老芒麥（Elymus sibiricus L.）是禾本科披堿草屬多年生優(yōu)良牧草,具有草產(chǎn)量高、品質(zhì)好、耐寒、耐旱等優(yōu)良特性,廣泛應(yīng)用于我國(guó)高山草原的放牧、人工草地建植、生態(tài)環(huán)境恢復(fù)等。但老芒麥較高的落粒性大大降低了牧草種子產(chǎn)量,對(duì)新品種選育、推廣利用帶來(lái)不利影響。有關(guān)牧草落粒的遺傳學(xué)基礎(chǔ),是國(guó)內(nèi)外研究不多且亟待加強(qiáng)的研究領(lǐng)域。為此,本研究在開(kāi)發(fā)老芒麥特異性EST-SSR標(biāo)記、分析不同落粒種質(zhì)材料的遺傳多樣性基礎(chǔ)上,構(gòu)建了老芒麥的遺傳作圖群體,并利用SLAF（specific length amplified fragment）技術(shù)構(gòu)建了老芒麥?zhǔn)讖堖z傳連鎖圖譜,相繼結(jié)合QTL和GWAS（genome-wide association study）分析方法定位了落粒候選基因。旨在為解析老芒麥落粒遺傳機(jī)制、加快老芒麥落粒分子遺傳改良和培育低落粒老芒麥新品種提供基礎(chǔ)科學(xué)依據(jù)。獲得主要研究結(jié)果如下。1、進(jìn)行了老芒麥特異性EST-SSR分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)及通用性研究。從老芒麥轉(zhuǎn)錄組測(cè)序獲得的6,685個(gè)unigene中,分析識(shí)別了8,871個(gè)潛在EST-SSR位點(diǎn),進(jìn)一步開(kāi)發(fā)了200對(duì)EST-SSR分子... 

【文章來(lái)源】：蘭州大學(xué)甘肅省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：206 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

技術(shù)路線

蘭州大學(xué)博士學(xué)位論文老芒麥高密度遺傳圖譜構(gòu)建及落粒相關(guān)基因QTL定位44和AAC/GTT（836,17.6%），而AG/CT（816,40.9%）和AC/GT（796,39.9%）是二堿基重復(fù)類型中最多的（圖3-2b）。此外，串聯(lián)重復(fù)數(shù)為五的EST-SSR位點(diǎn)是最常見(jiàn)的類型（40.71%），其次是六串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)（23.48%）、十串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)（12.95%）、七串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)（7.49%）、十一串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)（5.16%）、八串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)（3.29%）、九串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)（2.25%）和十二串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)（2.04%）。其余的串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)數(shù)總和所占比例少于1%（表3-2）。圖3-1Unigenes長(zhǎng)度分布圖Figure3-1Lengthdistributionofallunigenes注：x軸表示所有unigenes長(zhǎng)度大小，y軸表示某一長(zhǎng)度范圍所對(duì)應(yīng)的unigenes數(shù)量。Note:Thex-axisrepresentsthesizeofallunigenes,andthey-axisrepresentsthenumberofallunigeneswithacertainlength.表3-1老芒麥轉(zhuǎn)錄組功能注釋Table3-1FunctionannotationoftheE.sibiricustranscriptom注釋數(shù)據(jù)庫(kù)AnnoDatabase注釋數(shù)量AnnotatedNumber比例Percentage(%)COG注釋COGAnnotation13,81310.20%GO注釋GOAnnotation34,04425.14%KEGG注釋KEGGAnnotation16,35212.07%KOG注釋KOGAnnotation25,95419.16%Pfam注釋PfamAnnotation31,60323.33%Swissprot注釋SwissprotAnnotation24,99218.45%Nr注釋NrAnnotation55,73841.16%注釋總數(shù)AllAnnotated57,75642.65%

蘭州大學(xué)博士學(xué)位論文老芒麥高密度遺傳圖譜構(gòu)建及落粒相關(guān)基因QTL定位45表3-2基于堿基重復(fù)單元數(shù)的EST-SSR位點(diǎn)長(zhǎng)度分布Table3-2ThedistributionoftheEST-SSRsbasedonthenumberofrepeatunits重復(fù)數(shù)Repeats一Mono-二Di-三Tri-四Quad-五Penta-六Hexa-總數(shù)Total比例Percentage(%)5003,4001951243,61140.71609441,11521122,08323.48704262350216647.4980282100002923.299019900102002.25101,04110700011,14912.95114253300004585.1612178200011812.04138800000880.99146000000600.68154200001430.48162500000250.281780000080.091830000030.031910000010.012000000000.002120000020.022230000030.03總數(shù)Total1,8761,9934,76021616108,871比例Percentage(%)21.1522.4753.662.430.180.11圖3-2SSR位點(diǎn)特征分布統(tǒng)計(jì)Figure3-2CharacteristicsofidentifiedSSR注：(a),六種堿基重復(fù)類型及其所占比例；(b),不同串聯(lián)重復(fù)位點(diǎn)類型分布。Note:Sixtypesofmotifandtheirpercentage(a),differenttypesoftandemrepeatsandtheirpercentage(b).

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
[1]甘肅省“退牧還草”工程主要實(shí)施區(qū)的引種試驗(yàn)及草地補(bǔ)播方案的研究[D]. 韓天文.蘭州大學(xué) 2007



本文編號(hào)：2991864