家蠶tRNA-isopentenyltransferase(BmIPT)基因的克隆及其功能研究
發(fā)布時(shí)間:2020-12-19 17:52
家蠶(Bombyx mori)是一種重要的經(jīng)濟(jì)昆蟲,其生長(zhǎng)速度快、繭層率高,具有高效的蛋白質(zhì)合成能力。Transfer RNAs(tRNA)是蛋白質(zhì)翻譯過程中的適配器,其在蛋白翻譯過程中發(fā)揮著重要的樞紐作用。眾多研究顯示,大部分生物會(huì)將其所編碼基因的1%-10%用在tRNA的轉(zhuǎn)錄后修飾上,以實(shí)現(xiàn)對(duì)其活性的調(diào)控。如果密碼子的第一個(gè)堿基為A或U,在許多生物對(duì)應(yīng)的tRNA的37位腺嘌呤堿基上經(jīng)常會(huì)進(jìn)行異戊烯基化修飾,即N6-isopentenyladenosine(i6A37)。已有研究顯示tRNA的37位腺嘌呤異戊烯基修飾會(huì)顯著影響蛋白質(zhì)翻譯的精確性及效率,其是通過異戊烯基轉(zhuǎn)移酶(tRNA-isopentenyltransferase,IPT)實(shí)現(xiàn)的。在不同物種中,已證實(shí)異戊烯基轉(zhuǎn)移酶基因突變會(huì)對(duì)氨基酸加載以及對(duì)生物體生長(zhǎng)發(fā)育的產(chǎn)生不同程度的影響。本課題著重于探索tRNA的37位腺嘌呤堿基異戊烯基化修飾對(duì)蠶體、特別是絲腺蛋白質(zhì)合成的影響。本文擬首先在家蠶中鑒定異戊烯基轉(zhuǎn)移酶基因,通過對(duì)缺陷型酵母功能互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證其功能,然后基于RNAi、轉(zhuǎn)基因過量表達(dá)等手段研究該基因下調(diào)及上調(diào)表達(dá)對(duì)家蠶吐絲...
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
延伸過程
圖 1.3 tRNA 修飾的重要性[23]Fig 1.3 Pivotal roles of nucleoside modification for tRNA function顯著影響翻譯的效率和準(zhǔn)確性的重要因素之一。細(xì)胞中 tRN率的影響是翻譯研究的一個(gè)重要課題[24]。修飾是由常見的 20 種氨基酸組成,但是 tRNA 分子僅由四種核糖行使其功能多樣性,就要依靠大量的轉(zhuǎn)錄后修飾[25]。例如,須進(jìn)行折疊,5'和 3'加工以除去前導(dǎo)序列,3’端添加有 CCA ,同時(shí)在整個(gè)過程中發(fā)生多個(gè)復(fù)雜的化學(xué)修飾,才會(huì)形另外,還需要對(duì) tRNA 各個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行修飾,從而使其發(fā)揮正NA的修飾主要有5-羥基尿苷(Xo5U)、5-羧甲基氨甲基尿苷(C甲基尿苷(mCm5U)、5-甲基-2硫代尿苷(Xm5s2U)、2-賴氨酸胞基尿苷(Com5U)、次黃嘌呤(I)、7-甲基尿苷(m7G)、5-甲基胞苷m6A)、2-硫代胞苷(s2C)、假尿苷(ψ)、N6-蘇氨酸羰酸腺苷
NA 的異戊烯基化修飾細(xì)菌和真核生物體中,當(dāng) mRNA 中的第一位密碼子是腺苷或尿苷時(shí),所NA 在與反密碼子相鄰的 3'-腺苷(A37)處是一個(gè)超修飾核苷酸,其中修飾是最常見的一種修飾。戊烯基化修飾這種龐大而疏水的高等修飾被認(rèn)為涉及穩(wěn)定譯碼過程中反密碼子之間內(nèi)在弱的 A-U 堿基配對(duì)相互作用,這基于兩個(gè)基本原理假異戊烯基化基團(tuán)可能使反密碼子環(huán)的閉合構(gòu)象不穩(wěn)定,并賦予經(jīng)典的 象的熱力學(xué)穩(wěn)定性,導(dǎo)致在解碼之前暴露反密碼子環(huán)[47, 48],如圖 1.4 所A 處于非修飾狀態(tài)時(shí),37 位上的腺嘌呤核苷酸會(huì)與 33 位上的尿嘧啶核苷對(duì),從而使其反密碼子環(huán)被隱藏起來,當(dāng) tRNA 與 DMAPP 相互作用時(shí)腺嘌呤核苷酸會(huì)被暴露出來,當(dāng) 37 位上的腺嘌呤核苷酸被異戊烯基化其反密碼子環(huán)被徹底暴露出來,從而使得 tRNA 可以參與之后的翻譯過程 1.4 所示)。tRNA 異戊烯基化修飾的具體方程式如圖 1.5 所示。其次,這飾可能改善核糖體A位密碼子-反密碼子微螺旋的鏈間堿基堆積相互作
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蛋白質(zhì)翻譯過程中的忠實(shí)性機(jī)制[J]. 謝兆輝. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2011(09)
[2]tRNA的結(jié)構(gòu)、功能及合成簡(jiǎn)介[J]. 俎魯霞,徐國(guó)恒. 生物學(xué)通報(bào). 2008(01)
