本研究以美系、丹系和加系三個(gè)品系的大白豬為實(shí)驗(yàn)對(duì)象:（1）共測(cè)定201頭三個(gè)品系大白豬個(gè)體的線粒體D-loop區(qū)核苷酸序列,結(jié)合從NCBI下載的227個(gè)來自中國(guó)、韓國(guó)、日本、俄羅斯以及印度尼西亞的野豬個(gè)體信息,分析三個(gè)品系間大白豬的遺傳多態(tài)性及親緣關(guān)系;（2）選取影響母豬產(chǎn)仔性狀的三個(gè)候選基因雌激素受體（ESR）、促卵泡激素β亞基（FSHβ）和催乳素受體（PRLR）,采用PCR擴(kuò)增及直接測(cè)序法對(duì)ESR基因的3號(hào)、6號(hào)以及8號(hào)外顯子區(qū)域、FSHβ基因的3號(hào)外顯子區(qū)域、PRLR基因的10號(hào)外顯子區(qū)域進(jìn)行SNPs位點(diǎn)檢測(cè),并將檢測(cè)到的SNPs位點(diǎn)與母豬產(chǎn)仔性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)性分析,從而篩選出有利于提高母豬產(chǎn)仔性狀的優(yōu)勢(shì)基因型。結(jié)果如下:（1）三個(gè)品系的大白豬親緣關(guān)系研究結(jié)果:在201頭大白豬D-loop區(qū)域中共檢測(cè)到了34個(gè)多態(tài)位點(diǎn),其中包括單一多態(tài)位點(diǎn)7個(gè),簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)27個(gè),檢測(cè)到19種單倍型,單倍型多樣性為0.891±0.008,核苷酸多樣性為0.01198±0.00034。系統(tǒng)發(fā)育分析表明三個(gè)品系大白豬間的種群分化情況不明顯,初步發(fā)現(xiàn)大白豬與中國(guó)、日本、韓國(guó)、俄羅斯等亞洲東北部地區(qū)豬種的遺... 

【文章來源】：四川農(nóng)業(yè)大學(xué)四川省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：79 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
符號(hào)說明
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 前言
    2 大白豬品種及不同品系介紹
        2.1 大白豬
        2.2 美系、丹系、加系大白豬
    3 分子標(biāo)記技術(shù)的研究概述
        3.1 擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性技術(shù)（AFLP）
        3.2 隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA技術(shù)（RAPD）
        3.3 限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性技術(shù)（RFLP）
        3.4 單核苷酸多態(tài)性（SNP）
        3.5 單鏈構(gòu)象多態(tài)性技術(shù)（SSCP）
        3.6 簡(jiǎn)單重復(fù)序列技術(shù)（SSR）
    4 線粒體基因研究概況
        4.1 線粒體D-loop基因簡(jiǎn)介
        4.2 線粒體基因多態(tài)性在豬種分子系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用
    5 雌激素受體基因（ESR）研究概況
        5.1 ESR基因的發(fā)現(xiàn)與結(jié)構(gòu)
        5.2 ESR的生物學(xué)作用
        5.3 ESR基因與產(chǎn)仔數(shù)性狀的相關(guān)性研究
    6 卵泡刺激素β亞基基因（FSHβ）研究概況
        6.1 FSHβ基因的發(fā)現(xiàn)與結(jié)構(gòu)
        6.2 FSHβ的生物學(xué)作用
        6.3 FSHβ基因與產(chǎn)仔數(shù)性狀的相關(guān)性研究
    7 催乳素受體基因（PRLR）研究概況
        7.1 PRLR基因的發(fā)現(xiàn)與結(jié)構(gòu)
        7.2 PRLR的生物學(xué)作用
        7.3 PRLR基因與產(chǎn)仔數(shù)性狀的相關(guān)性研究
    8 研究目的與意義
第二章 材料與方法
    1 試驗(yàn)材料
        1.1 試驗(yàn)動(dòng)物
        1.2 主要試驗(yàn)儀器及設(shè)備
        1.3 主要試驗(yàn)試劑及配制
        1.4 分析軟件
    2 試驗(yàn)方法及步驟
        2.1 基因組DNA提取
        2.2 DNA純度及濃度檢測(cè)
        2.3 目的片段PCR擴(kuò)增
    3 數(shù)據(jù)處理及分析
        3.1 遺傳多態(tài)性分析及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
        3.2 基因及基因型頻率計(jì)算
        3.3 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)
        3.4 多態(tài)信息含量（PIC）計(jì)算
        3.5 連鎖不平衡及單倍型構(gòu)建
        3.6 ESR、FSHβ、PRLR基因與產(chǎn)仔性狀的相關(guān)性分析
第三章 結(jié)果與分析
    1 毛囊基因組DNA提取效果
    2 線粒體基因D-loop區(qū)多態(tài)性及系統(tǒng)發(fā)育分析
        2.1 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
        2.2 遺傳多樣性分析
        2.3 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
    3 ESR基因多態(tài)性及關(guān)聯(lián)分析
        3.1 ESR基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
        3.2 ESR基因SNPs位點(diǎn)檢測(cè)
        3.3 ESR基因的等位基因頻率及基因型頻率
        3.4 ESR基因連鎖不平衡及單倍型分析
        3.5 ESR基因與大白豬產(chǎn)仔性狀的關(guān)聯(lián)性分析
    4 FSHβ基因多態(tài)性及關(guān)聯(lián)分析
        4.1 FSHβ基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
        4.2 FSHβ基因SNPs位點(diǎn)檢測(cè)
        4.3 FSHβ基因的等位基因頻率及基因型頻率
        4.4 FSHβ基因連鎖不平衡及單倍型分析
        4.5 FSHβ基因與大白豬產(chǎn)仔性狀的關(guān)聯(lián)性分析
    5 PRLR基因多態(tài)性及關(guān)聯(lián)分析
        5.1 PRLR基因PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
        5.2 PRLR基因SNPs位點(diǎn)檢測(cè)
        5.3 PRLR基因的等位基因頻率及基因型頻率
        5.4 PRLR基因連鎖不平衡及單倍型分析
        5.5 PRLR基因與大白豬產(chǎn)仔性狀的關(guān)聯(lián)性分析
第四章 討論
    1 關(guān)于毛囊基因組DNA提取
    2 線粒體DNA多態(tài)性
    3 ESR基因
        3.1 ESR基因多態(tài)性
        3.2 ESR基因與豬產(chǎn)仔性狀的關(guān)系
    4 FSHβ基因
        4.1 FSHβ基因多態(tài)性
        4.2 FSHβ基因與豬產(chǎn)仔性狀的關(guān)系
    5 PRLR基因
        5.1 PRLR基因多態(tài)性
        5.2 PRLR基因與豬產(chǎn)仔性狀的關(guān)系
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)歷


