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水稻粒寬和粒重調(diào)控基因GW5L的克隆與功能分析

發(fā)布時(shí)間:2020-07-26 09:28
【摘要】:水稻(Oryza sativa L.)是世界上最重要的糧食作物之一,養(yǎng)活全球近60%的人口。近年來(lái)隨著環(huán)境問(wèn)題加劇、耕地面積減少,提高谷物產(chǎn)量已成為水稻生產(chǎn)的一個(gè)重大挑戰(zhàn)。籽粒形狀不僅決定粒重、影響水稻產(chǎn)量,而且影響稻米的品質(zhì)和市場(chǎng)價(jià)值。隨著現(xiàn)代分子生物學(xué)的發(fā)展以及水稻基因組測(cè)序的完成,越來(lái)越多的粒型調(diào)控基因在水稻中被克隆。然而,由于研究者對(duì)關(guān)鍵調(diào)控基因的分子機(jī)理知之甚少,加之實(shí)際育種過(guò)程中存在不良性狀連鎖等問(wèn)題,已克隆的粒型調(diào)控基因的利用率并不高。因此,繼續(xù)克隆調(diào)控粒型的關(guān)鍵基因,解析粒型調(diào)控的分子機(jī)理,對(duì)于培育高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)水稻新品種具有重要意義。本研究通過(guò)同源克隆的方式克隆了水稻粒型基因GW5L,它是粒寬主效QTL GW5的同源基因,編碼一個(gè)膜定位的IQ蛋白。GW5L可以與GSK2蛋白激酶互作,并且通過(guò)抑制其磷酸化正向調(diào)控BR信號(hào),從而影響籽粒形狀;另外,GW5L還可以參與鈣調(diào)素蛋白OsCaM1-1介導(dǎo)的抗鹽反應(yīng)。本研究對(duì)GW5L基因的結(jié)構(gòu)與功能等做了研究與分析,主要結(jié)論如下。1.采用同源克隆方式,以GW5編碼的蛋白序列為參照在水稻基因組中克隆了GW5L基因。由于所編碼蛋白結(jié)構(gòu)高度一致,推測(cè)GW5L和GW5有相似的生物學(xué)功能。轉(zhuǎn)基因?qū)嶒?yàn)發(fā)現(xiàn),GW5L過(guò)表達(dá)植株表現(xiàn)出典型的BR過(guò)量表型,包括植株變矮、葉夾角變大、籽粒變細(xì)長(zhǎng)等;GW5L敲除家系出現(xiàn)籽粒變寬變短的表型。因此,GW5L是一個(gè)粒寬的負(fù)調(diào)控因子。2.BR是重要的植物激素,在水稻中發(fā)揮著重要功能。葉夾角BR敏感性實(shí)驗(yàn)證明,GW5L過(guò)表達(dá)家系的表型是由于BR信號(hào)的增強(qiáng)引起的。GW5L過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株的qRT-PCR分析顯示,D2、D11、Dwarf4等具有反饋調(diào)節(jié)效應(yīng)的BR合成基因在GW5L過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)基因植株中的表達(dá)有所下降。因此,推斷GW5L通過(guò)BR信號(hào)途徑影響粒型形成。3.為驗(yàn)證GW5L是否與GW5的互作蛋白GSK2互作,進(jìn)行了酵母雙雜、雙分子熒光互補(bǔ)(BiFC)以及體外Pull-down實(shí)驗(yàn),結(jié)果證實(shí)GW5L與GSK2確實(shí)存在互作關(guān)系。體外磷酸化實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證明GW5L可以抑制GSK2自身磷酸化及磷酸化下游BZR1轉(zhuǎn)錄因子,并確定了GW5L在BR信號(hào)網(wǎng)絡(luò)中的位置。GW5L通過(guò)抑制下游蛋白激酶GSK2的功能來(lái)調(diào)控BR信號(hào)傳遞,最終影響籽粒大小。4.酵母雙雜交和BiFC實(shí)驗(yàn)均證實(shí)GW5L與鈣調(diào)素蛋白OsCaM1-1互作,而OsCam1-1參與ABA介導(dǎo)的鹽脅迫抗性,據(jù)此推測(cè)GW5L與水稻抗鹽性相關(guān)。鹽脅迫處理實(shí)驗(yàn)顯示,GW5L過(guò)表達(dá)家系對(duì)鹽脅迫更加敏感。qRT-PCR結(jié)果顯示GW5L過(guò)表達(dá)家系鹽敏感度的提高是由于OsCam1-1的表達(dá)量下降引起。GW5L與OsCam1-1介導(dǎo)的鹽脅迫抗性有關(guān),為揭示IQ蛋白與鹽脅迫的關(guān)系提供了線索。5.GW5L與GW5具有相似的蛋白結(jié)構(gòu)和生化功能,但基因表達(dá)模式存在差異。與GW5在穗部高表達(dá)相比,GW5L在被檢測(cè)的各器官中表達(dá)水平均較高。這暗示著二者很可能在不同的組織中調(diào)控不同代謝途徑。
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:S511
【圖文】:

