水黃皮種子發(fā)育過(guò)程中含油特性及基因表達(dá)譜分析
發(fā)布時(shí)間:2020-12-07 16:50
水黃皮(Millettia pinnata)為豆科(Leguminosae)崖豆藤屬(Millettia)植物,因其種子具有較高含量的非食用油脂而成為生物柴油的潛在原料樹(shù)種。培育具有商業(yè)應(yīng)用價(jià)值的水黃皮品種有賴于對(duì)其種子發(fā)育過(guò)程中調(diào)節(jié)油脂積累的分子機(jī)制進(jìn)行系統(tǒng)了解。到目前為止,此物種中只有有限的基因組序列或轉(zhuǎn)錄本序列被分離并用于研究,對(duì)其種子不同發(fā)育階段的基因表達(dá)模式尚未有報(bào)道。本研究擬通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)水黃皮種子三個(gè)發(fā)育階段進(jìn)行RNA-Seq分析,以了解此發(fā)育過(guò)程中基因表達(dá)的變化特點(diǎn)及其與油脂代謝變化的相關(guān)性。本論文首先基于種子胚胎形態(tài)、干重、鮮重及含水量等多方面特征,確定了水黃皮種子三個(gè)主要發(fā)育階段,即胚胎形成期、灌漿期和脫水期的時(shí)間范圍。然后,應(yīng)用RNA-Seq量化分析三個(gè)發(fā)育階段的基因表達(dá)水平,每個(gè)階段各進(jìn)行了三次生物學(xué)重復(fù)。測(cè)序結(jié)果表明,高達(dá)93.88%的unigenes在三個(gè)發(fā)育階段均有被表達(dá),只有不到2%的unigenes僅在其中一個(gè)階段特異性表達(dá);共發(fā)現(xiàn)8,881個(gè)在任意兩個(gè)階段間存在顯著差異表達(dá)的基因(Differentially Expressed Genes,D...
【文章來(lái)源】:深圳大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
水黃皮種子發(fā)育過(guò)程觀測(cè)圖
圖 2 水黃皮種子發(fā)育過(guò)程中含油量變化圖此外,本研究分析了上述 6 個(gè)時(shí)間點(diǎn)提取到的油脂的脂肪酸組成。結(jié)果主要發(fā)現(xiàn)七種類型的脂肪酸,包括 C16:0(棕櫚酸)、C18:0(硬脂酸)、C18:1(油酸)、C18:2(亞酸)、C18:3(亞麻酸)、C20:0(花生酸)、C24:0(山崳酸),且在所有樣品中均有被檢測(cè)(表 3)。而某些類型的脂肪酸,如 C14:0(肉豆蔻酸)和 C24:0(二十四烷酸)只有在特定表 3 水黃皮種子不同發(fā)育時(shí)期的脂肪酸組分測(cè)定開(kāi)花后周數(shù)C16:0 (%) C18:0 (%) C18:1 (%) C18:2 (%) C18:3 (%) C20:0 (%) C22:0 (%) Others 10 14.10%±0.17 7.86%±0.10 27.30%±0.26 49.40%±0.09 0.32%±0.03 0.64%±0.08 0.28%±0.05 0.10%±014 12.98%±0.26 7.62%±0.47 31.75%±0.73 46.60%±0.27 0.25%±0.01 0.51%±0.08 0.21%±0.03 0.09%±0
水黃皮種子發(fā)育過(guò)程中含油特性及基因表達(dá)譜分析酶(linoleate 9S-lipoxygenase)的基因(Ug22769)在 MpSII 和 MpSII,編碼;d體蛋白的基因(Ug22773)在 MpSI 階段高表達(dá)。另一方面,1 個(gè) unigenes 分別在 MpSI、MpSII 和 MpSIII 階段特異性表達(dá)(圖 4)。大表達(dá)基因編碼的蛋白質(zhì)參與了轉(zhuǎn)錄和翻譯過(guò)程的調(diào)節(jié)。同樣,這些在特基因有部分與油脂代謝有關(guān)。比如 ACP 基因(Ug28085),脂肪酸去飽和基urase gene,Ug50523),脂肪酸羥化酶基因(FA hydroxylase gene,Ug50;d體蛋白合成酶基因(3-oxoacyl-ACP synthase gene,Ug42167)和輔酶 A 還原酶基因(long-chain enoyl-CoA reductase gene,Ug51546)在,一個(gè);-輔酶 A 硫酯酶基因(acyl-coA thioesterase gene,Ug43564)達(dá),兩個(gè)脂肪酶基因(Ug36735 和 Ug44985)在 MpSIII 階段表達(dá)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]半紅樹(shù)植物水黃皮特征特性及培育技術(shù)[J]. 陳文山. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2017(12)
[2]半紅樹(shù)植物水黃皮分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J]. 黃健子,張萬(wàn)科,黃榮峰,鄭易之. 生物工程學(xué)報(bào). 2015(04)
