展望CRISPR/Cas9基因編輯技術在藥用植物研究中的應用
發(fā)布時間:2020-12-21 13:52
CRISPR/Cas9基因編輯技術是近幾年新發(fā)現(xiàn)的一種基因組定點編輯技術,該技術已經(jīng)廣泛應用在基因治療、基因功能研究、動物模型制造、農(nóng)作物品種改良等領域的研究中。該文簡要介紹了CRISPR/Cas9基因編輯技術,并提出了這項技術在藥用植物功能基因組學研究、活性成分次生代謝及合成生物學研究、藥用植物分子育種研究等方面的應用前景,為開辟藥用植物新領域的研究提供了參考。
【文章來源】:中國中藥雜志. 2016年16期 北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
RISPR/Cas9作用原理及sgRNA的結構
銜鎩?as蛋白編碼基因、前導序列(leadersequence)以及CRISPR序列組成,這些部件共同參與CRISPR/Cas系統(tǒng)的免疫防御功能[17]。1.2CRISPR/Cas系統(tǒng)的工作原理CRISPR系統(tǒng)分為3種類型,Ⅰ型和Ⅲ型系統(tǒng)均需多種Cas蛋白形成復合體才能行使切割功能[18-19],而Ⅱ型系統(tǒng)的特征性蛋白僅為1個Cas9蛋白,該蛋白具有加工產(chǎn)生crRNA和切割外源核酸的功能,Cas9蛋白、crRNA和tracrRNA三者共同作用即可對外源DNA進行靶向裂解[20-21],F(xiàn)在常用的CRISPR/Cas9系統(tǒng)即由Ⅱ型系統(tǒng)改造而來[22](圖1)。圖1CRISPR/Cas9作用原理及sgRNA的結構Fig.1ThemechanismofCRISPR/Cas9andthestructureofsgRNA當噬菌體或質(zhì)粒DNA入侵宿主細胞時,Cas9蛋白靶向并裂解噬菌體基因組中的原型間隔序列(protospacer),并將其整合到宿主基因組的CRISPR位點,然后將這些間隔序列轉錄成crRNA,在Cas9蛋白的參與下,靶向切割入侵的噬菌體DNA序列,與此同時,重復序列截取噬菌體的某些DNA片段形成CRISPR間隔序列,當同種噬菌體再次入侵時,間隔序列將會轉錄形成crRNA,這些crRNA與tracrRNA形成二級結構,與Cas9蛋白形成復合體,識別緊隨原型間隔序列后的原型間隔序列毗鄰基序(protospaceradjacentmotif,PAM),Cas9蛋白的核酸酶結構域切割與crRNA互補的雙鏈DNA形成DNA雙鏈斷裂(DSBs,DNAdouble-strandbreaks)。真核生物細胞內(nèi)存在著2種DNA修復方式,可以主動修復DSBs。一種是非末端同源交連(NHEJ,nonhomologousend-joining),修復后的DNA雙鏈經(jīng)常出現(xiàn)個別堿基的缺失或插入,從而導致基因功能的改變;另一種是同源重組修復(HDR,homology-directedrepair)方式,常引起堿基的替換。在自然條件下,同源重組修復出現(xiàn)的概率極低,
銜鎩?as蛋白編碼基因、前導序列(leadersequence)以及CRISPR序列組成,這些部件共同參與CRISPR/Cas系統(tǒng)的免疫防御功能[17]。1.2CRISPR/Cas系統(tǒng)的工作原理CRISPR系統(tǒng)分為3種類型,Ⅰ型和Ⅲ型系統(tǒng)均需多種Cas蛋白形成復合體才能行使切割功能[18-19],而Ⅱ型系統(tǒng)的特征性蛋白僅為1個Cas9蛋白,該蛋白具有加工產(chǎn)生crRNA和切割外源核酸的功能,Cas9蛋白、crRNA和tracrRNA三者共同作用即可對外源DNA進行靶向裂解[20-21],F(xiàn)在常用的CRISPR/Cas9系統(tǒng)即由Ⅱ型系統(tǒng)改造而來[22](圖1)。