本研究利用RT-PCR、TA克隆和重亞硫酸鹽測序（BSP）等方法,旨在克隆、分析山羊STAT3基因完整編碼區(qū),并解析該基因甲基化修飾水平及其與體重的關(guān)系。結(jié)果表明,山羊STAT3基因編碼區(qū)全長2 313bp,編碼770個氨基酸;與綿羊、牛、野豬、小鼠、大鼠和人的氨基酸序列一致性分別為99.7%、99.6%、99.4%、99.2%、99.4%和99.5%。山羊高體重組與低體重組之間甲基化差異研究發(fā)現(xiàn),高體重組STAT3基因啟動子區(qū)甲基化水平顯著高于低體重組（P=0.020）,提示該基因甲基化修飾對體重具有顯著影響,可作為標(biāo)記輔助選擇（MAS）的有效表觀遺傳標(biāo)記。這些結(jié)果為研究山羊肉用性能的遺傳與表觀遺傳機制提供了科學(xué)資料。 

【文章來源】：畜牧獸醫(yī)學(xué)報. 2016年03期 第457-466頁 北大核心

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圖１山羊ＳＴＡＴ３基因的ＲＴ－ＰＣＲ電泳結(jié)果Ｆｉｇ．１ＴｈｅＲＴ－ＰＣＲｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓｒｅｓｕｌｔｓｏｆｔｈｅｇｏａｔＳＴＡＴ３ｇｅｎｅ

畜牧獸醫(yī)學(xué)報４７卷圖１山羊ＳＴＡＴ３基因的ＲＴ－ＰＣＲ電泳結(jié)果Ｆｉｇ．１ＴｈｅＲＴ－ＰＣＲｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓｒｅｓｕｌｔｓｏｆｔｈｅｇｏａｔＳＴＡＴ３ｇｅｎｅ２．２山羊ＳＴＡＴ３氨基酸序列的系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建將山羊ＳＴＡＴ３氨基酸序列與牛（ＮＰ＿００１０１２６８９）、人（ＡＡＳ６６９８６）、小鼠（ＡＡＡ１９４５２）、大鼠（ＡＡＨ８７０２５）、野豬（ＡＢＦ２１１５０）、綿羊（ＸＰ＿００４０１２９７４）氨基酸序列進(jìn)行同源性比對，發(fā)現(xiàn)它們高度同源；在氨基酸同源性分析中（圖３），山羊ＳＴＡＴ３基因氨基酸序列與牛、綿羊、小鼠、大鼠、野豬和人氨基酸序列的相似性分別為９９．６％、９９．７％、９９．２％、９９．４％、９９．４％和９９．５％。系統(tǒng)發(fā)育樹顯示（圖４），山羊與牛的親緣關(guān)系最為接近，與人類、大鼠、小鼠和綿羊親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。圖２山羊ＳＴＡＴ３基因ＣＤＳ與氨基酸序列Ｆｉｇ．２ＴｈｅＣＤＳａｎｄａｍｉｎｏａｃｉｄｓｅｑｕｅｎｃｅｏｆｔｈｅｇｏａｔＳＴＡＴ３ｇｅｎｅ４６０

畜牧獸醫(yī)學(xué)報４７卷圖４不同物種ＳＴＡＴ３基因的系統(tǒng)發(fā)育樹Ｆｉｇ．４ＰｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃｔｒｅｅｏｆＳＴＡＴ３ｇｅｎｅａｍｏｎｇｖａｒｉｏｕｓｓｐｅｃｉｅｓＴｒｐ（１．９％）、Ｔｙｒ（２．７％）和Ｖａｌ（５．３％）。其不穩(wěn)定系數(shù)為４９．５８，且預(yù)計在哺乳動物網(wǎng)織紅細(xì)胞內(nèi)半衰期為３０ｈ；脂溶指數(shù)為８３．５８，總平均疏水指數(shù)－０．４００，屬親水蛋白。２．３．２山羊ＳＴＡＴ３蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測山羊ＳＴＡＴ３蛋白主要由α－螺旋（４６．６２％）、β折疊（１８．１８％）、β轉(zhuǎn)角（７．４０％）及無規(guī)則卷曲（２７．７９％）構(gòu)成。采用ＳＷＩＳＳ－ＭＯＤＥＬ和ＰｙＭｏｌ軟件對山羊ＳＴＡＴ３建模獲得二級結(jié)構(gòu)模型及結(jié)構(gòu)域的預(yù)測（圖５，圖６）。圖５山羊ＳＴＡＴ３蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)分析Ｆｉｇ．５ＴｈｅｓｅｃｏｎｄａｒｙｓｔｒｕｃｔｕｒｅａｎａｌｙｓｉｓｏｆｇｏａｔＳＴＡＴ３ｐｒｏｔｅｉｎ圖６山羊ＳＴＡＴ３蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域Ｆｉｇ．６ＰｒｏｔｅｉｎｄｏｍａｉｎｓｏｆｇｏａｔＳＴＡＴ３２．３．３山羊ＳＴＡＴ３亞細(xì)胞定位、蛋白磷酸化和糖基化位點預(yù)測山羊ＳＴＡＴ３蛋白在細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核、線粒體基質(zhì)、內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、膜泡分泌系統(tǒng)及質(zhì)膜中的分布比例分別為３４．８％、３０．４％、１７．４％、８．７％、４．３％和４．３％，在細(xì)胞質(zhì)中分布最多。磷酸化分析顯示（圖７ａ），山羊ＳＴＡＴ３蛋白存在較多的絲氨酸（Ｓｅｒ）磷酸化位點，而酪氨酸（Ｔｙｒ）和蘇氨酸（Ｔｈｒ）磷酸化位點較少。糖基化位點分析表明

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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本文編號：2902388