蕓薹生鏈格孢轉(zhuǎn)錄因子AB04837基因的克隆與功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-08 18:14
蕓薹生鏈格孢(Alternaria brassicicola)能夠引起十字花科蔬菜產(chǎn)生黑斑病,造成產(chǎn)量和質(zhì)量下降,食用安全性降低,為該類(lèi)蔬菜生產(chǎn)帶來(lái)巨大的經(jīng)濟(jì)損失。轉(zhuǎn)錄因子對(duì)真菌的生長(zhǎng)發(fā)育及致病性等都具有重要的調(diào)控作用,C6型鋅指轉(zhuǎn)錄因子參與多種真菌的產(chǎn)孢及致病性等的調(diào)控,但在蕓薹生鏈格孢中尚未報(bào)道。通過(guò)對(duì)該類(lèi)轉(zhuǎn)錄因子基因功能的研究,有助于我們更加深入的認(rèn)識(shí)蕓薹生鏈格孢的生長(zhǎng)發(fā)育及致病機(jī)理,對(duì)有效防治黑斑病具有重要意義。本研究主要以蕓薹生鏈格孢(A.brassicicola)為研究對(duì)象,克隆了蕓薹生鏈格孢一個(gè)C6型轉(zhuǎn)錄因子AB04837基因,根據(jù)同源重組的原理,利用Split-marker PCR重組技術(shù)以及PEG介導(dǎo)的原生質(zhì)體轉(zhuǎn)化的方法,成功獲得了AB04837基因缺失突變體(ΔAB04837),并構(gòu)建了互補(bǔ)體C1。通過(guò)基因缺失突變體與野生菌的對(duì)比研究發(fā)現(xiàn):(1)AB04837基因全長(zhǎng)為2104 bp,cDNA全長(zhǎng)為2055 bp,共編碼684個(gè)氨基酸,含有一個(gè)保守的Zn2+結(jié)構(gòu)域,有一個(gè)49 bp的內(nèi)含子,與小麥長(zhǎng)蠕...
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
AB04837基因的DNA和cDNA進(jìn)行PCR驗(yàn)證的瓊脂糖凝膠電泳圖
圖 1 AB04837 基因的 DNA 和 cDNA 進(jìn)行 PCR 驗(yàn)證的瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.1 Agarose gel electrophoresis of the PCR product from the AB04837 DNA and cDNAM:DL 2000 Plus DNA Marker 1:DNA 全長(zhǎng) 2:cDNA 全長(zhǎng)用SMART工具對(duì)蕓薹生鏈格孢鋅指轉(zhuǎn)錄因子AB04837基因的氨基酸序列析,發(fā)現(xiàn)在該序列的 58 bp~103 bp之間存在著 Zn2+的保守結(jié)構(gòu)域,圖 2為A氨基酸序列分析結(jié)果。
圖3為蕓薹生鏈格孢轉(zhuǎn)錄因子AB04837基因的部分氨基酸序列與其他物種的氨基酸序列的比對(duì)分析結(jié)果。從圖中可以看出,不同物種的氨基酸序列同源性含有一個(gè)同源的 Zn2+結(jié)合域和一個(gè)保守的結(jié)構(gòu)域 2,推測(cè)該結(jié)構(gòu)域在功能中。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]十字花科黑斑病病菌在我國(guó)的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和檢疫防控措施[J]. 秦萌,朱威龍,朱家林,劉慧,趙守歧,閆碩. 中國(guó)植保導(dǎo)刊. 2018(09)
[2]甘藍(lán)鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子BoC2H2的克隆、定位與表達(dá)分析[J]. 羅紹蘭,廉小平,蒲敏,白曉璟,王玉奎,曾靜,施松梅,張賀翠,朱利泉. 作物學(xué)報(bào). 2018(11)
[3]鋅指轉(zhuǎn)錄因子GATA4的功能研究進(jìn)展[J]. 張玉函,楊海濤,王澤方. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(06)
[4]金針菇HMG-box轉(zhuǎn)錄因子鑒定及一個(gè)候選基因的差異表達(dá)分析[J]. 孟麗,王麗,劉芳,丑天勝,王威,謝寶貴. 菌物學(xué)報(bào). 2018(04)
[5]轉(zhuǎn)錄因子MoOaf22對(duì)稻瘟病菌營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)、細(xì)胞壁完整性和脅迫應(yīng)答的調(diào)控[J]. 齊中強(qiáng),杜艷,沈樂(lè)融,余振仙,于俊杰,俞咪娜,宋天巧,張榮勝,劉永鋒. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(06)
[6]蕓薹生鏈格孢產(chǎn)孢缺陷突變體的鑒定與表型分析[J]. 張倩倩,張曉斐,劉偉陽(yáng),崔文娟,侯欣,徐后娟. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(09)
[7]煙草C2H2鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定與表達(dá)分析[J]. 楊明磊,晁江濤,王大偉,胡軍華,吳華,龔達(dá)平,劉貫山. 遺傳. 2016(04)
[8]蕓薹鏈格孢菌孢子萌發(fā)及附著胞形成的初步定量研究[J]. 馬海霞,劉影,屈直,李丹,楊毅,楊信東. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(04)
[9]植物bZIP轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能[J]. 張計(jì)育,渠慎春,郭忠仁,杜小麗,都貝貝,章鎮(zhèn). 西北植物學(xué)報(bào). 2011(05)
[10]bHLH轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物形態(tài)發(fā)生的影響[J]. 何開(kāi)平,吳楚. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(35)
博士論文
