JAM3基因在食管癌中的甲基化及表達(dá)調(diào)控
發(fā)布時(shí)間:2021-02-25 23:30
背景食管癌是常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率和死亡率在全球分別位居第7位和第6位。食管癌的分布具有地域性特點(diǎn),在我國(guó)食管癌主要分布在太行山地區(qū),食管鱗狀細(xì)胞癌(ESCC)是主要的病理類型。環(huán)境因素通過(guò)改變遺傳學(xué)和表觀遺傳學(xué)修飾在食管癌的發(fā)生、發(fā)展中起著重要的作用。連接黏附分子-3(JAM3)是JAM家族中的一員,又稱連接黏附分子-C(JAMC)。最近發(fā)現(xiàn)JAM3在結(jié)直腸癌中頻繁發(fā)生甲基化,且JAM3在結(jié)直腸癌中為抑癌基因,但是JAM3基因在食管癌中的甲基化情況尚不清楚。目的探討JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)在食管癌中的甲基化情況及其表達(dá)調(diào)控以及JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)異常甲基化作為食管鱗癌的潛在診斷標(biāo)志物的可能性。方法1.用半定量RT-PCR檢測(cè)5-氮雜-2’-脫氧胞苷(5-Aza-dc)處理前后食管癌細(xì)胞系KYSE140、KYSE150、KYSE410、KYSE450、COLO680N、KYSE520和TE13中JAM3基因的表達(dá)情況。2.應(yīng)用甲基化特異性PCR(MSP)檢測(cè)食管癌細(xì)胞系中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化狀態(tài)。3.用MSP技術(shù)檢測(cè)正常食管粘膜組織中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化狀態(tài),排除JA...
【文章來(lái)源】:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
-Aza-dc處理前后食管癌細(xì)胞系中JAM3的表達(dá)情況;
25胞中JAM3表達(dá)水平不變,KYSE150、KYSE410、COLO680N、TE13細(xì)胞JAM3表達(dá)恢復(fù)(見(jiàn)圖2.1)。上述結(jié)果表明JAM3基因在食管癌細(xì)胞系中的表達(dá)受到甲基化的調(diào)控。圖2.15-Aza-dc處理前后食管癌細(xì)胞系中JAM3的表達(dá)情況;(-)未處理的細(xì)胞系;(+):處理的細(xì)胞系;ddH2O:雙蒸餾水,作為空白對(duì)照,排除體系污染;GAPDH:作為參照檢測(cè)cDNA質(zhì)量;KYSE520、KYSE140、KYSE450、KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150為人的食管癌細(xì)胞系名稱2.2食管癌細(xì)胞中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況2.2.1對(duì)照組DNA對(duì)甲基化特異性PCR的引物及體系進(jìn)行驗(yàn)證我們應(yīng)用JAM3基因特異性的甲基化的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增之后,MSP檢測(cè)硫化后IVD和NL,結(jié)果顯示:硫化后IVD為甲基化所對(duì)應(yīng)的清晰明亮條帶,硫化后NL無(wú)甲基化對(duì)應(yīng)條帶;JAM3基因特異性的非甲基化的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增之后,MSP檢測(cè)硫化后IVD和NL,結(jié)果顯示:僅以硫化后的NL為非甲基化清晰明亮條帶,硫化后IVD無(wú)非甲基化所對(duì)應(yīng)的條帶出現(xiàn)。陰性對(duì)照即雙蒸餾水中無(wú)任何條帶出現(xiàn)(見(jiàn)圖2.2)。上述結(jié)果表明:JAM3的MSP引物具有特異性,反應(yīng)體系無(wú)污染。圖2.2MSP檢測(cè)對(duì)照組DNAJAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況IVD:體外甲基化DNA;ddH2O:雙蒸餾水;NL:正常人外周血淋巴細(xì)胞DNA;M:甲基化;U:非甲基化;
262.2.2食管癌細(xì)胞系中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況本實(shí)驗(yàn)所應(yīng)用MSP技術(shù)檢測(cè)JAM3基因啟動(dòng)區(qū)在食管癌細(xì)胞系中甲基化情況。MSP檢測(cè)結(jié)果示:JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)在細(xì)胞KYSE520、KYSE140、KYSE450表現(xiàn)為非甲基化;在細(xì)胞KYSE150、KYSE410、TE13、COLO680N中呈完全甲基化狀態(tài)(見(jiàn)圖2.3)。