目的尋找結(jié)腸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的相關(guān)風(fēng)險(xiǎn)基因,并構(gòu)建由基因組成的列線(xiàn)圖（nomogram）預(yù)測(cè)模型。方法從TCGA和GEO數(shù)據(jù)庫(kù)下載基因測(cè)序數(shù)據(jù),利用差異分析和LASSO回歸方法篩選基因。利用赤池信息準(zhǔn)則確定最優(yōu)的nomogram模型,ROC曲線(xiàn)、校準(zhǔn)曲線(xiàn)及擬合優(yōu)度檢驗(yàn)評(píng)估模型預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性,決策曲線(xiàn)分析評(píng)估臨床應(yīng)用價(jià)值。結(jié)果通過(guò)篩選得到11個(gè)有效預(yù)測(cè)結(jié)腸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的基因。由年齡、病理T分期、TH、CDH4、PNMA6A、TNNC1、KIR2DL4、STUM、SFTA2構(gòu)成的nomogram模型具有最小的AIC值（440.4）。內(nèi)部評(píng)估模型AUC值為0.800,外部驗(yàn)證AUC值為0.664,校準(zhǔn)度及擬合優(yōu)度均較佳。臨床決策曲線(xiàn)分析法評(píng)估基于nomogram模型的風(fēng)險(xiǎn)判斷可以帶來(lái)臨床獲益。結(jié)論共篩選出11個(gè)結(jié)腸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的風(fēng)險(xiǎn)基因。構(gòu)建的nomogram預(yù)測(cè)模型的一致性和區(qū)分度良好,可幫助評(píng)估患者淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)。 

【文章來(lái)源】：腫瘤防治研究. 2020,47(12)

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

差異表達(dá)基因及GESA功能富集分析

LASSO回歸法篩選關(guān)鍵基因

淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移對(duì)結(jié)腸癌預(yù)后的重要影響已被多項(xiàng)研究報(bào)道，伴有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的患者較淋巴結(jié)陰性的患者生存更差，復(fù)發(fā)率也更高[18]。許多臨床病理因素可能對(duì)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)有重要影響。Yamaok等[19]發(fā)現(xiàn)，隨著結(jié)腸癌浸潤(rùn)深度的增加，淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移率也逐漸升高。易小龍等[20]也發(fā)現(xiàn)腫瘤浸潤(rùn)深度與分化程度是影響結(jié)腸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的獨(dú)立因素。值得注意的是，在我們的研究中，<60歲組患者的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移率高于≥60歲組，這可能與兩組人群具有不同的臨床特征有關(guān)[21]。影像學(xué)判斷結(jié)腸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與否具有一定的局限性，通過(guò)聯(lián)合其他指標(biāo)可進(jìn)一步提高術(shù)前診斷淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的準(zhǔn)確性。因此，本研究的nomogram模型可進(jìn)一步協(xié)助臨床醫(yī)生判斷淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移情況。由于基因間可能存在很強(qiáng)的共線(xiàn)性，且考慮到結(jié)局事件數(shù)（淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移數(shù)）遠(yuǎn)大于自變量數(shù)量，本研究先采用LASSO回歸進(jìn)行降維，尋找差異基因中與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移最為相關(guān)的基因。當(dāng)一組基因高度相關(guān)時(shí)，LASSO回歸會(huì)選出其中一個(gè)基因并且將其他因子收縮為零。LASSO回歸最終鑒定了11個(gè)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移狀態(tài)高度相關(guān)的蛋白編碼基因。單、多因素分析提示僅KIR2DL4基因的高表達(dá)可能與抑制淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)。KIR2DL4基因編碼殺傷細(xì)胞免疫球蛋白受體（killer-cell immunoglobulin-like receptor,KIR），在自然殺傷（natural killing,NK）細(xì)胞表面和少數(shù)T淋巴細(xì)胞表面表達(dá)，可識(shí)別并結(jié)合HLA-G分子，從而發(fā)揮對(duì)NK細(xì)胞的免疫抑制或激活的雙重作用[22]。值得注意的是，CDH4基因編碼的R-Cadherin蛋白（鈣黏蛋白家族成員之一），其功能在不同腫瘤中可能存在異質(zhì)性。據(jù)目前的研究報(bào)道，其可抑制鼻咽癌細(xì)胞的增殖和侵襲[23]，但在骨肉瘤和膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中表現(xiàn)為促進(jìn)增殖和侵襲轉(zhuǎn)移的作用[24-25]。本研究中，CDH4的表達(dá)與結(jié)腸癌的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移呈正相關(guān)。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Stage migration vs immunology: The lymph node count story in colon cancer[J]. Bruno M?rkl.  World Journal of Gastroenterology. 2015(43)
[2]結(jié)腸癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的多因素回歸分析[J]. 易小龍,李衛(wèi)東.  天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(01)



本文編號(hào)：3012233