糜子ASR家族基因克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時間:2021-01-26 18:35
干旱缺水已經(jīng)成為世界農(nóng)業(yè)生產(chǎn)面臨的嚴(yán)重問題,由于降水量不足和降水模式發(fā)生改變,造成的干旱與鹽害成為限制作物品質(zhì)和產(chǎn)量的主要非生物脅迫因素。糜子是我國古老的禾本科糧食作物,具有生育期短,耐旱、耐瘠薄、干旱后復(fù)水能力強(qiáng)等特性,是研究作物抗逆性改良的優(yōu)質(zhì)材料。ABA-acid-stress-ripening(ASR)基因是一種存在于作物體內(nèi)的親水性特異性基因,在作物非生物脅迫中發(fā)揮不可或缺的作用。盡管已經(jīng)在多種作物物種中證明ASR基因能響應(yīng)多種非生物脅迫并且賦予植株抗逆性,但對糜子ASR基因家族的研究還未見報道。本研究通過篩選糜子基因組數(shù)據(jù)庫,確定了6個糜子ASR家族成員,并通過分析其基因結(jié)構(gòu)、蛋白質(zhì)比對、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和不同組織表達(dá)分析,可以發(fā)現(xiàn)PmASR蛋白C端含有高度保守的基序,系統(tǒng)進(jìn)化分析可將糜子ASR基因分成三組:(1)PmASR1、PmASR2、PmASR5(2)PmASR3(3)PmASR4、PmASR6。亞細(xì)胞定位結(jié)果分析發(fā)現(xiàn)除PmASR5定位在細(xì)胞質(zhì)中其余基因均在細(xì)胞核內(nèi)。通過組織表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)PmASR1、2、3、6基因表達(dá)量情況為根>莖>葉,PmASR4、5基因...
【文章來源】:山西大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
技術(shù)路線
19圖 2.2 糜子 ASR 家族基因結(jié)構(gòu)分析Figure 2.2 Analysis of the gene broomcorn millet of the ASR family糜子 ASR 家族基因系統(tǒng)發(fā)育樹;B:糜子 ASR 家族蛋白結(jié)構(gòu)分析 C:糜子 ASR 蛋白 mo顏色背景表示 B 中相同顏色的方塊.2 糜子 ASR 家族蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹分析將糜子ASR氨基酸序列與其他已被發(fā)現(xiàn)的含有ASR基因八種植物(柳枝稷6豆 1 個、番茄 4 個、谷子 7 個、玉米 5 個、小麥 1 個、水稻 4 個、二穗短柄
糜子 ASR 家族基因克隆與表達(dá)分析個、馬鈴薯 3 個、花生 3 個)(基因登錄號見附錄 2)的 ASR 家族基因進(jìn)行多重比較,并用 MEGA 7.0 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(如圖 2.3)?蓪⑦@些 ASR 蛋白一共分為三組,分別為 Group1、Group2、Group3 分別占進(jìn)化樹的 21 %、21 %、58 %,其中 Group1含有糜子 PmASR4 和 PmASR6,Group2 含有 PmASR3,Group3 包含最多的糜子 ASR蛋白,其中包含 PmASR1、2、5,內(nèi)有少部分雙子葉植物 ASR 蛋白和單子葉植物ASR 蛋白,系統(tǒng)發(fā)育樹顯示糜子 PmASR 蛋白與柳枝稷 PvASR 蛋白高度同源,其次是和谷子 ASR 基因也有較高同源性,雙子葉植物番茄 LyASR 和花生 StASR 蛋白也是高度同源等,大豆和花生作為雙子葉作物與谷子 SiASR4 基因的同源性較高,所以ASR 基因存在并且在單子葉和雙子葉植物的遺傳中非常保守。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]谷子eIF5A基因家族鑒定與分析[J]. 張杰偉,秦新月,陳亞娟,劉婧,崔進(jìn)榮,姚磊,魏建華. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(07)
[2]厚藤ASR基因克隆及功能初步分析[J]. 張會,鄭潔旋,簡曙光,夏快飛,張美. 植物科學(xué)學(xué)報. 2018(03)
[3]糜子Ty 1-copia型反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子基因的序列特征及表達(dá)分析[J]. 何杰麗,薛延桃,王瑞云,陳國榮,陳凌,王海崗,楊美紅,喬治軍. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(06)
[4]苗期外源脫落酸和茉莉酸緩減小麥花后干旱脅迫的效應(yīng)及其生理機(jī)制[J]. 謝靜靜,王笑,蔡劍,周琴,戴廷波,姜東. 麥類作物學(xué)報. 2018(02)
[5]甘蔗ASR基因克隆及水分脅迫下的表達(dá)分析[J]. 梁潘霞,邢穎,廖青,黃杏,李長寧,黃太慶,江澤普,李楊瑞. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(10)
