本文關(guān)鍵詞：黑龍江草蜥線粒體基因組全序列分析及不同地理種群Cytb基因的遺傳變異，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：黑龍江草蜥(Takydromus amurensis)隸屬于爬行綱(Reptilia),有鱗目(Squamata),蜥蜴亞目(Lacertiformes),蜥蜴科(Lacertidae),草蜥屬(Takydromus),主要分布在我國(guó)東北部的長(zhǎng)白山脈及其延續(xù)地區(qū)。本研究主要包括3部分,即黑龍江草蜥線粒體基因組全序列的測(cè)定、我國(guó)蜥蜴科系統(tǒng)發(fā)育的研究及對(duì)黑龍江草蜥不同地理種群細(xì)胞色素B基因(Cytb)的比較。主要的研究結(jié)果如下:1.黑龍江草蜥線粒體基因組全序列總長(zhǎng)度為17333 bp,包括13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,22個(gè)tRNA基因,2個(gè)rRNA基因和1個(gè)控制區(qū)(D-loop),與已報(bào)道的脊椎動(dòng)物線粒體基因組結(jié)構(gòu)相似,在進(jìn)化上具有高度的保守性。線粒體基因組中的堿基含量A為31.23%,C為26.06%,G為13.91%,T為28.8%,A+T含量(60.03%)大于G+C含量(39.97%);GC和AT偏斜值分別為-0.304和0.040。黑龍江草蜥與白條草蜥(T.wolteri)、南草蜥(T.sexlineatus)線粒體基因組全序列比較的結(jié)果表明,黑龍江草蜥與白條草蜥的親緣關(guān)系較南草蜥近。2.從線粒體基因組全序列的結(jié)構(gòu)、長(zhǎng)度、堿基含量、遺傳距離等方面對(duì)我國(guó)蜥蜴科4屬12種蜥蜴進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育研究,結(jié)果表明,這12種蜥蜴的線粒體基因組全序列長(zhǎng)度為17046~19914 bp,平均長(zhǎng)度為18471 bp,結(jié)構(gòu)均由13個(gè)蛋白基因,22個(gè)tRNA基因,2個(gè)rRNA基因和1個(gè)控制區(qū)(D-loop)組成;4種堿基含量中,G的含量最低,平均為13.46%,T和C的含量較為接近,平均為28.99%和26.56%,A的含量最高,平均為30.99%,且A+T的平均含量(59.98%)大于G+C的平均含量(40.02%);4個(gè)屬的遺傳距離表明,地蜥屬(Platyplacopus)和草蜥屬(Takydromus)的遺傳距離最近,為0.207;麻蜥屬(Eremias)和草蜥屬的遺傳距離最遠(yuǎn),為0.321。3.對(duì)黑龍江草蜥5個(gè)地理種群的Cytb基因進(jìn)行測(cè)序和遺傳多樣性分析,結(jié)果表明不同地理種群Cytb基因的序列長(zhǎng)度相同,均為1143 bp;27個(gè)樣本共檢測(cè)到27個(gè)變異位點(diǎn),占總位點(diǎn)的3%,均為堿基轉(zhuǎn)換和顛換;共定義了13種單倍型,單倍型多態(tài)度(Hd)為0.932±0.025,核苷酸多態(tài)度(pi)為0.00487±0.00038;Tajima's D和Fu’s FS值檢測(cè)結(jié)果表明,這5個(gè)黑龍江草蜥種群相對(duì)于中性進(jìn)化的歧異度并沒有明顯的偏離(P0.1)。
【關(guān)鍵詞】：黑龍江草蜥 線粒體基因組 系統(tǒng)發(fā)育 細(xì)胞色素B基因
【學(xué)位授予單位】：哈爾濱師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：Q953
【目錄】：

• 摘要6-7
• Abstract7-9
• 第1章 緒論9-14
• 1.1 線粒體DNA簡(jiǎn)介9
• 1.2 蜥蜴科系統(tǒng)發(fā)育研究進(jìn)展9-10
• 1.2.1 基于形態(tài)特征的系統(tǒng)發(fā)育研究9-10
• 1.2.2 基于基因序列的系統(tǒng)發(fā)育研究10
• 1.3 草蜥屬的系統(tǒng)發(fā)育研究10-11
• 1.4 黑龍江草蜥特征及分布11-12
• 1.4.1 形態(tài)特征11
• 1.4.2 分布11-12
• 1.5 黑龍江草蜥的研究現(xiàn)狀12-13
• 1.6 本課題研究的目的和意義13-14
• 第2章 黑龍江草蜥線粒體基因組全序列的測(cè)定14-29
• 2.1 實(shí)驗(yàn)材料及方法14-15
• 2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料與選取數(shù)據(jù)14
• 2.1.2 引物設(shè)計(jì)和測(cè)序14
• 2.1.3 全序列分析14
• 2.1.4 建立系統(tǒng)發(fā)育樹14-15
• 2.2 結(jié)果與分析15-28
• 2.2.1 黑龍江草蜥基因組全序列的結(jié)構(gòu)及主要特征15-22
• 2.2.2 草蜥屬3種蜥蜴線粒體基因組的比較22
• 2.2.3 12種蜥蜴線粒體基因組全序列的長(zhǎng)度及比較22-26
• 2.2.4 蜥蜴科4個(gè)屬的遺傳距離26
• 2.2.5 蜥蜴科動(dòng)物的系統(tǒng)演化26-28
• 2.3 討論28-29
• 第3章 黑龍江草蜥不同地理種群Cytb基因的比較29-40
• 3.1 實(shí)驗(yàn)材料及用品29-31
• 3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料29-31
• 3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器及試劑31
• 3.2 實(shí)驗(yàn)方法31-33
• 3.2.1 DNA提取31-32
• 3.2.2 瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)基因組DNA32
• 3.2.3 引物設(shè)計(jì)及PCR擴(kuò)增32-33
• 3.3 數(shù)據(jù)處理33-34
• 3.3.1 序列拼接33
• 3.3.2 序列數(shù)據(jù)分析33-34
• 3.4 結(jié)果和分析34-39
• 3.4.1 黑龍江草蜥基因組DNA的檢測(cè)34
• 3.4.2 黑龍江草蜥Cytb基因PCR的擴(kuò)增34-35
• 3.4.3 測(cè)序結(jié)果35
• 3.4.4 核苷酸序列變異35-36
• 3.4.5 遺傳多樣性與遺傳距離36-38
• 3.4.6 系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系38-39
• 3.5 討論39-40
• 結(jié)論與展望40-41
• 結(jié)論40
• 展望40-41
• 參考文獻(xiàn)41-45
• 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文45-47
• 致謝47

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1 秦姝冕;趙文閣;;黑龍江省產(chǎn)兩種草蜥染色體組型研究[J];四川動(dòng)物;2009年03期

2 牛超;揚(yáng)成;高歌;徐丕林;趙文閣;劉鵬;;黑龍江草蜥和白條草蜥體溫的比較研究[J];中國(guó)農(nóng)學(xué)通報(bào);2014年08期

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1 馬微微;黑龍江草蜥線粒體基因組全序列分析及不同地理種群Cytb基因的遺傳變異[D];哈爾濱師范大學(xué);2016年

2 杜青霖;黑龍江草蜥不同種群雌性形態(tài)和繁殖策略及溫度生態(tài)的研究[D];哈爾濱師范大學(xué);2013年

  本文關(guān)鍵詞：黑龍江草蜥線粒體基因組全序列分析及不同地理種群Cytb基因的遺傳變異，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：299479