[1]梨樹(shù)腐爛病菌的轉(zhuǎn)錄組分析及兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的功能研究[D]. 何鋒.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]稻瘟病菌Zn2Cys6和bHLH家族轉(zhuǎn)錄因子功能分析[D]. 曹慧娟.浙江大學(xué) 2015
[3]大豆疫霉中參與氧化壓力應(yīng)答和致病過(guò)程的轉(zhuǎn)錄因子PsHSF1和PsBZPc32的功能分析[D]. 盛玉婷.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]植物內(nèi)生真菌無(wú)花果擬盤(pán)多毛孢的基因組及次級(jí)代謝研究[D]. 王秀娜.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]擬南芥AtHMGB15基因在花粉管萌發(fā)生長(zhǎng)過(guò)程中的功能研究[D]. 王玉嬌.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]擬南芥轉(zhuǎn)錄因子TGA7參與植物響應(yīng)干旱脅迫的機(jī)制研究[D]. 吳娟娟.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[7]小麥抗逆相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子bZIP和NAC基因的功能研究[D]. 張麗娜.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[8]稻瘟病菌兩個(gè)新基因的功能研究[D]. 林艷.福建農(nóng)林大學(xué) 2007
[9]稻瘟病菌MGTA1基因的克隆與功能分析[D]. 王教瑜.浙江大學(xué) 2005
碩士論文
[1]核盤(pán)菌C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子SsSte12的功能研究[D]. 徐廷滔.吉林大學(xué) 2018
[2]香菇木質(zhì)纖維素酶基因表達(dá)相關(guān)HMG-box轉(zhuǎn)錄因子lelcrp1功能分析[D]. 胡悅.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]番茄C2H2型鋅指蛋白生物信息學(xué)分析及抗逆相關(guān)基因鑒定[D]. 張佳.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]小麥鋅指轉(zhuǎn)錄因子基因TaZFP593和TaSAP1-1抵御非生物逆境的功能[D]. 陳耀仙.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[5]水稻GRAS轉(zhuǎn)錄因子RAD1調(diào)控叢枝菌根共生的功能研究[D]. 劉迎娜.南京大學(xué) 2018
[6]蕓薹生鏈格孢轉(zhuǎn)錄因子基因Ab06986的克隆與功能研究[D]. 張敏.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[7]蕓薹生鏈格孢Abcdm1基因的克隆及功能初步分析[D]. 張曉斐.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[8]兩個(gè)Zn2Cys6鋅指蛋白對(duì)球孢白僵菌生長(zhǎng)及抗逆性的影響[D]. 李永霞.西南大學(xué) 2018
[9]蕓薹生鏈格孢(Alternaria brassicicola)AbSte12基因的鑒定及功能研究[D]. 張倩倩.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[10]主要葉類(lèi)蔬菜新病害發(fā)現(xiàn)及常見(jiàn)真菌病害調(diào)查研究[D]. 宋加偉.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
本文編號(hào):2965066
【文章來(lái)源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省
【文章頁(yè)數(shù)】:69 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
AB04837基因的DNA和cDNA進(jìn)行PCR驗(yàn)證的瓊脂糖凝膠電泳圖
圖 1 AB04837 基因的 DNA 和 cDNA 進(jìn)行 PCR 驗(yàn)證的瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.1 Agarose gel electrophoresis of the PCR product from the AB04837 DNA and cDNAM:DL 2000 Plus DNA Marker 1:DNA 全長(zhǎng) 2:cDNA 全長(zhǎng)用SMART工具對(duì)蕓薹生鏈格孢鋅指轉(zhuǎn)錄因子AB04837基因的氨基酸序列析,發(fā)現(xiàn)在該序列的 58 bp~103 bp之間存在著 Zn2+的保守結(jié)構(gòu)域,圖 2為A氨基酸序列分析結(jié)果。
圖3為蕓薹生鏈格孢轉(zhuǎn)錄因子AB04837基因的部分氨基酸序列與其他物種的氨基酸序列的比對(duì)分析結(jié)果。從圖中可以看出,不同物種的氨基酸序列同源性含有一個(gè)同源的 Zn2+結(jié)合域和一個(gè)保守的結(jié)構(gòu)域 2,推測(cè)該結(jié)構(gòu)域在功能中。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]十字花科黑斑病病菌在我國(guó)的風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估和檢疫防控措施[J]. 秦萌,朱威龍,朱家林,劉慧,趙守歧,閆碩. 中國(guó)植保導(dǎo)刊. 2018(09)
[2]甘藍(lán)鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子BoC2H2的克隆、定位與表達(dá)分析[J]. 羅紹蘭,廉小平,蒲敏,白曉璟,王玉奎,曾靜,施松梅,張賀翠,朱利泉. 作物學(xué)報(bào). 2018(11)
[3]鋅指轉(zhuǎn)錄因子GATA4的功能研究進(jìn)展[J]. 張玉函,楊海濤,王澤方. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(06)
