目的本研究著眼于從ctDNA角度揭示新疆維吾爾族非小細胞肺癌基因突變特征及遺傳學(xué)基礎(chǔ),利用最前沿、高靈敏度與特異性的ctDNA擴增和檢測技術(shù),其分析結(jié)果對闡釋新疆維吾爾族肺癌治療個體差異的分子遺傳機制具有重要基礎(chǔ)意義,亦為制定新疆維吾爾族非小細胞肺癌患者最佳個體化給藥方案提供遺傳藥理學(xué)依據(jù)和臨床思路。方法納入于2016-12-01至2017-11-31期間石河子大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院及喀什地區(qū)各級醫(yī)院收治的晚期非小細胞肺癌患者,維吾爾族非小細胞肺癌35例,漢族非小細胞肺癌63例,維吾爾族正常人群10例,漢族正常人群25例。對所有人群抽取血樣,保存血漿樣本,提取基因組DNA與cfDNA。采用DNA凝膠電泳檢測DNA質(zhì)量,cfDNA采用qubit檢測濃度,采用2100檢測濃度及片段大小。采用Illumina Hiseq 3000系統(tǒng)進行測序,測序后1021個基因的探針捕獲序列的方法進行捕獲。測序后獲得原始數(shù)據(jù)（raw reads）,經(jīng)過去污染等過濾、比對參考基因組,獲得比對到基因組上的Unique mapped reads。對數(shù)據(jù)進行標(biāo)準的信息分析流程,包括對SNP、InDel等進行檢測、... 

【文章來源】：華中科技大學(xué)湖北省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：95 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

方法總體流程圖

顯干式加熱器，溫度設(shè)置為 56 °C，開啟量準備相應(yīng)數(shù)量的 15 ml 離心管，管蓋標(biāo)的的 15 ml 離心管中加入適量的樣本（最ml/2 ml/3 ml,體積不足 1 ml/2 ml/3 ml 的樣/2ml/3ml 后再進行提取，以下以 3 ml 血漿加入 300 μl 蛋白酶 K ，蓋上蓋子，渦旋加入 2.4 ml BufferACL(含 1.0 μg [5.6 μl] 于 60 °C 水浴鍋中孵育 30 min；準備：準備 QIAamp Mini 核酸提取柱安ini 柱插入 VacConnector 后管蓋標(biāo)記樣本，管壁標(biāo)注樣本編號，管蓋標(biāo)記內(nèi)容包含

PTEN 和 RB1 突變占 12.5%，僅有 1 例（B14）患者檢測到 KRAS（p.G12D）突變（圖3.3-1）。圖 3.3-1 維吾爾族患者突變頻譜

【參考文獻】：
期刊論文
[1]新疆地區(qū)漢族和維吾爾族耳聾基因突變的比較研究[J]. 李琦,方如平,黃德亮,王國建,劉新,戴樸.  臨床耳鼻咽喉頭頸外科雜志. 2010(01)
[2]新疆地區(qū)維吾爾族和漢族非綜合征性耳聾GJB2基因突變研究[J]. 李琦,戴樸,黃德亮,王國建,朱慶文,韓東一,張勁,劉新.  中華醫(yī)學(xué)雜志. 2007(42)
[3]p53 Arg72Pro多態(tài)性與新疆維吾爾族和漢族婦女宮頸癌發(fā)生的相關(guān)性[J]. 鄭興征,楊安強,潘曉琳,鄭莉莉,周秋媛,李新敏,王曉凌,嚴麗華,李洪安.  中華病理學(xué)雜志. 2007(08)



本文編號：3090935