蘋果MdARF3基因克隆及功能分析
發(fā)布時間:2021-01-11 04:26
ARF3(auxin response factor 3)是植物生長素響應(yīng)因子,在植物生長素信號的轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑中起著非常重要的作用。ARF3基因在擬南芥中研究較為詳細,而在蘋果中研究甚少。實驗室前期對‘寒富’蘋果進行染色體同源加倍獲得其同源四倍體,發(fā)現(xiàn)同源四倍體的抗逆性高于‘寒富’蘋果。兩者的轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果顯示,ARF3基因表達量在‘寒富’蘋果中顯著高于其同源四倍體。本試驗從‘寒富’蘋果中克隆出ARF3基因編碼區(qū)序列。一方面利用克隆出的蘋果MdARF3基因構(gòu)建了原核表達載體,誘導(dǎo)出的Md ARF3蛋白用于篩選與之互作的蛋白。另一方面構(gòu)建了含MdARF3基因編碼區(qū)的過表達載體,利用遺傳轉(zhuǎn)化獲得了轉(zhuǎn)基因蘋果植株,為蘋果功能基因研究奠定基礎(chǔ)。本試驗主要結(jié)果如下:1.從‘寒富’蘋果中克隆出MdARF3基因編碼區(qū)全長序列為2136 bp,包含完整的讀碼框,共編碼712個氨基酸。與其他物種中的ARF3基因進行同源性分析發(fā)現(xiàn)蘋果的ARF3蛋白含有ARF基因家族中的2個保守功能域:DNA結(jié)合的結(jié)構(gòu)域(DBD)和中間結(jié)構(gòu)域(MR)。通過與其他植物中的ARF3系統(tǒng)發(fā)育分析發(fā)現(xiàn)ARF3基因在物種間存在進化關(guān)系。...
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
擬南芥和蘋果ARF的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系(引自Luoetal.,2014)
沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文11圖2 蘋果ARF家族的多序列比對(引自Luo et al., 2014)突出顯示的區(qū)域表示保守的圖案。B3、Auxin-resp和AUX-IAA分別用紅色框,藍色框和紫色框表示。Fig.2 Multiple sequence alignment of the ARF family from apple.The highlighted region indicates the conserved motif. B3, Auxin-resp and AUX-IAA are indicated by a red box, a bluebox and a purple box, respectively.1.3.5 蘋果 ARF 基因家族的染色體定位基因復(fù)制對于基因家族成員的大量產(chǎn)生和基因功能多樣化等過程具有重要作用(Cannon et al., 2004)。研究發(fā)現(xiàn)蘋果在約6千萬年前發(fā)生了基因復(fù)制事件,導(dǎo)致蘋果從最初的9條染色增加至17條染色體(Velasco et al., 2010)。在此過程中,李慧峰(2015)等發(fā)現(xiàn)有已鑒定出的31個MdARF基因中26個MdARF基因經(jīng)歷了基因復(fù)制事件(圖3)。基因復(fù)制不僅在基因組重排和擴增中具有重要作用,而且對基因功能的多樣化也起著重要的作用。
(Cannon et al., 2004)。研究發(fā)現(xiàn)蘋果在約6千萬年前發(fā)生了基因復(fù)制事件,導(dǎo)致蘋果從最初的9條染色增加至17條染色體(Velasco et al., 2010)。在此過程中,李慧峰(2015)等發(fā)現(xiàn)有已鑒定出的31個MdARF基因中26個MdARF基因經(jīng)歷了基因復(fù)制事件(圖3);驈(fù)制不僅在基因組重排和擴增中具有重要作用,而且對基因功能的多樣化也起著重要的作用。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2017/2018年世界蘋果、梨、葡萄、桃及櫻桃產(chǎn)量、市場與貿(mào)易情況[J]. 孫平平,王文輝. 中國果樹. 2018(02)
[2]我國蘋果生產(chǎn)現(xiàn)狀與經(jīng)濟效益分析[J]. 王洪煜,張復(fù)宏,宋曉麗. 對外經(jīng)貿(mào). 2017(10)
[3]紅肉蘋果愈傷組織生長素信號相關(guān)基因MdARF3的克隆與表達分析[J]. 王意程,許海峰,王楠,姜生輝,劉靜軒,王得云,左衛(wèi)芳,陳學(xué)森. 園藝學(xué)報. 2017(04)
[4]抗蘋果斑點落葉病基因Mal d 1的克隆及功能鑒定[J]. 宗澤冉,田義,張利義,韓曉蕾,張彩霞,叢佩華. 園藝學(xué)報. 2017(02)
[5]基于主分量分析的蘋果葉部3種常見病害識別方法[J]. 師韻,王旭啟,張善文. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(09)
[6]蘋果常見病害及其防治方法[J]. 唐洪普. 園藝與種苗. 2016(03)
[7]中國蘋果病害發(fā)生與分布現(xiàn)狀調(diào)查[J]. 胡清玉,胡同樂,王亞南,王樹桐,曹克強. 植物保護. 2016(01)
[8]蘋果生長素響應(yīng)因子(ARF)基因家族全基因組鑒定及表達分析[J]. 李慧峰,冉昆,何平,王海波,常源升,孫清榮,程來亮,李林光. 植物生理學(xué)報. 2015(07)
[9]我國蘋果主要病害研究進展與病害防治中的問題[J]. 李保華,王彩霞,董向麗. 植物保護. 2013(05)
[10]幾種蘋果常見病害及綜合防治措施[J]. 劉平秀,潘艷青,李曉建,蘇秀娟,康俊楠,王海燕. 現(xiàn)代園藝. 2013(04)