[4]金針菇HMG-box轉(zhuǎn)錄因子鑒定及一個(gè)候選基因的差異表達(dá)分析[J]. 孟麗,王麗,劉芳,丑天勝,王威,謝寶貴. 菌物學(xué)報(bào). 2018(04)
[5]轉(zhuǎn)錄因子MoOaf22對(duì)稻瘟病菌營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)、細(xì)胞壁完整性和脅迫應(yīng)答的調(diào)控[J]. 齊中強(qiáng),杜艷,沈樂(lè)融,余振仙,于俊杰,俞咪娜,宋天巧,張榮勝,劉永鋒. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2017(06)
[6]蕓薹生鏈格孢產(chǎn)孢缺陷突變體的鑒定與表型分析[J]. 張倩倩,張曉斐,劉偉陽(yáng),崔文娟,侯欣,徐后娟. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(09)
[7]煙草C2H2鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定與表達(dá)分析[J]. 楊明磊,晁江濤,王大偉,胡軍華,吳華,龔達(dá)平,劉貫山. 遺傳. 2016(04)
[8]蕓薹鏈格孢菌孢子萌發(fā)及附著胞形成的初步定量研究[J]. 馬海霞,劉影,屈直,李丹,楊毅,楊信東. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(04)
[9]植物bZIP轉(zhuǎn)錄因子的生物學(xué)功能[J]. 張計(jì)育,渠慎春,郭忠仁,杜小麗,都貝貝,章鎮(zhèn). 西北植物學(xué)報(bào). 2011(05)
[10]bHLH轉(zhuǎn)錄因子對(duì)植物形態(tài)發(fā)生的影響[J]. 何開(kāi)平,吳楚. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2010(35)
博士論文
[1]梨樹(shù)腐爛病菌的轉(zhuǎn)錄組分析及兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的功能研究[D]. 何鋒.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]稻瘟病菌Zn2Cys6和bHLH家族轉(zhuǎn)錄因子功能分析[D]. 曹慧娟.浙江大學(xué) 2015
[3]大豆疫霉中參與氧化壓力應(yīng)答和致病過(guò)程的轉(zhuǎn)錄因子PsHSF1和PsBZPc32的功能分析[D]. 盛玉婷.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]植物內(nèi)生真菌無(wú)花果擬盤(pán)多毛孢的基因組及次級(jí)代謝研究[D]. 王秀娜.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[5]擬南芥AtHMGB15基因在花粉管萌發(fā)生長(zhǎng)過(guò)程中的功能研究[D]. 王玉嬌.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[6]擬南芥轉(zhuǎn)錄因子TGA7參與植物響應(yīng)干旱脅迫的機(jī)制研究[D]. 吳娟娟.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[7]小麥抗逆相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子bZIP和NAC基因的功能研究[D]. 張麗娜.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2014
[8]稻瘟病菌兩個(gè)新基因的功能研究[D]. 林艷.福建農(nóng)林大學(xué) 2007
[9]稻瘟病菌MGTA1基因的克隆與功能分析[D]. 王教瑜.浙江大學(xué) 2005
碩士論文
[1]核盤(pán)菌C2H2型鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子SsSte12的功能研究[D]. 徐廷滔.吉林大學(xué) 2018
[2]香菇木質(zhì)纖維素酶基因表達(dá)相關(guān)HMG-box轉(zhuǎn)錄因子lelcrp1功能分析[D]. 胡悅.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[3]番茄C2H2型鋅指蛋白生物信息學(xué)分析及抗逆相關(guān)基因鑒定[D]. 張佳.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[4]小麥鋅指轉(zhuǎn)錄因子基因TaZFP593和TaSAP1-1抵御非生物逆境的功能[D]. 陳耀仙.河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[5]水稻GRAS轉(zhuǎn)錄因子RAD1調(diào)控叢枝菌根共生的功能研究[D]. 劉迎娜.南京大學(xué) 2018
[6]蕓薹生鏈格孢轉(zhuǎn)錄因子基因Ab06986的克隆與功能研究[D]. 張敏.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[7]蕓薹生鏈格孢Abcdm1基因的克隆及功能初步分析[D]. 張曉斐.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018
[8]兩個(gè)Zn2Cys6鋅指蛋白對(duì)球孢白僵菌生長(zhǎng)及抗逆性的影響[D]. 李永霞.西南大學(xué) 2018
[9]蕓薹生鏈格孢(Alternaria brassicicola)AbSte12基因的鑒定及功能研究[D]. 張倩倩.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2017
[10]主要葉類(lèi)蔬菜新病害發(fā)現(xiàn)及常見(jiàn)真菌病害調(diào)查研究[D]. 宋加偉.中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院 2017
本文編號(hào):2965066
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