馬鈴薯蔗糖響應(yīng)基因StMYB44、StMYB44b的克隆及功能分析
發(fā)布時(shí)間:2021-04-01 18:38
MYB轉(zhuǎn)錄因子存在于所有真核生物中,是最具代表的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,廣泛參與植物發(fā)育、苯丙烷代謝、生物與非生物脅迫響應(yīng)、激素響應(yīng)以及細(xì)胞形態(tài)建成等過(guò)程。本研究以馬鈴薯‘青薯9號(hào)’的塊莖為實(shí)驗(yàn)材料,克隆了St MYB44、St MYB44b基因,并對(duì)其表達(dá)模式進(jìn)行分析,將構(gòu)建的表達(dá)載體轉(zhuǎn)化至同屬茄科的模式植物煙草中,分析不同蔗糖濃度下轉(zhuǎn)基因煙草的生長(zhǎng)情況,對(duì)St MYB44、St MYB44b基因進(jìn)行功能初探。主要結(jié)果如下:1、以馬鈴薯‘青薯9號(hào)’塊莖的c DNA為模板,克隆了St MYB44基因。St MYB44有2種類(lèi)型,CDS長(zhǎng)度為962 bp和953 bp,分別編碼320和317個(gè)氨基酸,為不穩(wěn)定的親水性蛋白;亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),St MYB44定位于細(xì)胞核;系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)和多序列比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),St MYB44與番茄MYB44的親緣關(guān)系最近,與橡膠樹(shù)的親緣關(guān)系較遠(yuǎn);啟動(dòng)子分析發(fā)現(xiàn),St MYB44含有多種調(diào)控元件,如光照、激素、脅迫響應(yīng)等;q RT-PCR分析發(fā)現(xiàn),St MYB44在花中表達(dá)最高,匍匐莖中最低;St MYB44在Me JA處理下,表達(dá)量先降低后升高,在8 h表達(dá)量最低;...
【文章來(lái)源】:青海大學(xué)青海省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:93 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
馬鈴薯塊莖的RNA
青海大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章馬鈴薯StMYB44、StMYB44b的克隆及表達(dá)分析24圖2.1馬鈴薯塊莖的RNAM:DL2000;1-2為塊莖RNAFig.2.1RNAofPotatoTuberM:DL2000;1-2asTuberRNA2)CDS的克隆以馬鈴薯‘青薯9號(hào)’塊莖的cDNA為模板,進(jìn)行特異性擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其片段的大小,結(jié)果如圖2.2所示,獲得一條約1000bp的條帶,與預(yù)期的StMYB44片段大小基本一致。將條帶切下,經(jīng)過(guò)回收、連接、轉(zhuǎn)化、篩菌并送生工測(cè)序后,將測(cè)序結(jié)果與NCBI中的原基因序列使用DNAMAN進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn),StMYB44存在2種類(lèi)型,分別命名為StMYB44-1和StMYB44-2。圖2.2StMYB44基因的CDS克隆M:DL2000;1:StMYB44
青海大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章馬鈴薯StMYB44、StMYB44b的克隆及表達(dá)分析25Fig2.2StMYB44geneCDScloningM:DL2000;1:StMYB442.4.1.2馬鈴薯StMYB44的生物信息學(xué)分析1)馬鈴薯StMYB44基因的序列分析如圖2.3所示,StMYB44-1與原序列(XM_006367359.2)一樣,CDS長(zhǎng)度為962bp,編碼的蛋白質(zhì)含有320個(gè)氨基酸,而StMYB44-2發(fā)生了11處堿基改變和9處堿基缺失,CDS長(zhǎng)度為953bp,編碼的蛋白質(zhì)含有317個(gè)氨基酸。StMYB44-1和StMYB44-2均含有兩個(gè)保守的MYB結(jié)構(gòu)域,為典型的R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子。圖2.3-1StMYB44基因的序列比對(duì)圖Fig2.3-1SequencealignmentofStMYB44gene
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]七種彩色馬鈴薯的蛋白質(zhì)營(yíng)養(yǎng)評(píng)價(jià)[J]. 徐麗珊,戴一輝,謝子玉,蒲首丞,程林潤(rùn). 浙江師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(01)
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[7]CaMV35S啟動(dòng)子及其在轉(zhuǎn)基因作物中的應(yīng)用和檢測(cè)[J]. 湯婷,謝實(shí)龍,祝旋,徐俊鋒,唐俊,汪小福. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(01)
[8]馬鈴薯淀粉合成與降解研究進(jìn)展[J]. 何虎翼,唐洲萍,楊鑫,樊吳靜,譚冠寧,李麗淑,何新民. 生物技術(shù)通報(bào). 2019(04)
[9]馬鈴薯淀粉物化特性分析及其對(duì)馬鈴薯熱干面品質(zhì)影響[J]. 蔡沙,施建斌,隋勇,何建軍,陳學(xué)玲,范傳會(huì),蔡芳,梅新. 現(xiàn)代食品科技. 2019(01)
[10]果實(shí)蔗糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究進(jìn)展[J]. 李馨玥,王愛(ài)德. 北方果樹(shù). 2018(05)
博士論文
[1]棉花GhMYB44, GhAP2和GhARC基因功能鑒定及CRISPR/Cas9全基因組脫靶分析[D]. HAKIM.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]蔗糖及茉莉酸信號(hào)在草莓果實(shí)發(fā)育中的作用及其機(jī)理分析[D]. 賈海鋒.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]植物黃酮類(lèi)化合物槲皮素與轉(zhuǎn)錄因子AtMYB44誘導(dǎo)和調(diào)控植物防衛(wèi)反應(yīng)的研究[D]. 賈振華.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
碩士論文
