大豆實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的篩選與驗證
發(fā)布時間:2021-02-04 09:11
選擇合適的內(nèi)參基因可以提高定量分析中目標(biāo)基因表達(dá)的準(zhǔn)確性。本研究選取大豆(Glycine max)不同發(fā)育時期的18個組織樣本,利用實時熒光定量PCR技術(shù),分析了大豆60S、ABC、ACT2/7、ACT11、CYP2、ELF1A、ELF1B、Fbox、G6PD、MTP、PEPKR1、TUB4、TUA5、UBC4等14個內(nèi)參基因在不同組織中表達(dá)量的變化,并利用geNorm、NormFinder和BestKeeper三種軟件對各基因在四個重要發(fā)育時期以及在葉片組織中的表達(dá)穩(wěn)定性進(jìn)行了評價。研究表明:大豆內(nèi)參基因Fbox、ABC、G6PD和ACT11分別為出苗期(VE)、第一片三葉期(V1)、始花期(R1)和初莢期(R3)最穩(wěn)定的內(nèi)參基因; 60S為葉片組織中最穩(wěn)定的內(nèi)參基因;在全部樣本的整體評價中, Fbox為最穩(wěn)定的內(nèi)參基因。此外,通過分析大豆噻唑合成酶基因GmPGL1的表達(dá)量,進(jìn)一步證明了內(nèi)參基因篩選結(jié)果的可靠性和在大豆基因表達(dá)分析中的適用性。本研究為準(zhǔn)確定量分析大豆關(guān)鍵發(fā)育時期不同組織中的基因表達(dá)提供參考基因。
【文章來源】:植物生理學(xué)報. 2020,56(09)北大核心
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 實驗方法
1.2.1 總RNA提取及c DNA合成
1.2.2 引物設(shè)計合成與驗證
1.2.3 RT-qPCR
1.2.4 內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性分析
2 實驗結(jié)果
2.1 內(nèi)參基因特異性驗證
2.2 內(nèi)參基因在不同發(fā)育時期不同組織中表達(dá)量分析
2.3 候選內(nèi)參基因穩(wěn)定性分析
2.3.1 ge Norm軟件分析
2.3.2 Norm Finder軟件分析
2.3.3 Best Keeper軟件分析
2.3.4 Ref Finder分析
2.4 內(nèi)參基因驗證
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米粗縮病誘導(dǎo)下實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的選擇[J]. 代資舉,王艷,王新濤,楊青,張瑩瑩,李保全,王立平. 植物生理學(xué)報. 2019(10)
[2]板栗實時定量PCR內(nèi)參基因的篩選與驗證[J]. 陳國松,李靖同,劉陽,曹慶芹,張卿,秦嶺,邢宇. 植物生理學(xué)報. 2019(03)
[3]黃梁木實時熒光定量PCR分析中內(nèi)參基因的選擇[J]. 張登,李景劍,張夢潔,包鈺韜,楊霄,徐武云,歐陽昆唏,陳曉陽. 植物學(xué)報. 2018(06)
[4]核桃內(nèi)參基因?qū)崟r熒光定量PCR表達(dá)穩(wěn)定性評價[J]. 李雪,潘學(xué)軍,張文娥,張睿,陳靜. 植物生理學(xué)報. 2017(09)
[5]柑橘內(nèi)參基因的穩(wěn)定性評價[J]. 肖翠,嚴(yán)佳文,龍桂友,戴素明,李大志,鄧子牛. 果樹學(xué)報. 2012(06)
本文編號:3018073
【文章來源】:植物生理學(xué)報. 2020,56(09)北大核心
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 實驗方法
1.2.1 總RNA提取及c DNA合成
1.2.2 引物設(shè)計合成與驗證
1.2.3 RT-qPCR
1.2.4 內(nèi)參基因表達(dá)穩(wěn)定性分析
2 實驗結(jié)果
2.1 內(nèi)參基因特異性驗證
2.2 內(nèi)參基因在不同發(fā)育時期不同組織中表達(dá)量分析
2.3 候選內(nèi)參基因穩(wěn)定性分析
2.3.1 ge Norm軟件分析
2.3.2 Norm Finder軟件分析
2.3.3 Best Keeper軟件分析
2.3.4 Ref Finder分析
2.4 內(nèi)參基因驗證
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]玉米粗縮病誘導(dǎo)下實時熒光定量PCR內(nèi)參基因的選擇[J]. 代資舉,王艷,王新濤,楊青,張瑩瑩,李保全,王立平. 植物生理學(xué)報. 2019(10)
[2]板栗實時定量PCR內(nèi)參基因的篩選與驗證[J]. 陳國松,李靖同,劉陽,曹慶芹,張卿,秦嶺,邢宇. 植物生理學(xué)報. 2019(03)
[3]黃梁木實時熒光定量PCR分析中內(nèi)參基因的選擇[J]. 張登,李景劍,張夢潔,包鈺韜,楊霄,徐武云,歐陽昆唏,陳曉陽. 植物學(xué)報. 2018(06)
[4]核桃內(nèi)參基因?qū)崟r熒光定量PCR表達(dá)穩(wěn)定性評價[J]. 李雪,潘學(xué)軍,張文娥,張睿,陳靜. 植物生理學(xué)報. 2017(09)
[5]柑橘內(nèi)參基因的穩(wěn)定性評價[J]. 肖翠,嚴(yán)佳文,龍桂友,戴素明,李大志,鄧子牛. 果樹學(xué)報. 2012(06)
本文編號:3018073
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