鵝HIF-1α基因克隆與組織表達(dá)分析
發(fā)布時間:2021-03-04 20:52
缺氧誘導(dǎo)因子-1(HIF-1)是在缺氧細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的一種轉(zhuǎn)錄因子,在生物體氧平衡調(diào)節(jié)中起關(guān)鍵作用.缺氧誘導(dǎo)因子-1α(HIF-1α)是HIF-1活化的關(guān)鍵調(diào)控因子,參與細(xì)胞的生長、分化和凋亡的調(diào)節(jié).為進(jìn)一步了解家鵝的缺氧應(yīng)答系統(tǒng),本研究參考NCBI上公布的鵝HIF-1α基因序列設(shè)計(jì)引物,并成功克隆了馬崗鵝HIF-1α mRNA,獲得了HIF-1α完整的ORF序列,全長為2 403 bp,編碼800個氨基酸.研究表明,馬崗鵝HIF-1α基因結(jié)構(gòu)保守,在家禽中的同源性較高且與雞的同源性最高達(dá)到94.1%,蛋白結(jié)構(gòu)主體包含螺旋-環(huán)-螺旋模式(Helix loop helix, HLH)、PAS(Per ARNT Sim)蛋白、PAC(Motif C-terminal to PAS motifs)等結(jié)構(gòu)域,符合HIF-1α蛋白的結(jié)構(gòu)特征.組織表達(dá)差異分析結(jié)果顯示HIF-1α基因在肺和胰腺表達(dá)高,在肌肉中表達(dá)低,在氣管中幾乎不表達(dá).
【文章來源】:仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院學(xué)報(bào). 2020,33(02)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
組織表達(dá)差異分析
用液氮研磨保存的鵝腦組織,提取RNA,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,利用設(shè)計(jì)的引物成功擴(kuò)增出一個片段,長度約為2 400 bp(圖1). 用cDNA作為模板,進(jìn)行多管擴(kuò)增,將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行膠回收,取回收產(chǎn)物4.5 μL連接T載體,搖菌13 h后抽取質(zhì)粒做酶切鑒定,送往Sangon生物公司進(jìn)行核苷酸序列測序,測序結(jié)果表明擴(kuò)增的目的基因片段大小為2 403 bp(圖2),經(jīng)BlastN比對發(fā)現(xiàn),與Genbank上公布的預(yù)測序列相符,證明已成功克隆鵝HIF-1α基因.克隆的鵝HIF-1α基因包含完整的ORF,長度為2 403 bp,編碼800個氨基酸.圖2 HIF-1α質(zhì)粒的酶切鑒定
HIF-1α質(zhì)粒的酶切鑒定
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]花鱸低氧誘導(dǎo)因子基因(hifs)的序列分析及低氧誘導(dǎo)表達(dá)[J]. 張凱強(qiáng),常志成,溫海深,李吉方,齊鑫,張曉燕,李昀. 中國海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(01)
[2]HIF-1通路在低氧調(diào)控神經(jīng)干細(xì)胞發(fā)育中的作用[J]. 趙名,范明,朱玲玲. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2019(11)
[3]HIF-1α和HIF-2α基因在藏綿羊不同組織中的表達(dá)及其意義[J]. 李少斌,焦丹,王繼卿,劉秀,羅玉柱. 中國草食動物科學(xué). 2016(03)
[4]缺氧誘導(dǎo)因子-1與炎癥關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 欒飛,王謹(jǐn)涵,李茂星,賈正平. 甘肅中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]藏羚羊低氧誘導(dǎo)因子1α基因的克隆與組織表達(dá)[J]. 劉芳,烏仁塔娜,馬蘭,楊應(yīng)忠,格日力. 生理學(xué)報(bào). 2011(06)
[6]低氧細(xì)胞應(yīng)激的HIF-1信號通路[J]. 王蘋蘋,孔繁平,陳學(xué)群,杜繼曾. 浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2011(05)
[7]誘導(dǎo)缺氧誘導(dǎo)因子1表達(dá)的相關(guān)因素[J]. 李麗華,張莉,屈藝,母得志. 醫(yī)學(xué)研究雜志. 2009(02)
[8]缺氧誘導(dǎo)因子-1與缺氧誘導(dǎo)因子-2同腫瘤關(guān)系的比較[J]. 楊盛力,張萬廣,陳孝平,梁慧芳. 肝膽外科雜志. 2007(06)
