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基于crispr/cas9的大腸桿菌基因編輯方法研究

發(fā)布時間:2021-01-20 16:13
  盡管CRISPR/Cas9系統(tǒng)是一個強大的、不可思議的基因組編輯工具,但人們在實際應(yīng)用中還是發(fā)現(xiàn)其并不是沒有缺陷。對于PAM-free和CRISPR受限制的區(qū)域,當下通常使用的CRISPR/Cas9系統(tǒng)都不能有效的編輯,而其較高的脫靶幾率則使其不能得到更廣泛的應(yīng)用。為了改進這些缺陷,我們開發(fā)了一個非常簡單的基于CRISPR/cas9的無質(zhì)粒一步法(CAGO)基因組編輯技術(shù),它不需要構(gòu)建一個來表達特定的gRNA的質(zhì)粒。而是通過構(gòu)建一個具有極高靶向效率的通用N20序列,以同源重組的方式插入到大腸桿菌的染色體中,然后誘導CRISPR/Cas9在通用N20序列處切割雙鏈DNA造成染色體雙鏈斷裂,再誘導染色體重組修復(fù)以完成編輯過程。實驗已證明這一技術(shù)能夠沒有任何副作用的編輯CRISPR受限制的DNA區(qū)域。當應(yīng)用到多位點編輯時,CAGO可以在兩天內(nèi)以幾乎100%的編輯效率編輯一個靶目標。此外,稍微調(diào)整后的CAGO能夠用于編輯多達100kbp的大片段區(qū)域,編輯效率達到75%。最后,在CAGO的基因組編輯方法構(gòu)建中,通過應(yīng)用模塊化的設(shè)計策略,進一步簡化了供體DNA線性片段的轉(zhuǎn)換過程和構(gòu)建。雖然該技術(shù)是... 

【文章來源】:西華師范大學四川省

【文章頁數(shù)】:54 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于crispr/cas9的大腸桿菌基因編輯方法研究


PAM-free示意圖

線性目標,載體


圖 2-1 part A 和線性目標載體的 Golden Gate 裝配Fig. 2-1 Golden Gate assembly of partA with a linearized destination v

基于crispr/cas9的大腸桿菌基因編輯方法研究


CAGO編輯片段的構(gòu)建Figure2-2.ConstructionofeditfragmentsofCAGO.

【參考文獻】:
期刊論文
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本文編號:2989359

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