[3]在分子基礎(chǔ)上展示真核轉(zhuǎn)錄過程——2006年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)獲得者羅杰·科恩伯格[J]. 郭丹,馬宏佳,李甜. 生命的化學(xué). 2007(01)
[4]真核生物轉(zhuǎn)錄的發(fā)現(xiàn)[J]. 郭曉強(qiáng). 生命的化學(xué). 2004(06)
[5]影響家蠶脂肪體增長(zhǎng)的若干因素[J]. 沈衛(wèi)德,胡雨亭. 中國(guó)蠶業(yè). 1999(04)
碩士論文
[1]tRNA資源優(yōu)化配置對(duì)釀酒酵母翻譯速率的影響研究[D]. Siddiq ur Rahman.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
本文編號(hào):2926324
【文章來源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:99 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
延伸過程
圖 1.3 tRNA 修飾的重要性[23]Fig 1.3 Pivotal roles of nucleoside modification for tRNA function顯著影響翻譯的效率和準(zhǔn)確性的重要因素之一。細(xì)胞中 tRN率的影響是翻譯研究的一個(gè)重要課題[24]。修飾是由常見的 20 種氨基酸組成,但是 tRNA 分子僅由四種核糖行使其功能多樣性,就要依靠大量的轉(zhuǎn)錄后修飾[25]。例如,須進(jìn)行折疊,5'和 3'加工以除去前導(dǎo)序列,3’端添加有 CCA ,同時(shí)在整個(gè)過程中發(fā)生多個(gè)復(fù)雜的化學(xué)修飾,才會(huì)形另外,還需要對(duì) tRNA 各個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行修飾,從而使其發(fā)揮正NA的修飾主要有5-羥基尿苷(Xo5U)、5-羧甲基氨甲基尿苷(C甲基尿苷(mCm5U)、5-甲基-2硫代尿苷(Xm5s2U)、2-賴氨酸胞基尿苷(Com5U)、次黃嘌呤(I)、7-甲基尿苷(m7G)、5-甲基胞苷m6A)、2-硫代胞苷(s2C)、假尿苷(ψ)、N6-蘇氨酸羰酸腺苷
NA 的異戊烯基化修飾細(xì)菌和真核生物體中,當(dāng) mRNA 中的第一位密碼子是腺苷或尿苷時(shí),所NA 在與反密碼子相鄰的 3'-腺苷(A37)處是一個(gè)超修飾核苷酸,其中修飾是最常見的一種修飾。戊烯基化修飾這種龐大而疏水的高等修飾被認(rèn)為涉及穩(wěn)定譯碼過程中反密碼子之間內(nèi)在弱的 A-U 堿基配對(duì)相互作用,這基于兩個(gè)基本原理假異戊烯基化基團(tuán)可能使反密碼子環(huán)的閉合構(gòu)象不穩(wěn)定,并賦予經(jīng)典的 象的熱力學(xué)穩(wěn)定性,導(dǎo)致在解碼之前暴露反密碼子環(huán)[47, 48],如圖 1.4 所A 處于非修飾狀態(tài)時(shí),37 位上的腺嘌呤核苷酸會(huì)與 33 位上的尿嘧啶核苷對(duì),從而使其反密碼子環(huán)被隱藏起來,當(dāng) tRNA 與 DMAPP 相互作用時(shí)腺嘌呤核苷酸會(huì)被暴露出來,當(dāng) 37 位上的腺嘌呤核苷酸被異戊烯基化其反密碼子環(huán)被徹底暴露出來,從而使得 tRNA 可以參與之后的翻譯過程 1.4 所示)。tRNA 異戊烯基化修飾的具體方程式如圖 1.5 所示。其次,這飾可能改善核糖體A位密碼子-反密碼子微螺旋的鏈間堿基堆積相互作
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蛋白質(zhì)翻譯過程中的忠實(shí)性機(jī)制[J]. 謝兆輝. 中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)報(bào). 2011(09)
[2]tRNA的結(jié)構(gòu)、功能及合成簡(jiǎn)介[J]. 俎魯霞,徐國(guó)恒. 生物學(xué)通報(bào). 2008(01)
[3]在分子基礎(chǔ)上展示真核轉(zhuǎn)錄過程——2006年諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)獲得者羅杰·科恩伯格[J]. 郭丹,馬宏佳,李甜. 生命的化學(xué). 2007(01)
[4]真核生物轉(zhuǎn)錄的發(fā)現(xiàn)[J]. 郭曉強(qiáng). 生命的化學(xué). 2004(06)
[5]影響家蠶脂肪體增長(zhǎng)的若干因素[J]. 沈衛(wèi)德,胡雨亭. 中國(guó)蠶業(yè). 1999(04)
碩士論文
[1]tRNA資源優(yōu)化配置對(duì)釀酒酵母翻譯速率的影響研究[D]. Siddiq ur Rahman.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2015
本文編號(hào):2926324
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