Prodiginine基因簇在異源放線菌中的表達
發(fā)布時間:2021-02-20 19:17
次級代謝產物在我們生活的許多方面都發(fā)揮著重要的作用,特別在醫(yī)療藥物領域,目前近三分之二的治療藥物來源于直接分離的次級代謝產物或是其相關的衍生物。隨著基因測序技術的發(fā)展,放線菌基因組數據的積累,放線菌巨大的次級代謝產物生產潛能被再次發(fā)現。但放線菌內蘊含的大量次級代謝基因多數處于沉默狀態(tài),或是表達產量過低又無法進行遺傳操作改造菌株以提高產量等困難使得放線菌的生產潛能不能被有效開發(fā)。因此產生的異源表達技術——將異源基因組導入宿主細胞內進行表達,能進一步開發(fā)放線菌的次級代謝產物生產潛能,是目前激活沉默基因簇的重要手段。利用antiSMASH對菌株NA03103的基因組進行分析得到23個次級代謝基因簇信息。其中基因簇ucp經過基因比對發(fā)現與化合物marineosins的生物合成基因簇mar高度相似。為排除原菌株復雜代謝背景對檢測該基因簇產物的影響,選擇構建表達質粒在異源宿主中表達的方法來確認其功能。成功構建菌株NA03103的cosmid文庫,利用PCR技術篩選得到包含該基因簇生物合成必須基因的cosmid質粒23H-3,最終在異源宿主S.ablu 中表達獲得產物undecylprodigios...
【文章來源】:南京大學江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:83 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-3NA03103中i/cp基因簇與基因簇比對結果??
?M?NOPQRTVVZYW?X?D??■?biosynthetic?genes?■?other?genes?[稼丨?regulatory?genes??圖2-3NA03103中i/cp基因簇與基因簇比對結果??marineosin?A?marineosin?B??圖2-4化合物marineosins的結構??表2-1基因簇wcp的基因注釋結果??.??identities/??protein?aa?homologous?protein?protein?id??positives??ucpA?690?DNA-binding?protein?KDN77539.1?90/94??ucpB?37?hypothetical?protein?EHN75379.i?92/97??ucpE?295?marE,?Putative?acyltransferase?AHF22860.1?77/86??ucpC?226?hypothetical?protein?PHR91277.1?39/58??ucpG?408?marG,?oxidase?AHF22859.1?64/80??ucpH?933?marH,?phosphoenolpyruvate-utilizing?enzyme?AHF22858.1?70/80??ucpl?362?marl,?methyltransferase?AHF22857.1?71/83??ucpJ?280?marJ,?thioesterase?WP?099878120.1?61/67??ucpK?346?marK
圖2-6Cosmid質粒23H-3在S.aW似中異源表達的結果??
本文編號:3043224
【文章來源】:南京大學江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數】:83 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-3NA03103中i/cp基因簇與基因簇比對結果??
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圖2-6Cosmid質粒23H-3在S.aW似中異源表達的結果??
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