示意圖,水稻籽粒,途徑,細(xì)胞伸長(zhǎng)


中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院博士學(xué)位論文 第一章 引言3圖1.1 調(diào)控水稻籽粒大小關(guān)鍵基因調(diào)控模式圖(Li et al., 2018)。Figure 1.1 A schematic representation illustrating major regulatory genes that control seed size.水稻的籽粒大小是由水稻小穗穎殼中細(xì)胞的分裂與伸長(zhǎng)調(diào)控。調(diào)控水稻籽粒大小的代謝途徑有:泛素蛋白酶體途徑(UPS)、G 蛋白途徑、MAPK 途徑、植物激素途徑、轉(zhuǎn)錄因子途徑等。圖中正向調(diào)控因子與反向調(diào)控因子分別用紅色與綠色表示。調(diào)控細(xì)胞增殖的元件位于示意圖左側(cè),用綠色分開;調(diào)控細(xì)胞伸長(zhǎng)的位于示意圖右側(cè),用黃色虛線分開;那些既調(diào)控細(xì)胞增殖又調(diào)控細(xì)胞伸長(zhǎng)的元件位于綠色與黃色虛線之間。星號(hào)表示該元件的調(diào)控模式?jīng)]有得到準(zhǔn)確的驗(yàn)證。標(biāo)尺=1 mm。The grain size of rice is regulated by cell proliferation and cell expansion in the glume of rice spikelets. The metabolic pathways regulatingrice grain size include: ubiquitin-proteasome (UPS) pathway, G-protein signaling, MAPK signaling, phytohormones and transcriptionalregulatoryfactors. The positive and negative regulators in the figure are shown in red and green respectively. The originals that regulate cellproliferation are located on the left side of the diagram, separated by green dotted lines; the cells that regulate cell elongation are on the right sideof the diagram, separated by yellow dotted lines; those that regulate cell proliferation and regulate cell elongation are located between green andyellow dashed lines. The asterisk indicates that the original control mode has not been accurately verified