圖2.3MSP檢測(cè)食管癌細(xì)胞系JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況IVD:體外甲基化DNA;ddH2O:雙蒸餾水;NL:正常人外周血淋巴細(xì)胞DNA;M:甲基化;U:非甲基化;KYSE520、KYSE140、KYSE450、KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150為人的食管癌細(xì)胞系名稱2.2.3正常食管黏膜中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化狀態(tài)本研究應(yīng)用MSP技術(shù)對(duì)5例正常食管黏膜組織中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化狀態(tài)進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示正常食管黏膜組織中JAM3均為非甲基化,排除了JAM3基因甲基化的組織特異性(見(jiàn)圖3.1)。圖3.1MSP檢測(cè)正常食管粘膜組織中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基情況IVD:體外甲基化DNA;ddH2O:雙蒸餾水;NL:正常人外周血淋巴細(xì)胞DNA;EN1-EN5:正常食管黏膜組織;M:甲基化;U:非甲基化
本文編號(hào):3051738
【文章來(lái)源】:新鄉(xiāng)醫(yī)學(xué)院河南省
【文章頁(yè)數(shù)】:57 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
-Aza-dc處理前后食管癌細(xì)胞系中JAM3的表達(dá)情況;
25胞中JAM3表達(dá)水平不變,KYSE150、KYSE410、COLO680N、TE13細(xì)胞JAM3表達(dá)恢復(fù)(見(jiàn)圖2.1)。上述結(jié)果表明JAM3基因在食管癌細(xì)胞系中的表達(dá)受到甲基化的調(diào)控。圖2.15-Aza-dc處理前后食管癌細(xì)胞系中JAM3的表達(dá)情況;(-)未處理的細(xì)胞系;(+):處理的細(xì)胞系;ddH2O:雙蒸餾水,作為空白對(duì)照,排除體系污染;GAPDH:作為參照檢測(cè)cDNA質(zhì)量;KYSE520、KYSE140、KYSE450、KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150為人的食管癌細(xì)胞系名稱2.2食管癌細(xì)胞中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況2.2.1對(duì)照組DNA對(duì)甲基化特異性PCR的引物及體系進(jìn)行驗(yàn)證我們應(yīng)用JAM3基因特異性的甲基化的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增之后,MSP檢測(cè)硫化后IVD和NL,結(jié)果顯示:硫化后IVD為甲基化所對(duì)應(yīng)的清晰明亮條帶,硫化后NL無(wú)甲基化對(duì)應(yīng)條帶;JAM3基因特異性的非甲基化的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增之后,MSP檢測(cè)硫化后IVD和NL,結(jié)果顯示:僅以硫化后的NL為非甲基化清晰明亮條帶,硫化后IVD無(wú)非甲基化所對(duì)應(yīng)的條帶出現(xiàn)。陰性對(duì)照即雙蒸餾水中無(wú)任何條帶出現(xiàn)(見(jiàn)圖2.2)。上述結(jié)果表明:JAM3的MSP引物具有特異性,反應(yīng)體系無(wú)污染。圖2.2MSP檢測(cè)對(duì)照組DNAJAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況IVD:體外甲基化DNA;ddH2O:雙蒸餾水;NL:正常人外周血淋巴細(xì)胞DNA;M:甲基化;U:非甲基化;
262.2.2食管癌細(xì)胞系中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況本實(shí)驗(yàn)所應(yīng)用MSP技術(shù)檢測(cè)JAM3基因啟動(dòng)區(qū)在食管癌細(xì)胞系中甲基化情況。MSP檢測(cè)結(jié)果示:JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)在細(xì)胞KYSE520、KYSE140、KYSE450表現(xiàn)為非甲基化;在細(xì)胞KYSE150、KYSE410、TE13、COLO680N中呈完全甲基化狀態(tài)(見(jiàn)圖2.3)。圖2.3MSP檢測(cè)食管癌細(xì)胞系JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化情況IVD:體外甲基化DNA;ddH2O:雙蒸餾水;NL:正常人外周血淋巴細(xì)胞DNA;M:甲基化;U:非甲基化;KYSE520、KYSE140、KYSE450、KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150為人的食管癌細(xì)胞系名稱2.2.3正常食管黏膜中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化狀態(tài)本研究應(yīng)用MSP技術(shù)對(duì)5例正常食管黏膜組織中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化狀態(tài)進(jìn)行檢測(cè),結(jié)果顯示正常食管黏膜組織中JAM3均為非甲基化,排除了JAM3基因甲基化的組織特異性(見(jiàn)圖3.1)。圖3.1MSP檢測(cè)正常食管粘膜組織中JAM3基因啟動(dòng)子區(qū)域的甲基情況IVD:體外甲基化DNA;ddH2O:雙蒸餾水;NL:正常人外周血淋巴細(xì)胞DNA;EN1-EN5:正常食管黏膜組織;M:甲基化;U:非甲基化
本文編號(hào):3051738
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