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]大白母豬PTGS2基因內(nèi)含子3的SNP檢測(cè)及其與繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析[J]. 高玉森,董新星,張燕林,蘭國(guó)湘,計(jì)春律,嚴(yán)達(dá)偉,茍瀟,李明麗,魯紹雄.  云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)). 2018(06)
[2]嘉興黑豬FSHβ和RFRP基因外顯子多態(tài)性與繁殖性狀的相關(guān)分析[J]. 吳芬,宋倩倩,李海虹,汪海峰,許明曙,劉國(guó)良,張金枝.  中國(guó)畜牧雜志. 2018(09)
[3]丹系母豬斷奶后發(fā)情和排卵規(guī)律的研究[J]. 趙云翔,鄧浩輝,黃山珊,張豪,馬胤,周玉,朱曉萍.  畜牧與獸醫(yī). 2018(04)
[4]FSH-β、PRLR和FUT1基因多態(tài)性與母豬繁殖性狀的關(guān)聯(lián)性分析[J]. 李夢(mèng)尋,胡九英,孫敬禮,魯慧文,汪德明,王忻,劉乙,馬力鵬,李濤,沈永巧,來紅霞,黃濤.  江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(03)
[5]大自然:丹系種豬營(yíng)養(yǎng)配方先行官[J]. 滿少鵬.  今日養(yǎng)豬業(yè). 2017(05)
[6]分子標(biāo)記技術(shù)在家禽育種中的應(yīng)用[J]. 魏倩倩.  農(nóng)民致富之友. 2017(17)
[7]大白豬ESR基因多態(tài)性與繁殖性狀的相關(guān)性研究[J]. 胡閃耀,姜佳佳,楊華,毛翠,毛慧敏,王利通,王國(guó)水,左波.  豬業(yè)科學(xué). 2017(07)
[8]FSHβ基因?qū)慕阖i母豬繁殖性能的影響[J]. 李俊,陳大芳,張勇,熊勝利,龍清孟,張雄,白優(yōu),陸靜,馮文武,李平,王燕,李波,侯萍.  養(yǎng)豬. 2017(03)
[9]PRLR和ITGB1基因多態(tài)性對(duì)大白豬繁殖性能的影響[J]. 沈永巧,胡九英,孫敬禮,魯慧文,汪德明,黃濤.  石河子大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2017(02)
[10]黑龍江省規(guī)模化豬場(chǎng)ESR基因多態(tài)性檢測(cè)分析[J]. 張冬杰,曹越,汪亮,劉娣.  黑龍江畜牧獸醫(yī). 2017(07)

博士論文
[1]豬PRLR基因和FSHβ亞基基因多態(tài)性研究[D]. 曹果清.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2004

碩士論文
[1]嘉興黑豬繁殖性狀相關(guān)基因ESR、FSHβ、PRLR多態(tài)性及其關(guān)聯(lián)分析研究[D]. 鐔忠斌.浙江農(nóng)林大學(xué) 2015
[2]3個(gè)豬種的PRLR和ESR基因多態(tài)性及其與繁殖性能的關(guān)聯(lián)分析[D]. 陳耀閩.福建農(nóng)林大學(xué) 2013
[3]豫南黑豬與引進(jìn)豬種FSHβ和PRLR基因多態(tài)性及其與繁殖性能的關(guān)聯(lián)性分析[D]. 馮富彥.河南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010



本文編號(hào)：3052627