. 姜春寶.重慶師范大學(xué) 2012
[5]全原子編碼方式預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的溶劑可及性[D]. 張曉朦.大連理工大學(xué) 2011
[6]家蠶微孢子蟲與菜粉蝶微孢子蟲的形態(tài)學(xué)與系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 徐小芳.江蘇科技大學(xué) 2011
[7]家蠶微粒子病免疫學(xué)快速檢測(cè)試紙條的研制[D]. 蘆琨.西南大學(xué) 2009
[8]家蠶微孢子蟲在昆蟲細(xì)胞中的增殖及CQ1株系建立的研究[D]. 賀偉偉.西南大學(xué) 2009
[9]家蠶微孢子蟲CQ1分離株的遺傳多態(tài)性研究[D]. 申子剛.西南大學(xué) 2008
[10]野油菜黃單胞菌EMP途徑相關(guān)基因的突變分析[D]. 胡江如.廣西大學(xué) 2007
本文編號(hào):3115668
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