[6]枇杷ASR基因分離及其在果實(shí)發(fā)育中的表達(dá)分析[J]. 許燦,王朝麗,馮健君,楊肖芳,秦巧平. 中國南方果樹. 2017(03)
[7]覆蓋條件下不同生育期干旱脅迫對玉米植株生長的影響探討[J]. 王俊雅,胡兵輝. 綠色科技. 2017(09)
[8]氣相色譜-質(zhì)譜法定性定量測定糜子中的脂肪酸[J]. 田翔,喬治軍,田琴,曹曉寧,王君杰,劉思辰. 食品科學(xué). 2016(14)
[9]FaASR基因超表達(dá)促進(jìn)草莓果實(shí)著色[J]. 賈海鋒,劉眾杰,趙鵬程,崔力文,房經(jīng)貴. 園藝學(xué)報. 2015(12)
[10]大豆GmWRI1基因在糖、植物激素及鹽脅迫下的表達(dá)分析[J]. 李丹丹,閆麗,常健敏,王志坤,李文濱. 作物雜志. 2015(04)
博士論文
[1]小麥抗逆相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子bZIP和NAC基因的功能研究[D]. 張麗娜.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]小麥TaASR1基因克隆及抗逆功能研究[D]. 胡偉.華中科技大學(xué) 2013
[3]枳和柑橘microRNA及其靶基因的識別、鑒定與表達(dá)分析[D]. 宋長年.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]小麥抗逆相關(guān)DREB/ERF轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆與鑒定[D]. 徐兆師.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2005
[5]高粱、玉米苗期抗旱生理與分子機(jī)制的比較研究[D]. 邵艷軍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
碩士論文
[1]基于糜子轉(zhuǎn)錄組的NCED基因克隆及干旱脅迫下的表達(dá)分析[D]. 楊陽.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]不同外源激素處理對庫爾勒香梨抗寒生理變化的研究[D]. 王一靜.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]二穗短柄草BdASR基因家族的克隆、表達(dá)分析和遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 楊曉月.華中科技大學(xué) 2015
[4]外源ABA對玉米苗期抗冷性的影響及對Asr1基因表達(dá)的調(diào)控[D]. 楊曄.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]東鄉(xiāng)野生稻ASR2基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 羅茜.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]轉(zhuǎn)DREB1A基因水稻耐鹽抗旱性鑒定及生理生化分析[D]. 張亞洲.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[7]香蕉ASR基因抗逆功能的研究[D]. 王園.海南大學(xué) 2010
本文編號:3001618
【文章來源】:山西大學(xué)山西省
【文章頁數(shù)】:84 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
技術(shù)路線
19圖 2.2 糜子 ASR 家族基因結(jié)構(gòu)分析Figure 2.2 Analysis of the gene broomcorn millet of the ASR family糜子 ASR 家族基因系統(tǒng)發(fā)育樹;B:糜子 ASR 家族蛋白結(jié)構(gòu)分析 C:糜子 ASR 蛋白 mo顏色背景表示 B 中相同顏色的方塊.2 糜子 ASR 家族蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹分析將糜子ASR氨基酸序列與其他已被發(fā)現(xiàn)的含有ASR基因八種植物(柳枝稷6豆 1 個、番茄 4 個、谷子 7 個、玉米 5 個、小麥 1 個、水稻 4 個、二穗短柄