[9]青海家牦牛HIF-1α基因組織特異性表達(dá)[J]. 王德朋,李紅閣,郭松長,楊潔,祁得林,趙新全. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(29)
[10]雞缺氧誘導(dǎo)因子-1α基因的差異表達(dá)與低氧適應(yīng)性[J]. 王存芳,吳常信,李寧. 遺傳. 2007(01)
博士論文
[1]缺氧誘導(dǎo)因子-1α在紫外線誘導(dǎo)皮膚癌發(fā)生中的作用及其信號通路的研究[D]. 李燕華.南京醫(yī)科大學(xué) 2007
碩士論文
[1]HIF1A基因?qū)Ω咴哐獕河绊懸蛩匮芯縖D]. 張力平.青海師范大學(xué) 2015
本文編號:3063899
【文章來源】:仲愷農(nóng)業(yè)工程學(xué)院學(xué)報(bào). 2020,33(02)
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
組織表達(dá)差異分析
用液氮研磨保存的鵝腦組織,提取RNA,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,利用設(shè)計(jì)的引物成功擴(kuò)增出一個片段,長度約為2 400 bp(圖1). 用cDNA作為模板,進(jìn)行多管擴(kuò)增,將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行膠回收,取回收產(chǎn)物4.5 μL連接T載體,搖菌13 h后抽取質(zhì)粒做酶切鑒定,送往Sangon生物公司進(jìn)行核苷酸序列測序,測序結(jié)果表明擴(kuò)增的目的基因片段大小為2 403 bp(圖2),經(jīng)BlastN比對發(fā)現(xiàn),與Genbank上公布的預(yù)測序列相符,證明已成功克隆鵝HIF-1α基因.克隆的鵝HIF-1α基因包含完整的ORF,長度為2 403 bp,編碼800個氨基酸.圖2 HIF-1α質(zhì)粒的酶切鑒定
HIF-1α質(zhì)粒的酶切鑒定
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]花鱸低氧誘導(dǎo)因子基因(hifs)的序列分析及低氧誘導(dǎo)表達(dá)[J]. 張凱強(qiáng),常志成,溫海深,李吉方,齊鑫,張曉燕,李昀. 中國海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020(01)
[2]HIF-1通路在低氧調(diào)控神經(jīng)干細(xì)胞發(fā)育中的作用[J]. 趙名,范明,朱玲玲. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2019(11)
[3]HIF-1α和HIF-2α基因在藏綿羊不同組織中的表達(dá)及其意義[J]. 李少斌,焦丹,王繼卿,劉秀,羅玉柱. 中國草食動物科學(xué). 2016(03)
[4]缺氧誘導(dǎo)因子-1與炎癥關(guān)系的研究進(jìn)展[J]. 欒飛,王謹(jǐn)涵,李茂星,賈正平. 甘肅中醫(yī)藥大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(02)
[5]藏羚羊低氧誘導(dǎo)因子1α基因的克隆與組織表達(dá)[J]. 劉芳,烏仁塔娜,馬蘭,楊應(yīng)忠,格日力. 生理學(xué)報(bào). 2011(06)
[6]低氧細(xì)胞應(yīng)激的HIF-1信號通路[J]. 王蘋蘋,孔繁平,陳學(xué)群,杜繼曾. 浙江大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2011(05)
[7]誘導(dǎo)缺氧誘導(dǎo)因子1表達(dá)的相關(guān)因素[J]. 李麗華,張莉,屈藝,母得志. 醫(yī)學(xué)研究雜志. 2009(02)
[8]缺氧誘導(dǎo)因子-1與缺氧誘導(dǎo)因子-2同腫瘤關(guān)系的比較[J]. 楊盛力,張萬廣,陳孝平,梁慧芳. 肝膽外科雜志. 2007(06)
[9]青海家牦牛HIF-1α基因組織特異性表達(dá)[J]. 王德朋,李紅閣,郭松長,楊潔,祁得林,趙新全. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2007(29)
[10]雞缺氧誘導(dǎo)因子-1α基因的差異表達(dá)與低氧適應(yīng)性[J]. 王存芳,吳常信,李寧. 遺傳. 2007(01)
博士論文
[1]缺氧誘導(dǎo)因子-1α在紫外線誘導(dǎo)皮膚癌發(fā)生中的作用及其信號通路的研究[D]. 李燕華.南京醫(yī)科大學(xué) 2007
碩士論文
[1]HIF1A基因?qū)Ω咴哐獕河绊懸蛩匮芯縖D]. 張力平.青海師范大學(xué) 2015
本文編號:3063899
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/3063899.html
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