圖1CRISPR/Cas9作用原理及sgRNA的結構Fig.1ThemechanismofCRISPR/Cas9andthestructureofsgRNA當噬菌體或質(zhì)粒DNA入侵宿主細胞時,Cas9蛋白靶向并裂解噬菌體基因組中的原型間隔序列(protospacer),并將其整合到宿主基因組的CRISPR位點,然后將這些間隔序列轉錄成crRNA,在Cas9蛋白的參與下,靶向切割入侵的噬菌體DNA序列,與此同時,重復序列截取噬菌體的某些DNA片段形成CRISPR間隔序列,當同種噬菌體再次入侵時,間隔序列將會轉錄形成crRNA,這些crRNA與tracrRNA形成二級結構,與Cas9蛋白形成復合體,識別緊隨原型間隔序列后的原型間隔序列毗鄰基序(protospaceradjacentmotif,PAM),Cas9蛋白的核酸酶結構域切割與crRNA互補的雙鏈DNA形成DNA雙鏈斷裂(DSBs,DNAdouble-strandbreaks)。真核生物細胞內(nèi)存在著2種DNA修復方式,可以主動修復DSBs。一種是非末端同源交連(NHEJ,nonhomologousend-joining),修復后的DNA雙鏈經(jīng)常出現(xiàn)個別堿基的缺失或插入,從而導致基因功能的改變;另一種是同源重組修復(HDR,homology-directedrepair)方式,常引起堿基的替換。在自然條件下,同源重組修復出現(xiàn)的概率極低,
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物基因組編輯及衍生技術最新研究進展[J]. 單奇?zhèn)?高彩霞. 遺傳. 2015(10)
[2]Targeted Mutagenesis in Zea mays Using TALENs and the CRISPR/Cas System[J]. Zhen Liang,Kang Zhang,Kunling Chen,Caixia Gao. Journal of Genetics and Genomics. 2014(02)
[3]合成生物學在中藥資源可持續(xù)利用研究中的應用[J]. 黃璐琦,高偉,周雍進. 藥學學報. 2014(01)
本文編號:2929937
【文章來源】:中國中藥雜志. 2016年16期 北大核心
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
RISPR/Cas9作用原理及sgRNA的結構
銜鎩?as蛋白編碼基因、前導序列(leadersequence)以及CRISPR序列組成,這些部件共同參與CRISPR/Cas系統(tǒng)的免疫防御功能[17]。1.2CRISPR/Cas系統(tǒng)的工作原理CRISPR系統(tǒng)分為3種類型,Ⅰ型和Ⅲ型系統(tǒng)均需多種Cas蛋白形成復合體才能行使切割功能[18-19],而Ⅱ型系統(tǒng)的特征性蛋白僅為1個Cas9蛋白,該蛋白具有加工產(chǎn)生crRNA和切割外源核酸的功能,Cas9蛋白、crRNA和tracrRNA三者共同作用即可對外源DNA進行靶向裂解[20-21],F(xiàn)在常用的CRISPR/Cas9系統(tǒng)即由Ⅱ型系統(tǒng)改造而來[22](圖1)。圖1CRISPR/Cas9作用原理及sgRNA的結構Fig.1ThemechanismofCRISPR/Cas9andthestructureofsgRNA當噬菌體或質(zhì)粒DNA入侵宿主細胞時,Cas9蛋白靶向并裂解噬菌體基因組中的原型間隔序列(protospacer),并將其整合到宿主基因組的CRISPR位點,然后將這些間隔序列轉錄成crRNA,在Cas9蛋白的參與下,靶向切割入侵的噬菌體DNA序列,與此同時,重復序列截取噬菌體的某些DNA片段形成CRISPR間隔序列,當同種噬菌體再次入侵時,間隔序列將會轉錄形成crRNA,這些crRNA與tracrRNA形成二級結構,與Cas9蛋白形成復合體,識別緊隨原型間隔序列后的原型間隔序列毗鄰基序(protospaceradjacentmotif,PAM),Cas9蛋白的核酸酶結構域切割與crRNA互補的雙鏈DNA形成DNA雙鏈斷裂(DSBs,DNAdouble-strandbreaks)。