試驗(yàn)擴(kuò)增、克隆了在湖北地區(qū)采集的19份克氏原螯蝦(Procambarus clarkii)白斑綜合征病毒(White spot syndrome virus,WSSV)陽(yáng)性樣品的變異區(qū)ORF14/15和ORF23/24基因,通過(guò)測(cè)序比較分析了湖北各WSSV毒株與Gen Bank公布的標(biāo)準(zhǔn)毒株間在變異區(qū)ORF14/15及ORF23/24基因的差異性。結(jié)果顯示,19份WSSV陽(yáng)性樣品中有部分樣品在變異區(qū)擴(kuò)增出ORF14/15、ORF23/24基因片段,變異區(qū)基因序列分析發(fā)現(xiàn),與Gen Bank已公布的標(biāo)準(zhǔn)毒株相比,存在大片段缺失。在變異區(qū)ORF14/15,有3個(gè)毒株擴(kuò)增出1 442 bp的片段,4個(gè)毒株擴(kuò)增出630 bp的片段,基于變異區(qū)ORF14/15構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)顯示,這些毒株歸屬兩個(gè)不同的分支。在變異區(qū)ORF23/24,有2個(gè)毒株擴(kuò)增出大小為2 096 bp的片段,進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)這2個(gè)毒株在變異區(qū)ORF23/24的遺傳距離較近。 

【文章來(lái)源】：淡水漁業(yè). 2017年05期 北大核心

【文章頁(yè)數(shù)】：8 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 樣品采集
    1.2 主要試劑和儀器
    1.3 引物設(shè)計(jì)
    1.4 WSSV巢式PCR檢測(cè)
    1.5 WSSV變異區(qū)ORF14/15和ORF23/24基因擴(kuò)增
    1.6 WSSV變異區(qū)ORF14/15和ORF23/24基因的克隆及序列分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 WSSV巢式PCR檢測(cè)結(jié)果
    2.2 WSSV變異區(qū)ORF14/15基因擴(kuò)增與序列分析
    2.3 WSSV變異區(qū)ORF23/24基因擴(kuò)增與序列分析
    2.4 WSSV變異區(qū)進(jìn)化樹(shù)分析
3 討論


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]2014年中國(guó)不同地區(qū)對(duì)蝦白斑綜合征病毒ORF14/15和ORF23/24缺失區(qū)序列比較[J]. 孫新穎,劉慶慧,萬(wàn)曉媛,黃倢.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2016(04)
[2]白斑綜合征病毒2014年中國(guó)毒株變異區(qū)的序列比較[J]. 孫新穎,萬(wàn)曉媛,劉慶慧,黃倢.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2016(02)
[3]養(yǎng)殖克氏原螯蝦體內(nèi)白斑綜合征病毒的絕對(duì)定量分析[J]. 蘭江風(fēng),代云佳,林蠡.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2016(03)
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[5]白斑綜合征病毒廣西株缺失區(qū)基因的比較分析[J]. 童桂香,黎小正,韋信賢,楊先樂(lè),張益峰,吳祥慶,葉欣宇,黃國(guó)秋.  上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2014(01)
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碩士論文
[1]中國(guó)境內(nèi)白斑綜合征病毒（WSSV）分離株的序列差異分析[D]. 于洪濤.中國(guó)海洋大學(xué) 2008



本文編號(hào)：2948060