[1]蔗糖誘導(dǎo)馬鈴薯(S.tuberosum L.)試管薯形成的轉(zhuǎn)錄組分析與關(guān)鍵基因篩選[D]. 高小溪.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]棕色棉色素相關(guān)MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及功能研究[D]. 張小萌.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[3]蔗糖誘導(dǎo)CmFTL2調(diào)控夏菊開(kāi)花的分子機(jī)理研究[D]. 王恒.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]火龍果CAT基因在煙草中的遺傳轉(zhuǎn)化及功能分析[D]. 葛菲.貴州大學(xué) 2016
[5]StPP2C和StABF對(duì)馬鈴薯塊莖形成的影響[D]. 葉暉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]茉莉酸信號(hào)參與的馬鈴薯離體塊莖發(fā)育調(diào)控[D]. 李輝軍.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[7]轉(zhuǎn)錄因子AtMYB44促進(jìn)擬南芥抗病耐熱及抑制開(kāi)花的作用[D]. 田雙梅.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[8]蔗糖誘導(dǎo)馬鈴薯塊莖形成的信號(hào)分子功能研究[D]. 楊彩菊.云南師范大學(xué) 2006
本文編號(hào):3113799
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【部分圖文】:
馬鈴薯塊莖的RNA
青海大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章馬鈴薯StMYB44、StMYB44b的克隆及表達(dá)分析24圖2.1馬鈴薯塊莖的RNAM:DL2000;1-2為塊莖RNAFig.2.1RNAofPotatoTuberM:DL2000;1-2asTuberRNA2)CDS的克隆以馬鈴薯‘青薯9號(hào)’塊莖的cDNA為模板,進(jìn)行特異性擴(kuò)增,產(chǎn)物經(jīng)2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)其片段的大小,結(jié)果如圖2.2所示,獲得一條約1000bp的條帶,與預(yù)期的StMYB44片段大小基本一致。將條帶切下,經(jīng)過(guò)回收、連接、轉(zhuǎn)化、篩菌并送生工測(cè)序后,將測(cè)序結(jié)果與NCBI中的原基因序列使用DNAMAN進(jìn)行比較發(fā)現(xiàn),StMYB44存在2種類(lèi)型,分別命名為StMYB44-1和StMYB44-2。圖2.2StMYB44基因的CDS克隆M:DL2000;1:StMYB44
青海大學(xué)碩士學(xué)位論文第二章馬鈴薯StMYB44、StMYB44b的克隆及表達(dá)分析25Fig2.2StMYB44geneCDScloningM:DL2000;1:StMYB442.4.1.2馬鈴薯StMYB44的生物信息學(xué)分析1)馬鈴薯StMYB44基因的序列分析如圖2.3所示,StMYB44-1與原序列(XM_006367359.2)一樣,CDS長(zhǎng)度為962bp,編碼的蛋白質(zhì)含有320個(gè)氨基酸,而StMYB44-2發(fā)生了11處堿基改變和9處堿基缺失,CDS長(zhǎng)度為953bp,編碼的蛋白質(zhì)含有317個(gè)氨基酸。StMYB44-1和StMYB44-2均含有兩個(gè)保守的MYB結(jié)構(gòu)域,為典型的R2R3-MYB轉(zhuǎn)錄因子。圖2.3-1StMYB44基因的序列比對(duì)圖Fig2.3-1SequencealignmentofStMYB44gene
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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[7]CaMV35S啟動(dòng)子及其在轉(zhuǎn)基因作物中的應(yīng)用和檢測(cè)[J]. 湯婷,謝實(shí)龍,祝旋,徐俊鋒,唐俊,汪小福. 浙江農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2019(01)
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[9]馬鈴薯淀粉物化特性分析及其對(duì)馬鈴薯熱干面品質(zhì)影響[J]. 蔡沙,施建斌,隋勇,何建軍,陳學(xué)玲,范傳會(huì),蔡芳,梅新. 現(xiàn)代食品科技. 2019(01)
[10]果實(shí)蔗糖轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白研究進(jìn)展[J]. 李馨玥,王愛(ài)德. 北方果樹(shù). 2018(05)
博士論文
[1]棉花GhMYB44, GhAP2和GhARC基因功能鑒定及CRISPR/Cas9全基因組脫靶分析[D]. HAKIM.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
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碩士論文
[1]蔗糖誘導(dǎo)馬鈴薯(S.tuberosum L.)試管薯形成的轉(zhuǎn)錄組分析與關(guān)鍵基因篩選[D]. 高小溪.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[2]棕色棉色素相關(guān)MYB轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆及功能研究[D]. 張小萌.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
[3]蔗糖誘導(dǎo)CmFTL2調(diào)控夏菊開(kāi)花的分子機(jī)理研究[D]. 王恒.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[4]火龍果CAT基因在煙草中的遺傳轉(zhuǎn)化及功能分析[D]. 葛菲.貴州大學(xué) 2016
[5]StPP2C和StABF對(duì)馬鈴薯塊莖形成的影響[D]. 葉暉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
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[7]轉(zhuǎn)錄因子AtMYB44促進(jìn)擬南芥抗病耐熱及抑制開(kāi)花的作用[D]. 田雙梅.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[8]蔗糖誘導(dǎo)馬鈴薯塊莖形成的信號(hào)分子功能研究[D]. 楊彩菊.云南師范大學(xué) 2006
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