絞股藍(lán)轉(zhuǎn)錄組測序挖掘三萜合成基因與鯊烯合酶正選擇位點突變表達(dá)載體構(gòu)建
發(fā)布時間:2021-03-14 20:06
第一部分絞股藍(lán)轉(zhuǎn)錄組測序挖掘三萜合成通路及相關(guān)酶基因目的:通過對絞股藍(lán)(Gynostemma pentaphyllum(Thunb.)Makino,G.pentaphyllum)的根、莖和葉三個部位分別進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序分析,挖掘絞股藍(lán)三萜合成通路及相關(guān)酶基因。使用q PCR技術(shù)檢驗絞股藍(lán)三萜合成通路上呈現(xiàn)部位差異表達(dá)的法呢基焦磷酸合酶(Farnesyl diphosphate synthase,FPS)、鯊烯合酶(Squalene synthase,SS)和鯊烯環(huán)氧化酶(Squalene epoxidase,SE)基因在轉(zhuǎn)錄后水平的表達(dá),驗證它們在轉(zhuǎn)錄組測序分析中的表達(dá)規(guī)律。同時,使用紫外分光光度法測量三萜皂苷在根、莖和葉三個部位的含量差異,進(jìn)一步驗證FPS、SS和SE在根、莖和葉的表達(dá)差異。最后總結(jié)絞股藍(lán)FPS、SS和SE表達(dá)的部位差異性規(guī)律與三萜皂苷含量差異分布規(guī)律,為進(jìn)一步研究絞股藍(lán)三萜合成相關(guān)基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制做鋪墊。方法:分別提取絞股藍(lán)根、莖和葉三個部位的RNA并進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序反應(yīng),結(jié)合KEGG通路數(shù)據(jù)庫查找注釋文件當(dāng)中的絞股藍(lán)三萜合成關(guān)鍵酶基因FPS、SS和SE,尋找三個基因的...
【文章來源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:120 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
絞股藍(lán)根、莖和葉三部位RNA電泳圖(1-3分圖中,M泳道代表DL2000的DNAMaker,泳道1-9分別為葉1、葉2、莖2、葉3、莖3、莖1、根1、根2和根3的RNA;4分圖是TaKaRaDL2000
絞股藍(lán)三萜合成通路圖(英文縮寫注釋見附錄表1-1)
絞股藍(lán)根莖葉的FPS,SS和SE表達(dá)量RPKM值(G,J和Y分別代表絞股藍(lán)的根,莖和葉;
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HPLC法同時測定絞股藍(lán)藥材中8種皂苷的含量[J]. 蔣慧宣,陳粲文,徐茂保,張現(xiàn)濤. 廣州中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[2]絞股藍(lán)有效成分的藥理作用研究進(jìn)展[J]. 鮑鳳霞,陶泠雪,章海燕. 中國新藥與臨床雜志. 2018(01)
[3]不同加工方式絞股藍(lán)皂苷類成分比較研究[J]. 董利華,匡艷輝,范冬冬,蔣彤,陳兩綿,張東,朱晶晶,王智民,王德勤,李楚源. 中國中藥雜志. 2018(03)
[4]β-淀粉樣蛋白前體蛋白裂解酶1相關(guān)干預(yù)策略在阿爾采末病治療的研究進(jìn)展[J]. 黃娟,楊小惠,柳源,吳芹,石京山. 中國新藥與臨床雜志. 2017(07)
[5]在體單向腸灌流模型研究絞股藍(lán)皂苷的腸吸收特性[J]. 喻樊,湯新慧,周姝婷. 中國醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2017(12)
[6]絞股藍(lán)皂苷對癡呆小鼠認(rèn)知能力的作用及其機(jī)制[J]. 劉梅訊,孫天敏. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報. 2017(13)
[7]絞股藍(lán)化學(xué)成分及其藥理活性研究進(jìn)展[J]. 范冬冬,匡艷輝,向世勰,張東,朱晶晶,王智民,王德勤,李楚源. 中國藥學(xué)雜志. 2017(05)
[8]阿爾茨海默病與PRNP突變體小鼠動物模型[J]. 趙進(jìn),蔡兆偉,管峰. 中國實驗動物學(xué)報. 2016(05)
[9]紫外分光光度法測定減肥茶中絞股藍(lán)總皂苷的含量[J]. 李偉. 湖南中醫(yī)雜志. 2015(12)
[10]不同產(chǎn)地、不同品種間絞股藍(lán)總皂苷和總多糖含量比較研究[J]. 彭亮,李詒光,陳杰,饒毅,季巧遇,魏惠珍. 亞太傳統(tǒng)醫(yī)藥. 2015(22)
本文編號:3082871
【文章來源】:廣西醫(yī)科大學(xué)廣西壯族自治區(qū)
【文章頁數(shù)】:120 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
絞股藍(lán)根、莖和葉三部位RNA電泳圖(1-3分圖中,M泳道代表DL2000的DNAMaker,泳道1-9分別為葉1、葉2、莖2、葉3、莖3、莖1、根1、根2和根3的RNA;4分圖是TaKaRaDL2000
絞股藍(lán)三萜合成通路圖(英文縮寫注釋見附錄表1-1)
絞股藍(lán)根莖葉的FPS,SS和SE表達(dá)量RPKM值(G,J和Y分別代表絞股藍(lán)的根,莖和葉;
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]HPLC法同時測定絞股藍(lán)藥材中8種皂苷的含量[J]. 蔣慧宣,陳粲文,徐茂保,張現(xiàn)濤. 廣州中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報. 2018(02)
[2]絞股藍(lán)有效成分的藥理作用研究進(jìn)展[J]. 鮑鳳霞,陶泠雪,章海燕. 中國新藥與臨床雜志. 2018(01)
[3]不同加工方式絞股藍(lán)皂苷類成分比較研究[J]. 董利華,匡艷輝,范冬冬,蔣彤,陳兩綿,張東,朱晶晶,王智民,王德勤,李楚源. 中國中藥雜志. 2018(03)
[4]β-淀粉樣蛋白前體蛋白裂解酶1相關(guān)干預(yù)策略在阿爾采末病治療的研究進(jìn)展[J]. 黃娟,楊小惠,柳源,吳芹,石京山. 中國新藥與臨床雜志. 2017(07)
[5]在體單向腸灌流模型研究絞股藍(lán)皂苷的腸吸收特性[J]. 喻樊,湯新慧,周姝婷. 中國醫(yī)院藥學(xué)雜志. 2017(12)
[6]絞股藍(lán)皂苷對癡呆小鼠認(rèn)知能力的作用及其機(jī)制[J]. 劉梅訊,孫天敏. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報. 2017(13)
[7]絞股藍(lán)化學(xué)成分及其藥理活性研究進(jìn)展[J]. 范冬冬,匡艷輝,向世勰,張東,朱晶晶,王智民,王德勤,李楚源. 中國藥學(xué)雜志. 2017(05)
[8]阿爾茨海默病與PRNP突變體小鼠動物模型[J]. 趙進(jìn),蔡兆偉,管峰. 中國實驗動物學(xué)報. 2016(05)
[9]紫外分光光度法測定減肥茶中絞股藍(lán)總皂苷的含量[J]. 李偉. 湖南中醫(yī)雜志. 2015(12)
[10]不同產(chǎn)地、不同品種間絞股藍(lán)總皂苷和總多糖含量比較研究[J]. 彭亮,李詒光,陳杰,饒毅,季巧遇,魏惠珍. 亞太傳統(tǒng)醫(yī)藥. 2015(22)
本文編號:3082871
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