苗期短日照對煙草發(fā)育進程及鈣依賴蛋白激酶基因表達的影響
【學位單位】:西南大學
【學位級別】:碩士
【學位年份】:2017
【中圖分類】:S572
【部分圖文】:
CDPK結構
第 3 章 苗期短日照處理條件下煙苗莖尖的基因表達譜分析A1、A2、A3 是興煙 1 號 8h/d 的三個重復;B1、B2、B3 是興煙 1 號 12h/d 的三個重復;C1、C2、C3 是云煙 85 8h/d 的三個重復;D1、D2、D3 是云煙 85 12h/d 的三個重復。Note: the red region of the map indicates that the gene expression is up regulated, and the green region indicates that the gene expression isdown regulated.A1, A2 and A3 are three repeats of Xingyan 1 8h/d, B1, B2, and B3 are the three repeats of Xingyan 1 12h/d, C1, C2, and C3 are threerepeats of Yunyan 85 8h/d, D1, D2, and D3 are three repeats of Yunyan 85 12h/d.3.2.2處理間基因芯片檢測結果對興煙 1 號以及云煙 85 不同處理下基因表達情況進行比較分析并繪制散點圖。從圖 3.2 可以看出,大多數(shù)基因在兩種日照處理下的表達基本無差異,只有極少數(shù)的基因表達量有明顯的上調(diào)或者下調(diào)。
強因子 MEF2B ,MADS-box 基因蛋白是與花的分生和花器官發(fā)育有關的。3.2.3不同品種間的基因芯片檢測結果在苗期 8h/d 處理下,與興煙 1 號相比,在云煙 85 中檢測到有差異表達的基因182 個,其中有 137 個基因表達量上調(diào),45 個基因表達量下調(diào),上調(diào)表達基因數(shù)量是下調(diào)表達基因的三倍左右。從散點圖 3.3 中可以看出大部分基因的表達差異都不明顯,只有極少數(shù)基因的表達差異比較大。KEGG 功能富集沒有找到有顯著變化的通路,GO 功能富集得到 33 個信號通路,其中顯著變化的信號通路有兩條,分別是碳利用和細胞葡聚糖代謝的信號通路。在苗期 12h/d 處理下,與興煙 1 號相比,在云煙 85 中檢測到有差異表達的基因 362 個,有 225 個基因表達量上調(diào),137 個基因表達量下調(diào),上調(diào)表達基因數(shù)目近乎是下調(diào)表達基因的兩倍。從散點圖 3.3 中可以看出絕大部分基因的表達沒有明顯的差異,但是有少數(shù)基因的表達有較大的差異。通過 KEGG 功能富集分析找出了 118 個差異表達基因,但沒有找到變化顯著的信號通路。GO 功能富集得到了49 個信號通路,其中并沒有變化顯著的信號通路。
【參考文獻】
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本文編號:2858390
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