博士論文
[1]蘋果乙烯應(yīng)答因子ERF調(diào)控果實成熟過程中乙烯合成的機理研究[D]. 李通.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
碩士論文
[1]蘋果幾丁質(zhì)酶基因的克隆與功能分析[D]. 張兵.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]蘋果抗病相關(guān)基因CERK1克隆與功能分析[D]. 陳蒙蒙.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號:2970083
【文章來源】:沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:67 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
擬南芥和蘋果ARF的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系(引自Luoetal.,2014)
沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文11圖2 蘋果ARF家族的多序列比對(引自Luo et al., 2014)突出顯示的區(qū)域表示保守的圖案。B3、Auxin-resp和AUX-IAA分別用紅色框,藍色框和紫色框表示。Fig.2 Multiple sequence alignment of the ARF family from apple.The highlighted region indicates the conserved motif. B3, Auxin-resp and AUX-IAA are indicated by a red box, a bluebox and a purple box, respectively.1.3.5 蘋果 ARF 基因家族的染色體定位基因復(fù)制對于基因家族成員的大量產(chǎn)生和基因功能多樣化等過程具有重要作用(Cannon et al., 2004)。研究發(fā)現(xiàn)蘋果在約6千萬年前發(fā)生了基因復(fù)制事件,導(dǎo)致蘋果從最初的9條染色增加至17條染色體(Velasco et al., 2010)。在此過程中,李慧峰(2015)等發(fā)現(xiàn)有已鑒定出的31個MdARF基因中26個MdARF基因經(jīng)歷了基因復(fù)制事件(圖3)。基因復(fù)制不僅在基因組重排和擴增中具有重要作用,而且對基因功能的多樣化也起著重要的作用。
(Cannon et al., 2004)。研究發(fā)現(xiàn)蘋果在約6千萬年前發(fā)生了基因復(fù)制事件,導(dǎo)致蘋果從最初的9條染色增加至17條染色體(Velasco et al., 2010)。在此過程中,李慧峰(2015)等發(fā)現(xiàn)有已鑒定出的31個MdARF基因中26個MdARF基因經(jīng)歷了基因復(fù)制事件(圖3);驈(fù)制不僅在基因組重排和擴增中具有重要作用,而且對基因功能的多樣化也起著重要的作用。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]2017/2018年世界蘋果、梨、葡萄、桃及櫻桃產(chǎn)量、市場與貿(mào)易情況[J]. 孫平平,王文輝. 中國果樹. 2018(02)
[2]我國蘋果生產(chǎn)現(xiàn)狀與經(jīng)濟效益分析[J]. 王洪煜,張復(fù)宏,宋曉麗. 對外經(jīng)貿(mào). 2017(10)
[3]紅肉蘋果愈傷組織生長素信號相關(guān)基因MdARF3的克隆與表達分析[J]. 王意程,許海峰,王楠,姜生輝,劉靜軒,王得云,左衛(wèi)芳,陳學(xué)森. 園藝學(xué)報. 2017(04)
[4]抗蘋果斑點落葉病基因Mal d 1的克隆及功能鑒定[J]. 宗澤冉,田義,張利義,韓曉蕾,張彩霞,叢佩華. 園藝學(xué)報. 2017(02)
[5]基于主分量分析的蘋果葉部3種常見病害識別方法[J]. 師韻,王旭啟,張善文. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(09)
[6]蘋果常見病害及其防治方法[J]. 唐洪普. 園藝與種苗. 2016(03)
[7]中國蘋果病害發(fā)生與分布現(xiàn)狀調(diào)查[J]. 胡清玉,胡同樂,王亞南,王樹桐,曹克強. 植物保護. 2016(01)
[8]蘋果生長素響應(yīng)因子(ARF)基因家族全基因組鑒定及表達分析[J]. 李慧峰,冉昆,何平,王海波,常源升,孫清榮,程來亮,李林光. 植物生理學(xué)報. 2015(07)
[9]我國蘋果主要病害研究進展與病害防治中的問題[J]. 李保華,王彩霞,董向麗. 植物保護. 2013(05)
[10]幾種蘋果常見病害及綜合防治措施[J]. 劉平秀,潘艷青,李曉建,蘇秀娟,康俊楠,王海燕. 現(xiàn)代園藝. 2013(04)
博士論文
[1]蘋果乙烯應(yīng)答因子ERF調(diào)控果實成熟過程中乙烯合成的機理研究[D]. 李通.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
碩士論文
[1]蘋果幾丁質(zhì)酶基因的克隆與功能分析[D]. 張兵.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[2]蘋果抗病相關(guān)基因CERK1克隆與功能分析[D]. 陳蒙蒙.沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
本文編號:2970083
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