[3]植物油脂合成代謝及調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 周丹,趙江哲,柏楊,張群,井文,章文華. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[4]國(guó)內(nèi)外生物柴油研究進(jìn)展[J]. 薛志忠,吳新海. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2010(16)
[5]我國(guó)胎生植物概述[J]. 戴錫玲,龐婉婷,王全喜. 生物學(xué)教學(xué). 2008(04)
[6]基因芯片技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 霍金龍,苗永旺,曾養(yǎng)志. 生物技術(shù)通訊. 2007(02)
碩士論文
[1]油菜發(fā)育種子中油脂積累與Kennedy途徑酶活性的關(guān)系研究[D]. 戚維聰.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):2903582
【文章來(lái)源】:深圳大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】:59 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
水黃皮種子發(fā)育過(guò)程觀測(cè)圖
圖 2 水黃皮種子發(fā)育過(guò)程中含油量變化圖此外,本研究分析了上述 6 個(gè)時(shí)間點(diǎn)提取到的油脂的脂肪酸組成。結(jié)果主要發(fā)現(xiàn)七種類型的脂肪酸,包括 C16:0(棕櫚酸)、C18:0(硬脂酸)、C18:1(油酸)、C18:2(亞酸)、C18:3(亞麻酸)、C20:0(花生酸)、C24:0(山崳酸),且在所有樣品中均有被檢測(cè)(表 3)。而某些類型的脂肪酸,如 C14:0(肉豆蔻酸)和 C24:0(二十四烷酸)只有在特定表 3 水黃皮種子不同發(fā)育時(shí)期的脂肪酸組分測(cè)定開(kāi)花后周數(shù)C16:0 (%) C18:0 (%) C18:1 (%) C18:2 (%) C18:3 (%) C20:0 (%) C22:0 (%) Others 10 14.10%±0.17 7.86%±0.10 27.30%±0.26 49.40%±0.09 0.32%±0.03 0.64%±0.08 0.28%±0.05 0.10%±014 12.98%±0.26 7.62%±0.47 31.75%±0.73 46.60%±0.27 0.25%±0.01 0.51%±0.08 0.21%±0.03 0.09%±0
水黃皮種子發(fā)育過(guò)程中含油特性及基因表達(dá)譜分析酶(linoleate 9S-lipoxygenase)的基因(Ug22769)在 MpSII 和 MpSII,編碼;d體蛋白的基因(Ug22773)在 MpSI 階段高表達(dá)。另一方面,1 個(gè) unigenes 分別在 MpSI、MpSII 和 MpSIII 階段特異性表達(dá)(圖 4)。大表達(dá)基因編碼的蛋白質(zhì)參與了轉(zhuǎn)錄和翻譯過(guò)程的調(diào)節(jié)。同樣,這些在特基因有部分與油脂代謝有關(guān)。比如 ACP 基因(Ug28085),脂肪酸去飽和基urase gene,Ug50523),脂肪酸羥化酶基因(FA hydroxylase gene,Ug50;d體蛋白合成酶基因(3-oxoacyl-ACP synthase gene,Ug42167)和輔酶 A 還原酶基因(long-chain enoyl-CoA reductase gene,Ug51546)在,一個(gè);-輔酶 A 硫酯酶基因(acyl-coA thioesterase gene,Ug43564)達(dá),兩個(gè)脂肪酶基因(Ug36735 和 Ug44985)在 MpSIII 階段表達(dá)。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]半紅樹(shù)植物水黃皮特征特性及培育技術(shù)[J]. 陳文山. 安徽農(nóng)學(xué)通報(bào). 2017(12)
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[3]植物油脂合成代謝及調(diào)控的研究進(jìn)展[J]. 周丹,趙江哲,柏楊,張群,井文,章文華. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(05)
[4]國(guó)內(nèi)外生物柴油研究進(jìn)展[J]. 薛志忠,吳新海. 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技. 2010(16)
[5]我國(guó)胎生植物概述[J]. 戴錫玲,龐婉婷,王全喜. 生物學(xué)教學(xué). 2008(04)
[6]基因芯片技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 霍金龍,苗永旺,曾養(yǎng)志. 生物技術(shù)通訊. 2007(02)
碩士論文
[1]油菜發(fā)育種子中油脂積累與Kennedy途徑酶活性的關(guān)系研究[D]. 戚維聰.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2008
本文編號(hào):2903582
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