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雙線紫蛤COI基因序列多態(tài)性與水環(huán)境分析

發(fā)布時間:2021-03-16 07:50
  以雙線紫蛤(Soletellina diphos)為研究對象,測定南日島海區(qū)自然群體30枚個體的線粒體COI基因部分序列,研究其個體間的序列單核苷酸多態(tài)性(SNP),掌握雙線紫蛤的遺傳多樣性;統(tǒng)計南日島海域2008年4月—2018年12月期間海水樣品的鹽度、溫度、pH、溶解氧、葉綠素a、透明度、化學(xué)需氧量、無機(jī)氮、無機(jī)磷、石油類10項(xiàng)理化因子檢測結(jié)果,分析數(shù)據(jù)隨季節(jié)月份變化狀況,了解雙線紫蛤棲息地水環(huán)境。結(jié)果顯示,南日島雙線紫蛤群體30枚個體的序列中堿基T、C、A、G平均含量分別為41.95%、16.07%、18.53%、23.45%,(A+T)含量明顯高于(G+C)含量,共發(fā)現(xiàn)13個核苷酸多態(tài)位點(diǎn)(轉(zhuǎn)換/顛換偏倚率13.04),具有9個單倍型,有1個為引起亮氨酸/苯丙氨酸變化的非同義突變位點(diǎn),單倍型多樣性指數(shù)(Hd)為(0.598 0±0.103 0),核苷酸多樣性(Pi)為(0.002 9±0.000 6),平均核苷酸變異數(shù)(k)為1.912 6,表現(xiàn)出略高于標(biāo)準(zhǔn)值的單倍型多樣性和較低的核苷酸多樣性,個體間的遺傳距離為0~0.009 2、平均值為(0.002 9±0.001 0),... 

【文章來源】:漁業(yè)研究. 2020,42(04)

【文章頁數(shù)】:15 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 序列多態(tài)性
        1.2.2 棲息地水環(huán)境
2 結(jié)果
    2.1 序列多態(tài)性
    2.2 棲息地水環(huán)境
3 討論
    3.1 序列多態(tài)性
    3.2 棲息地水環(huán)境



本文編號:3085686

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