模型圖,籽粒大小,模型


生物體生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中,經(jīng)常需要自行降解一些無(wú)用蛋白或需要調(diào)節(jié)的蛋白,以實(shí)現(xiàn)對(duì)特的生命活動(dòng)的精確調(diào)控,從而有效調(diào)節(jié)蛋白的生命周轉(zhuǎn),循環(huán)利用生命原料。泛素化是細(xì)胞內(nèi)種特異性的修飾,可以作為一種標(biāo)簽將被選擇降解的蛋白標(biāo)記,該過(guò)程涉及泛素、啟動(dòng)酶系統(tǒng)(E1、E2 和 E3)以及蛋白酶體系統(tǒng)(Pickart and Eddins, 2004)。最近的研究證明泛素降解途徑在稻粒型調(diào)控中也發(fā)揮著重要作用,目前已克隆的泛素依賴性蛋白降解途徑水稻粒型調(diào)控基因包GW2、TUD1、HGW 等。GW2 (GRAINWIDTH 2)是一個(gè)控制粒寬及粒重的主效 QTL,位于第 2 號(hào)染色體。Song 等(20年)利用由大粒粳稻品種 WY3 和小粒秈稻品種豐矮占 1 號(hào)構(gòu)建的遺傳群體圖位克隆到該基因GW2 編碼一個(gè) E3 泛素連接酶,通過(guò)參與細(xì)胞分裂相關(guān)蛋白的泛素化降解過(guò)程,從而影響水稻殼細(xì)胞分裂,調(diào)控水稻籽粒大。▓D 1.2)。GW2 功能缺失導(dǎo)致籽粒變寬,但不影響胚乳細(xì)胞數(shù)目只是導(dǎo)致胚乳細(xì)胞變大,這說(shuō)明 GW2 通過(guò)不同的機(jī)制控制穎殼及胚乳的發(fā)育。gw2 在增加穎大小的同時(shí)提高灌漿速率和干物質(zhì)積累,因此對(duì)稻米品質(zhì)的影響不大,不會(huì)導(dǎo)致高堊白等負(fù)面狀,在優(yōu)良稻米品種選育中具有較高的利用價(jià)值(Song et al., 2007)。

細(xì)胞伸長(zhǎng)


該基因表達(dá)產(chǎn)物定位在細(xì)胞核中,并且其表達(dá)受到生長(zhǎng)素的調(diào)節(jié)。SMOS1 可細(xì)胞擴(kuò)增相關(guān)基因 OsPHI-1 的啟動(dòng)子并調(diào)控其表達(dá)(Aya et al.,2014)。最近有報(bào)道證明,SM與 BR 信號(hào)途徑傳導(dǎo)蛋白 DLT 互作,并且二者同時(shí)存在時(shí)可促進(jìn)下游基因 OsPHI-1 的表達(dá),SMOS1 與 DLT 形成了一個(gè)關(guān)鍵復(fù)合體,共同響應(yīng)水稻中生長(zhǎng)素與 BR 信號(hào),為解釋水同激素的信號(hào)交聯(lián)提供了依據(jù)(Hirano et al., 2017)。GL4 是非洲稻中一個(gè)調(diào)控粒型的主效基因,可通過(guò)調(diào)控外稃與Qg稃中細(xì)胞大小來(lái)影響籽小。GL4 不僅影響籽粒的大小,同時(shí)又影響落粒性,這一點(diǎn)與其在亞洲稻中的同源基因 同。GL4 與 SH4 編碼區(qū)中一個(gè) SNP 導(dǎo)致翻譯的提前終止,最終導(dǎo)致了小粒與落粒性增強(qiáng)。GL4 的克隆為研究非洲稻的馴化奠定了基礎(chǔ),同時(shí)為水稻優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)育種提供了新的材料(W, 2017)。OsBUL1 (BRASSINOSTEROID UPREGULATED 1-LIKE1) 編 碼 一 個(gè) 非 典 型 的 Helix-loop-helix)類轉(zhuǎn)錄因子,其表達(dá)量受 BL 的誘導(dǎo),功能缺失后會(huì)出現(xiàn)葉夾角減小,籽粒表型。OsBUL1 可以與未知蛋白 LO9-177 以及另一個(gè) bHLH (basic helix-loop-helix)蛋白 Os成轉(zhuǎn)錄復(fù)合體,共同調(diào)控細(xì)胞的伸長(zhǎng)以及籽粒的大。▓D 1.4)。同時(shí),OsBC1 的表達(dá)也 的誘導(dǎo)且功能缺失后出現(xiàn)與 OsBUL1 突變類似的表型。OsBUL1 與 OsBC1 的克隆對(duì)于H-bHLH 復(fù)合體代謝及其調(diào)控細(xì)胞伸長(zhǎng)、籽粒大小的分子機(jī)理打下了基礎(chǔ)(Jang et al., 2017

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