真核生物細胞內(nèi)存在著2種DNA修復方式,可以主動修復DSBs。一種是非末端同源交連(NHEJ,nonhomologousend-joining),修復后的DNA雙鏈經(jīng)常出現(xiàn)個別堿基的缺失或插入,從而導致基因功能的改變;另一種是同源重組修復(HDR,homology-directedrepair)方式,常引起堿基的替換。在自然條件下,同源重組修復出現(xiàn)的概率極低,
銜鎩?as蛋白編碼基因、前導序列(leadersequence)以及CRISPR序列組成,這些部件共同參與CRISPR/Cas系統(tǒng)的免疫防御功能[17]。1.2CRISPR/Cas系統(tǒng)的工作原理CRISPR系統(tǒng)分為3種類型,Ⅰ型和Ⅲ型系統(tǒng)均需多種Cas蛋白形成復合體才能行使切割功能[18-19],而Ⅱ型系統(tǒng)的特征性蛋白僅為1個Cas9蛋白,該蛋白具有加工產(chǎn)生crRNA和切割外源核酸的功能,Cas9蛋白、crRNA和tracrRNA三者共同作用即可對外源DNA進行靶向裂解[20-21],F(xiàn)在常用的CRISPR/Cas9系統(tǒng)即由Ⅱ型系統(tǒng)改造而來[22](圖1)。圖1CRISPR/Cas9作用原理及sgRNA的結構Fig.1ThemechanismofCRISPR/Cas9andthestructureofsgRNA當噬菌體或質(zhì)粒DNA入侵宿主細胞時,Cas9蛋白靶向并裂解噬菌體基因組中的原型間隔序列(protospacer),并將其整合到宿主基因組的CRISPR位點,然后將這些間隔序列轉錄成crRNA,在Cas9蛋白的參與下,靶向切割入侵的噬菌體DNA序列,與此同時,重復序列截取噬菌體的某些DNA片段形成CRISPR間隔序列,當同種噬菌體再次入侵時,間隔序列將會轉錄形成crRNA,這些crRNA與tracrRNA形成二級結構,與Cas9蛋白形成復合體,識別緊隨原型間隔序列后的原型間隔序列毗鄰基序(protospaceradjacentmotif,PAM),Cas9蛋白的核酸酶結構域切割與crRNA互補的雙鏈DNA形成DNA雙鏈斷裂(DSBs,DNAdouble-strandbreaks)。真核生物細胞內(nèi)存在著2種DNA修復方式,可以主動修復DSBs。一種是非末端同源交連(NHEJ,nonhomologousend-joining),修復后的DNA雙鏈經(jīng)常出現(xiàn)個別堿基的缺失或插入,從而導致基因功能的改變;另一種是同源重組修復(HDR,homology-directedrepair)方式,常引起堿基的替換。在自然條件下,同源重組修復出現(xiàn)的概率極低,
【參考文獻】:
期刊論文
[1]植物基因組編輯及衍生技術最新研究進展[J]. 單奇?zhèn)?高彩霞. 遺傳. 2015(10)
[2]Targeted Mutagenesis in Zea mays Using TALENs and the CRISPR/Cas System[J]. Zhen Liang,Kang Zhang,Kunling Chen,Caixia Gao. Journal of Genetics and Genomics. 2014(02)
[3]合成生物學在中藥資源可持續(xù)利用研究中的應用[J]. 黃璐琦,高偉,周雍進. 藥學學報. 2014(01)
本文編號:2929937
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