為揭示鰻鱺養(yǎng)殖環(huán)境中抗生素抗性基因（Antibiotic resistance genes,ARGs）的賦存特征,采集鰻鱺養(yǎng)殖環(huán)境樣品（底泥和養(yǎng)殖水）,利用高通量測序技術(shù)及功能宏基因組學(xué)分析方法對鰻鱺養(yǎng)殖環(huán)境中的ARGs種類和豐度進行研究。結(jié)果顯示:鰻鱺養(yǎng)殖底泥和養(yǎng)殖水中的優(yōu)勢菌群結(jié)構(gòu)組成具有明顯差異,底泥的優(yōu)勢群體門類為Proteobacteria、Chloroflexi、Actinobacteria、Cyanobacteria、Gemmatimonadetes和Bacteroidetes;養(yǎng)殖水中的優(yōu)勢菌群門類為Proteobacteria、Bacteroidetes和Verrucomicrobia。比對抗性基因數(shù)據(jù)庫,在底泥中共存在10類38種ARGs,在養(yǎng)殖水中共注釋得到9類29種ARGs,其中高豐度的抗性類型為四環(huán)素類、磺胺類和桿菌肽類抗生素。研究結(jié)果可為抗生素在鰻鱺養(yǎng)殖過程中合理使用提供參考依據(jù),同時也顯示宏基因組測序技術(shù)在檢測環(huán)境ARGs的可行性和優(yōu)越性。 

【文章來源】：福建農(nóng)業(yè)科技. 2020,(09)

【文章頁數(shù)】：5 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 基因組DNA提取
    1.3 Illumina測序及高通量數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
    2.1 高通量測序序列數(shù)據(jù)分析
    2.2 鰻鱺養(yǎng)殖環(huán)境菌群結(jié)構(gòu)和多樣性分析
    2.3 鰻鱺養(yǎng)殖環(huán)境微生物基因組抗性基因分析結(jié)果
3 討論


【參考文獻】：
期刊論文
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[3]養(yǎng)殖水域抗生素抗性基因污染的研究概況與展望[J]. 李云莉,高權(quán)新,張晨捷,施兆鴻,彭士明,王建鋼.  海洋漁業(yè). 2017(03)
[4]環(huán)境微生物的抗生素抗性和抗性組[J]. 田寶玉,馬榮琴.  中國生物工程雜志. 2015(10)

博士論文
[1]低劑量抗生素刺激條件下耐藥基因水平傳播的機制研究[D]. 魯曦.華南理工大學(xué) 2012



本文編號：3022706