Prodiginine基因簇在異源放線菌中的表達(dá)
發(fā)布時(shí)間:2021-02-20 19:17
次級(jí)代謝產(chǎn)物在我們生活的許多方面都發(fā)揮著重要的作用,特別在醫(yī)療藥物領(lǐng)域,目前近三分之二的治療藥物來(lái)源于直接分離的次級(jí)代謝產(chǎn)物或是其相關(guān)的衍生物。隨著基因測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,放線菌基因組數(shù)據(jù)的積累,放線菌巨大的次級(jí)代謝產(chǎn)物生產(chǎn)潛能被再次發(fā)現(xiàn)。但放線菌內(nèi)蘊(yùn)含的大量次級(jí)代謝基因多數(shù)處于沉默狀態(tài),或是表達(dá)產(chǎn)量過(guò)低又無(wú)法進(jìn)行遺傳操作改造菌株以提高產(chǎn)量等困難使得放線菌的生產(chǎn)潛能不能被有效開發(fā)。因此產(chǎn)生的異源表達(dá)技術(shù)——將異源基因組導(dǎo)入宿主細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行表達(dá),能進(jìn)一步開發(fā)放線菌的次級(jí)代謝產(chǎn)物生產(chǎn)潛能,是目前激活沉默基因簇的重要手段。利用antiSMASH對(duì)菌株NA03103的基因組進(jìn)行分析得到23個(gè)次級(jí)代謝基因簇信息。其中基因簇ucp經(jīng)過(guò)基因比對(duì)發(fā)現(xiàn)與化合物marineosins的生物合成基因簇mar高度相似。為排除原菌株復(fù)雜代謝背景對(duì)檢測(cè)該基因簇產(chǎn)物的影響,選擇構(gòu)建表達(dá)質(zhì)粒在異源宿主中表達(dá)的方法來(lái)確認(rèn)其功能。成功構(gòu)建菌株NA03103的cosmid文庫(kù),利用PCR技術(shù)篩選得到包含該基因簇生物合成必須基因的cosmid質(zhì)粒23H-3,最終在異源宿主S.ablu 中表達(dá)獲得產(chǎn)物undecylprodigios...
【文章來(lái)源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-3NA03103中i/cp基因簇與基因簇比對(duì)結(jié)果??
?M?NOPQRTVVZYW?X?D??■?biosynthetic?genes?■?other?genes?[稼丨?regulatory?genes??圖2-3NA03103中i/cp基因簇與基因簇比對(duì)結(jié)果??marineosin?A?marineosin?B??圖2-4化合物marineosins的結(jié)構(gòu)??表2-1基因簇wcp的基因注釋結(jié)果??.??identities/??protein?aa?homologous?protein?protein?id??positives??ucpA?690?DNA-binding?protein?KDN77539.1?90/94??ucpB?37?hypothetical?protein?EHN75379.i?92/97??ucpE?295?marE,?Putative?acyltransferase?AHF22860.1?77/86??ucpC?226?hypothetical?protein?PHR91277.1?39/58??ucpG?408?marG,?oxidase?AHF22859.1?64/80??ucpH?933?marH,?phosphoenolpyruvate-utilizing?enzyme?AHF22858.1?70/80??ucpl?362?marl,?methyltransferase?AHF22857.1?71/83??ucpJ?280?marJ,?thioesterase?WP?099878120.1?61/67??ucpK?346?marK
圖2-6Cosmid質(zhì)粒23H-3在S.aW似中異源表達(dá)的結(jié)果??
本文編號(hào):3043224
【文章來(lái)源】:南京大學(xué)江蘇省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:83 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2-3NA03103中i/cp基因簇與基因簇比對(duì)結(jié)果??
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圖2-6Cosmid質(zhì)粒23H-3在S.aW似中異源表達(dá)的結(jié)果??
本文編號(hào):3043224
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