發(fā)布時(shí)間：2021-02-04 06:59

　　非特異性脂類轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白（nsLTP）是植物特有的一類蛋白,其生物學(xué)功能具有多樣性。nsLTP基因能夠促進(jìn)脂類物質(zhì)的跨膜轉(zhuǎn)運(yùn),從而參與植株對(duì)逆境條件的抗性、促進(jìn)豆科植物根瘤的形成、促進(jìn)花粉管伸長(zhǎng)等。目前,在其它作物中已經(jīng)對(duì)nsLTP家族基因進(jìn)行了較為系統(tǒng)的研究,并篩選和驗(yàn)證了 一些具有重要生物學(xué)功能的家族成員。棉花是重要的經(jīng)濟(jì)作物,棉纖維是世界上最重要的天然紡織原料。然而,對(duì)nsLTP基因在棉花發(fā)育過程中的作用仍然報(bào)道較少,少數(shù)研究表明,nsLTP可能與棉纖維伸長(zhǎng)相關(guān)。本研究利用已經(jīng)完成全基因組測(cè)序的三個(gè)棉種基因組數(shù)據(jù),結(jié)合相應(yīng)生物信息學(xué)分析方法技術(shù),分別鑒定、分析了三個(gè)棉種中nsLTP家族基因及系統(tǒng)進(jìn)化特征,對(duì)陸地棉nsLTP基因表達(dá)特征進(jìn)行了分析驗(yàn)證,篩選了可能參與棉花非生物脅迫抗性及棉纖維起始發(fā)育過程的nsLTP基因。1.利用生物信息學(xué)分析方法在陸地棉、亞洲棉、雷蒙德氏棉三個(gè)棉種分別獲得了153、76、83個(gè)nsLTP家族基因成員。根據(jù)nsLTP家族基因系統(tǒng)分類法將陸地棉nsLTP基因分為14類,每類基因都對(duì)應(yīng)地包含了相似的保守特征。Ka/Ks分析顯示,nsLTP家族基因在進(jìn)化上非常... 

【文章來源】：南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：104 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
本文所用主要縮略詞
第一部分 文獻(xiàn)綜述
    第一章 植物nsLTP基因家族研究進(jìn)展
        1 nsLTP基因的系統(tǒng)分類
        2 nsLTP的結(jié)構(gòu)特征
        3 植物中nsLTP基因的克隆、鑒定概況
        4 nsLTP基因的表達(dá)模式
            4.1 nsLTP基因的時(shí)空表達(dá)特異性
            4.2 nsLTP基因的逆境、激素誘導(dǎo)表達(dá)
        5 nsLTP基因的亞細(xì)胞定位
        6 nsLTP基因的生物學(xué)功能
            6.1 nsLTP基因與非生物脅迫
            6.2 nsLTP基因與生物脅迫
            6.3 nsLTP基因與有性生殖
            6.4 nsLTP基因與根瘤形成
            6.5 nsLTP基因與信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
            6.6 nsLTP基因與細(xì)胞生長(zhǎng)
            6.7 nsLTP基因與過敏反應(yīng)
        7 nsLTP家族基因的進(jìn)化
        8 棉花中nsLTP基因研究進(jìn)展
本研究的目的和意義
第二部分 研究報(bào)告
    第二章 棉花中nsLTP家族基因的鑒定和分析
        1 材料與方法
            1.1 基因組數(shù)據(jù)準(zhǔn)備
            1.2 棉花nsLTP家族基因鑒定流程
            1.3 nsLTP序列分析
            1.4 進(jìn)化樹重構(gòu)
            1.5 nsLTP重復(fù)基因分析
            1.6 陸地棉nsLTP基因GO富集
            1.7 陸地棉nsLTP基因啟動(dòng)子分析
        2 結(jié)果與分析
            2.1 nsLTP基因系統(tǒng)分類統(tǒng)計(jì)
            2.2 nsLTP基因分類ECM結(jié)構(gòu)特征統(tǒng)計(jì)
            2.3 棉花nsLTP同源命名
            2.4 nsLTP基因家族重復(fù)基因分析
            2.5 nsLTP家族基因進(jìn)化樹
            2.6 已報(bào)道陸地棉nsLTP基因分析
            2.7 陸地棉nsLTP基因GO富集分析
            2.8 陸地棉順式調(diào)控元件分析
        3 討論
            3.1 nsLTP家族基因的系統(tǒng)分類方法
            3.2 nsLTP家族基因的進(jìn)化組成
    第三章 陸地棉nsLTP基因表達(dá)分析及其驗(yàn)證
        1 材料與方法
            1.1 植物材料
            1.2 RNA提取和第一鏈cDNA合成
            1.3 定量引物設(shè)計(jì)驗(yàn)證
            1.4 實(shí)時(shí)熒光定量qRT-PCR分析
            1.5 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析方法
        2 結(jié)果與分析
            2.1 nsLTP在陸地棉組織中表達(dá)分析
            2.2 nsLTP基因在纖維突變體中表達(dá)分析
            2.3 nsLTP在干旱、高鹽脅迫下表達(dá)分析
        3 討論
            3.1 數(shù)據(jù)均一化方法選擇
            3.2 nsLTP基因系統(tǒng)分類和表達(dá)特征聚類
            3.3 nsLTP基因表達(dá)特征分析驗(yàn)證
全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]棉花LTPG基因家族的蛋白結(jié)構(gòu)與基因表達(dá)分析[J]. 鄧婷,王勁,王俊,周玉梅,左開井.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2015(02)
[2]陸地棉LTP家族基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 韓慧超,黃逸群,王勁,左開井.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科技導(dǎo)報(bào). 2013(03)
[3]Discovery,Identification and Comparative Analysis of Non-Specific Lipid Transfer Protein （nsLtp） Family in Solanaceae[J]. Wanfei Liu1,2, Dawei Huang1,2, Kan Liu1,2, Songnian Hu1, Jun Yu1, Gang Gao3, and Shuhui Song1 1Key Laboratory of Genome Sciences and Information, Beijing Institute of Genomics, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100029, China; 2Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China; 3College of Life Sciences, Shanxi Normal University, Linfen 041004, China..  Genomics, Proteomics & Bioinformatics. 2010(04)
[4]花生脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白家族基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 趙傳志,李愛芹,王興軍,夏晗,蘇磊,李長(zhǎng)生.  花生學(xué)報(bào). 2009(04)
[5]Analysis of Five Differentially Expressed Gene Families in Fast Elongating Cotton Fiber[J]. Jian-Xun FENG, Sheng-Jian JI, Yong-Hui SHI, Yu XU, Gang WEI, and Yu-Xian ZHU( National Laboratory of Protein Engineering and Plant Genetic Engineering, College of Life Sciences, Peking University, Beijing 100871, China ).  Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 2004(01)

博士論文
[1]三個(gè)D組棉花葉綠體全基因組測(cè)序及其進(jìn)化研究[D]. Farshid Talat.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2013

碩士論文
[1]轉(zhuǎn)脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因山新楊抗逆性分析[D]. 李健.東北林業(yè)大學(xué) 2010
[2]植物非特異性脂轉(zhuǎn)移蛋白基因的多抗性功能初步研究[D]. 鄭明.吉林大學(xué) 2009



本文編號(hào)：3017925