糜子 ASR 家族基因克隆與表達(dá)分析個、馬鈴薯 3 個、花生 3 個)(基因登錄號見附錄 2)的 ASR 家族基因進(jìn)行多重比較,并用 MEGA 7.0 構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(如圖 2.3)?蓪⑦@些 ASR 蛋白一共分為三組,分別為 Group1、Group2、Group3 分別占進(jìn)化樹的 21 %、21 %、58 %,其中 Group1含有糜子 PmASR4 和 PmASR6,Group2 含有 PmASR3,Group3 包含最多的糜子 ASR蛋白,其中包含 PmASR1、2、5,內(nèi)有少部分雙子葉植物 ASR 蛋白和單子葉植物ASR 蛋白,系統(tǒng)發(fā)育樹顯示糜子 PmASR 蛋白與柳枝稷 PvASR 蛋白高度同源,其次是和谷子 ASR 基因也有較高同源性,雙子葉植物番茄 LyASR 和花生 StASR 蛋白也是高度同源等,大豆和花生作為雙子葉作物與谷子 SiASR4 基因的同源性較高,所以ASR 基因存在并且在單子葉和雙子葉植物的遺傳中非常保守。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]谷子eIF5A基因家族鑒定與分析[J]. 張杰偉,秦新月,陳亞娟,劉婧,崔進(jìn)榮,姚磊,魏建華. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2018(07)
[2]厚藤ASR基因克隆及功能初步分析[J]. 張會,鄭潔旋,簡曙光,夏快飛,張美. 植物科學(xué)學(xué)報. 2018(03)
[3]糜子Ty 1-copia型反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子基因的序列特征及表達(dá)分析[J]. 何杰麗,薛延桃,王瑞云,陳國榮,陳凌,王海崗,楊美紅,喬治軍. 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(06)
[4]苗期外源脫落酸和茉莉酸緩減小麥花后干旱脅迫的效應(yīng)及其生理機(jī)制[J]. 謝靜靜,王笑,蔡劍,周琴,戴廷波,姜東. 麥類作物學(xué)報. 2018(02)
[5]甘蔗ASR基因克隆及水分脅迫下的表達(dá)分析[J]. 梁潘霞,邢穎,廖青,黃杏,李長寧,黃太慶,江澤普,李楊瑞. 西南農(nóng)業(yè)學(xué)報. 2017(10)
[6]枇杷ASR基因分離及其在果實(shí)發(fā)育中的表達(dá)分析[J]. 許燦,王朝麗,馮健君,楊肖芳,秦巧平. 中國南方果樹. 2017(03)
[7]覆蓋條件下不同生育期干旱脅迫對玉米植株生長的影響探討[J]. 王俊雅,胡兵輝. 綠色科技. 2017(09)
[8]氣相色譜-質(zhì)譜法定性定量測定糜子中的脂肪酸[J]. 田翔,喬治軍,田琴,曹曉寧,王君杰,劉思辰. 食品科學(xué). 2016(14)
[9]FaASR基因超表達(dá)促進(jìn)草莓果實(shí)著色[J]. 賈海鋒,劉眾杰,趙鵬程,崔力文,房經(jīng)貴. 園藝學(xué)報. 2015(12)
[10]大豆GmWRI1基因在糖、植物激素及鹽脅迫下的表達(dá)分析[J]. 李丹丹,閆麗,常健敏,王志坤,李文濱. 作物雜志. 2015(04)
博士論文
[1]小麥抗逆相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子bZIP和NAC基因的功能研究[D]. 張麗娜.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[2]小麥TaASR1基因克隆及抗逆功能研究[D]. 胡偉.華中科技大學(xué) 2013
[3]枳和柑橘microRNA及其靶基因的識別、鑒定與表達(dá)分析[D]. 宋長年.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[4]小麥抗逆相關(guān)DREB/ERF轉(zhuǎn)錄因子基因的克隆與鑒定[D]. 徐兆師.中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2005
[5]高粱、玉米苗期抗旱生理與分子機(jī)制的比較研究[D]. 邵艷軍.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2005
碩士論文
[1]基于糜子轉(zhuǎn)錄組的NCED基因克隆及干旱脅迫下的表達(dá)分析[D]. 楊陽.山西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]不同外源激素處理對庫爾勒香梨抗寒生理變化的研究[D]. 王一靜.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[3]二穗短柄草BdASR基因家族的克隆、表達(dá)分析和遺傳轉(zhuǎn)化[D]. 楊曉月.華中科技大學(xué) 2015
[4]外源ABA對玉米苗期抗冷性的影響及對Asr1基因表達(dá)的調(diào)控[D]. 楊曄.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[5]東鄉(xiāng)野生稻ASR2基因的克隆與表達(dá)分析[D]. 羅茜.江西農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]轉(zhuǎn)DREB1A基因水稻耐鹽抗旱性鑒定及生理生化分析[D]. 張亞洲.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[7]香蕉ASR基因抗逆功能的研究[D]. 王園.海南大學(xué) 2010
本文編號:3001618
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